More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_A25 on replicon NC_008496
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  100 
 
 
510 aa  1008    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  45.87 
 
 
516 aa  395  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  44.11 
 
 
510 aa  381  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  44.17 
 
 
487 aa  365  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  42.8 
 
 
534 aa  357  2.9999999999999997e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  41.04 
 
 
526 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  43.7 
 
 
512 aa  334  2e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  40.4 
 
 
523 aa  323  4e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  40.4 
 
 
523 aa  323  4e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  39.84 
 
 
512 aa  317  2e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  39.73 
 
 
519 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  39.5 
 
 
519 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  38.68 
 
 
518 aa  306  5.0000000000000004e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  32.47 
 
 
528 aa  291  2e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  42.41 
 
 
457 aa  290  5.0000000000000004e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  33.93 
 
 
563 aa  286  7e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  40.15 
 
 
445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  34.38 
 
 
538 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1346  chloride channel protein  35.97 
 
 
527 aa  264  2e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  34.29 
 
 
528 aa  259  6e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  37.67 
 
 
539 aa  229  6e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  34.51 
 
 
533 aa  220  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0118  chloride transporter, ClC family  36.9 
 
 
455 aa  217  4e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  32.38 
 
 
473 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  32.16 
 
 
473 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  32.16 
 
 
473 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  32.16 
 
 
473 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  32.16 
 
 
473 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  35.88 
 
 
456 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  33.18 
 
 
471 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  30.73 
 
 
463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  34.65 
 
 
428 aa  199  7e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  32 
 
 
479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  31.67 
 
 
466 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  35.31 
 
 
435 aa  182  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  35.31 
 
 
466 aa  180  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  29.09 
 
 
478 aa  179  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  29.09 
 
 
478 aa  179  8e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  29.3 
 
 
478 aa  179  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.91 
 
 
437 aa  171  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  33.33 
 
 
470 aa  169  8e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  33.81 
 
 
427 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.75 
 
 
439 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.32 
 
 
443 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  33.57 
 
 
427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  32.33 
 
 
468 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.06 
 
 
439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.06 
 
 
439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  31.06 
 
 
439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0318  Chloride channel core  32.3 
 
 
511 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  32.41 
 
 
467 aa  160  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  31.15 
 
 
472 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  30.98 
 
 
473 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  30.98 
 
 
473 aa  156  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  30.98 
 
 
473 aa  156  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  30.98 
 
 
473 aa  156  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  30.98 
 
 
473 aa  156  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  30.98 
 
 
473 aa  156  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  30.98 
 
 
473 aa  156  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  30.98 
 
 
473 aa  156  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  30.98 
 
 
473 aa  156  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  31.44 
 
 
455 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  34.25 
 
 
455 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  32.3 
 
 
859 aa  155  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2460  chloride channel core  33.88 
 
 
459 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11718  normal  0.460638 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  31.59 
 
 
455 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  32.71 
 
 
436 aa  154  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  31.98 
 
 
863 aa  149  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  31.72 
 
 
455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06233  chloride channel protein  31.93 
 
 
468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  33.52 
 
 
862 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  31.99 
 
 
569 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  26.13 
 
 
416 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  30.45 
 
 
879 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  30.45 
 
 
879 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.56 
 
 
579 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.56 
 
 
636 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.56 
 
 
579 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.56 
 
 
579 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.27 
 
 
628 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  29.45 
 
 
875 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  28.85 
 
 
584 aa  126  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  30.61 
 
 
897 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.41 
 
 
591 aa  124  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  32.59 
 
 
863 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.03 
 
 
598 aa  123  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  32.09 
 
 
444 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.86 
 
 
589 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.91 
 
 
593 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  27.68 
 
 
602 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  27.03 
 
 
559 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.61 
 
 
593 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.58 
 
 
589 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.58 
 
 
589 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.3 
 
 
577 aa  120  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  29.75 
 
 
626 aa  119  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.93 
 
 
589 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3746  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.32 
 
 
414 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  28.47 
 
 
598 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  26.55 
 
 
633 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>