More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3504 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  65.89 
 
 		 603 aa  783    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2971  Chloride channel core  58.97 
 
 		 605 aa  664    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  100 
 
 		 602 aa  1217    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  69.59 
 
 		 605 aa  804    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2485  Cl- channel, voltage-gated family protein  70.32 
 
 		 603 aa  804    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  45.38 
 
 		 612 aa  463  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  42.56 
 
 		 606 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.86 
 
 		 580 aa  367  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  37.03 
 
 		 625 aa  351  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  37.05 
 
 		 605 aa  350  6e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  38.16 
 
 		 651 aa  342  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.9 
 
 		 754 aa  333  5e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  36.07 
 
 		 598 aa  325  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  35.24 
 
 		 586 aa  301  2e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  36.7 
 
 		 462 aa  288  2.9999999999999996e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1431  Chloride channel core  35.23 
 
 		 605 aa  287  2.9999999999999996e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.78 
 
 		 582 aa  272  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.52 
 
 		 612 aa  271  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  32.55 
 
 		 582 aa  268  2e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0357  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.56 
 
 		 588 aa  256  7e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  33.84 
 
 		 457 aa  256  7e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  29.67 
 
 		 614 aa  250  6e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.27 
 
 		 582 aa  248  2e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  33.97 
 
 		 608 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  30.97 
 
 		 613 aa  229  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  31.86 
 
 		 615 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1039  Chloride channel core  36.95 
 
 		 453 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  28.22 
 
 		 631 aa  208  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  30.96 
 
 		 597 aa  201  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2595  Cl- channel, voltage gated  37.6 
 
 		 544 aa  200  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4857  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  34.12 
 
 		 470 aa  200  5e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  31.45 
 
 		 627 aa  200  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  29.76 
 
 		 669 aa  200  7.999999999999999e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  32.98 
 
 		 577 aa  198  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.02 
 
 		 620 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10144  transmembrane protein  34.45 
 
 		 492 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  28.26 
 
 		 569 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  31.65 
 
 		 627 aa  193  6e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  30.2 
 
 		 628 aa  192  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2388  chloride channel core  34.34 
 
 		 650 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360488 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.78 
 
 		 594 aa  188  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2728  Chloride channel core  29.71 
 
 		 474 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.969759  hitchhiker  0.00000000119016 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3129  voltage-gated chloride channel  29.71 
 
 		 467 aa  180  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.831797  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  31.83 
 
 		 626 aa  179  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  28.64 
 
 		 584 aa  178  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.81 
 
 		 591 aa  178  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  29.74 
 
 		 593 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  29.19 
 
 		 624 aa  174  5e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1241  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.18 
 
 		 428 aa  174  5.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.730218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  29.69 
 
 		 600 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.71 
 
 		 628 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  26.21 
 
 		 617 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.33 
 
 		 591 aa  168  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.18 
 
 		 577 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.33 
 
 		 598 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.64 
 
 		 579 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.64 
 
 		 579 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.64 
 
 		 579 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.64 
 
 		 636 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  28.93 
 
 		 590 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  25.92 
 
 		 603 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.87 
 
 		 598 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  24.92 
 
 		 613 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27 
 
 		 589 aa  160  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  25.73 
 
 		 598 aa  159  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.39 
 
 		 591 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  26.81 
 
 		 629 aa  159  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.96 
 
 		 593 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.21 
 
 		 575 aa  158  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.79 
 
 		 593 aa  157  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  35.4 
 
 		 402 aa  153  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.03 
 
 		 587 aa  152  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  31.2 
 
 		 533 aa  151  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.33 
 
 		 589 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0525  Cl- channel voltage-gated family protein  25.1 
 
 		 579 aa  150  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.33 
 
 		 589 aa  150  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.33 
 
 		 589 aa  150  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  38.6 
 
 		 638 aa  150  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  26.91 
 
 		 863 aa  149  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0552  Chloride channel core  26.49 
 
 		 614 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  39.04 
 
 		 612 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  39.04 
 
 		 634 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  26.04 
 
 		 585 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  26.46 
 
 		 579 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  26.12 
 
 		 640 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  28.14 
 
 		 603 aa  142  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.99 
 
 		 565 aa  140  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.89 
 
 		 591 aa  139  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2552  Chloride channel core  31.85 
 
 		 531 aa  139  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  27.08 
 
 		 604 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  28.3 
 
 		 434 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  27.92 
 
 		 429 aa  137  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  25.39 
 
 		 633 aa  137  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2094  Chloride channel core  28.75 
 
 		 603 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2520  Chloride channel core  25.54 
 
 		 594 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  29.63 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  31.68 
 
 		 456 aa  135  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  29.01 
 
 		 519 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  25.65 
 
 		 859 aa  132  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3157  CBS domain-containing protein  27.53 
 
 		 593 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.687522  normal  0.772709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>