More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2293 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  99.83 
 
 
579 aa  1157    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  76.66 
 
 
577 aa  873    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  99.83 
 
 
579 aa  1157    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  77.15 
 
 
591 aa  866    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  83.28 
 
 
589 aa  931    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  100 
 
 
636 aa  1271    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  81.82 
 
 
598 aa  986    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  99.83 
 
 
579 aa  1157    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  95.54 
 
 
628 aa  1176    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  76.46 
 
 
591 aa  882    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  83.3 
 
 
593 aa  968    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  82.79 
 
 
589 aa  953    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  83.13 
 
 
593 aa  967    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  83.13 
 
 
589 aa  956    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  82.79 
 
 
589 aa  953    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  55.58 
 
 
464 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  55.58 
 
 
464 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  54.34 
 
 
461 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  45.24 
 
 
591 aa  426  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  52.85 
 
 
471 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.10029 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  34.75 
 
 
615 aa  293  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  36.03 
 
 
596 aa  286  1.0000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  37.16 
 
 
560 aa  281  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  31.8 
 
 
595 aa  280  6e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  32.06 
 
 
614 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0516  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  36.94 
 
 
601 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  31.54 
 
 
613 aa  258  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  32.35 
 
 
608 aa  257  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.91 
 
 
582 aa  253  8.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  44.07 
 
 
426 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  29.66 
 
 
631 aa  244  3e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  44.09 
 
 
414 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  42.07 
 
 
426 aa  241  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  31.79 
 
 
627 aa  239  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3746  Cl- channel, voltage-gated family protein  41.5 
 
 
414 aa  238  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  35.6 
 
 
626 aa  233  9e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  31.55 
 
 
597 aa  226  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  33.26 
 
 
470 aa  226  1e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.17 
 
 
620 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  29.98 
 
 
627 aa  223  6e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  31.64 
 
 
577 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  30.92 
 
 
624 aa  221  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  30.81 
 
 
628 aa  220  5e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  35.6 
 
 
456 aa  217  5e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  29.66 
 
 
669 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  30.69 
 
 
569 aa  206  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  31.29 
 
 
584 aa  206  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1592  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  40.14 
 
 
429 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0733959 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1666  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  39 
 
 
418 aa  203  9e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2051  Chloride channel core  38.95 
 
 
418 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1607  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  39 
 
 
418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01561  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  39 
 
 
418 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2038  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  39 
 
 
418 aa  201  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1800  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  39 
 
 
418 aa  201  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01551  hypothetical protein  39 
 
 
418 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2303  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  39 
 
 
418 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0264865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  32.47 
 
 
600 aa  200  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  29.44 
 
 
625 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1779  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  38.52 
 
 
418 aa  197  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1601  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  40.38 
 
 
429 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.262233  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1660  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  40.38 
 
 
429 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1682  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  40.38 
 
 
429 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.669275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  32.88 
 
 
590 aa  195  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1849  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  40.14 
 
 
417 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  26.27 
 
 
603 aa  190  8e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  27.85 
 
 
606 aa  189  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  31.45 
 
 
402 aa  187  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  33.66 
 
 
579 aa  187  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  26.72 
 
 
598 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  31.85 
 
 
593 aa  183  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  27.71 
 
 
602 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  31.41 
 
 
543 aa  179  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  33.78 
 
 
575 aa  178  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1534  Cl- channel, voltage gated  32.22 
 
 
527 aa  178  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.123029  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  28.06 
 
 
613 aa  177  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.33 
 
 
587 aa  177  7e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2526  Chloride channel core  34.19 
 
 
589 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  31.67 
 
 
564 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2439  chloride channel core protein  34.06 
 
 
589 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590865  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0525  Cl- channel voltage-gated family protein  27.64 
 
 
579 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  31.5 
 
 
640 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  26.33 
 
 
617 aa  170  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  33.54 
 
 
586 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.62 
 
 
575 aa  169  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.61 
 
 
580 aa  169  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.52 
 
 
612 aa  168  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  27.26 
 
 
859 aa  167  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0490  voltage gated chloride channel family protein  28.55 
 
 
596 aa  165  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.889673  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2144  Cl- channel voltage-gated family protein  28.22 
 
 
604 aa  163  7e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  29.85 
 
 
605 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  31.05 
 
 
562 aa  163  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.29 
 
 
591 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  29.28 
 
 
862 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.84 
 
 
565 aa  162  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  30.56 
 
 
629 aa  161  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  28.6 
 
 
863 aa  159  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  27.89 
 
 
582 aa  156  9e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  25.93 
 
 
598 aa  155  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2161  chloride channel protein  27.7 
 
 
594 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  28.9 
 
 
863 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>