More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0165 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  99.79 
 
 
473 aa  939    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  99.79 
 
 
473 aa  939    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  100 
 
 
473 aa  939    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  75.6 
 
 
466 aa  676    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  78.65 
 
 
473 aa  731    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  99.79 
 
 
473 aa  939    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  99.37 
 
 
473 aa  934    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  78.65 
 
 
473 aa  731    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  100 
 
 
473 aa  939    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  99.79 
 
 
473 aa  939    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  78.22 
 
 
473 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  78.65 
 
 
473 aa  731    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  78.22 
 
 
473 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  99.79 
 
 
473 aa  939    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  99.58 
 
 
473 aa  938    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  69.48 
 
 
479 aa  627  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  70.4 
 
 
478 aa  605  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  70.4 
 
 
478 aa  605  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  70.4 
 
 
478 aa  605  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  65.45 
 
 
471 aa  580  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  66.07 
 
 
472 aa  529  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  55.66 
 
 
468 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  56.11 
 
 
467 aa  431  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06233  chloride channel protein  55.41 
 
 
468 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  46.41 
 
 
470 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  45.2 
 
 
466 aa  355  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  40.18 
 
 
463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  41.23 
 
 
456 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  41.18 
 
 
427 aa  275  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  39.29 
 
 
427 aa  272  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  43.27 
 
 
455 aa  246  8e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  42.86 
 
 
455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  43.13 
 
 
455 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  38.07 
 
 
533 aa  227  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  33.59 
 
 
519 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2460  chloride channel core  38.77 
 
 
459 aa  201  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11718  normal  0.460638 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  33.59 
 
 
519 aa  199  6e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  30.43 
 
 
510 aa  195  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  38.52 
 
 
436 aa  190  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  39.12 
 
 
539 aa  185  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  37.7 
 
 
435 aa  182  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  37.42 
 
 
455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  32.17 
 
 
528 aa  176  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  31.64 
 
 
512 aa  176  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.41 
 
 
437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  33 
 
 
523 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  32.1 
 
 
569 aa  173  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  33.67 
 
 
523 aa  174  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  30.6 
 
 
563 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.55 
 
 
526 aa  167  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.44 
 
 
439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  34.57 
 
 
615 aa  166  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  34.93 
 
 
859 aa  166  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  33.33 
 
 
510 aa  164  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  29.87 
 
 
534 aa  162  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  32.41 
 
 
516 aa  161  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  33.09 
 
 
487 aa  162  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.52 
 
 
439 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  33.52 
 
 
439 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.52 
 
 
439 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  31.36 
 
 
428 aa  157  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0118  chloride transporter, ClC family  33.26 
 
 
455 aa  157  6e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  33.11 
 
 
863 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  29.22 
 
 
538 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  29.52 
 
 
457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  29.28 
 
 
528 aa  154  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  29.72 
 
 
614 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  27.82 
 
 
470 aa  150  6e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  34.27 
 
 
597 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  30.84 
 
 
512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  32.87 
 
 
862 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.97 
 
 
443 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.81 
 
 
587 aa  143  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  32.78 
 
 
613 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1346  chloride channel protein  33.6 
 
 
527 aa  140  6e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  32.58 
 
 
600 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  28.99 
 
 
627 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  33.94 
 
 
608 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  32.06 
 
 
606 aa  137  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1794  putative chloride channel  29.28 
 
 
452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  31.52 
 
 
875 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  29.74 
 
 
518 aa  134  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  27.66 
 
 
631 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19111  putative chloride channel  29.5 
 
 
452 aa  134  5e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  28.93 
 
 
445 aa  133  7.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18921  putative chloride channel  29.5 
 
 
452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.708029  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  30.05 
 
 
462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  29.52 
 
 
626 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.22 
 
 
598 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  30.34 
 
 
584 aa  129  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  30.16 
 
 
453 aa  129  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  32.93 
 
 
879 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  32.93 
 
 
879 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18921  putative chloride channel  30.09 
 
 
452 aa  126  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  31.89 
 
 
897 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.53 
 
 
589 aa  123  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.97 
 
 
580 aa  123  7e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  34.34 
 
 
669 aa  123  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.89 
 
 
591 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.64 
 
 
593 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>