More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0118 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0118  chloride transporter, ClC family  100 
 
 		 455 aa  910    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1346  chloride channel protein  64.2 
 
 		 527 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  39.95 
 
 		 526 aa  274  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  37.64 
 
 		 523 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  37.42 
 
 		 523 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  36.9 
 
 		 510 aa  257  4e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  35.02 
 
 		 519 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  35.03 
 
 		 519 aa  240  4e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  35.73 
 
 		 518 aa  229  5e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  36.49 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  35.53 
 
 		 510 aa  223  6e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  31.72 
 
 		 528 aa  217  2.9999999999999998e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  32.96 
 
 		 538 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  33.25 
 
 		 516 aa  215  9.999999999999999e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  31.92 
 
 		 563 aa  210  5e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  31.15 
 
 		 534 aa  205  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  34.4 
 
 		 512 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  33.56 
 
 		 473 aa  197  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  33.56 
 
 		 473 aa  197  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  33.56 
 
 		 473 aa  197  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  31.88 
 
 		 528 aa  195  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  33.33 
 
 		 473 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  34.55 
 
 		 487 aa  194  3e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  33.11 
 
 		 473 aa  193  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  34.43 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  35.4 
 
 		 471 aa  179  9e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  32.55 
 
 		 533 aa  178  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  34.62 
 
 		 466 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  30 
 
 		 445 aa  176  9e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  31.88 
 
 		 479 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  31.49 
 
 		 478 aa  170  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  31.49 
 
 		 478 aa  170  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  31.49 
 
 		 478 aa  170  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  34.47 
 
 		 473 aa  161  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  33.51 
 
 		 539 aa  161  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  34.16 
 
 		 473 aa  160  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  34.47 
 
 		 473 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  34.47 
 
 		 473 aa  160  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  34.25 
 
 		 473 aa  160  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  34.25 
 
 		 473 aa  160  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  34.47 
 
 		 473 aa  160  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  34.47 
 
 		 473 aa  160  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  34.47 
 
 		 473 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  30.31 
 
 		 456 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  30.77 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  32.75 
 
 		 468 aa  156  7e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  31.48 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.79 
 
 		 437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  32.71 
 
 		 472 aa  153  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  32.9 
 
 		 470 aa  151  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  33.1 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  31.87 
 
 		 463 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06233  chloride channel protein  30.47 
 
 		 468 aa  146  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  32.96 
 
 		 435 aa  144  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  30.29 
 
 		 455 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0318  Chloride channel core  31.92 
 
 		 511 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  30.04 
 
 		 466 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  30.12 
 
 		 455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  27.23 
 
 		 416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  29.72 
 
 		 455 aa  137  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  30.13 
 
 		 569 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  31.84 
 
 		 427 aa  129  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  31.22 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2460  chloride channel core  34.35 
 
 		 459 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11718  normal  0.460638 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.79 
 
 		 587 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  35.89 
 
 		 455 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.93 
 
 		 443 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.73 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.37 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.73 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  28.73 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  30.99 
 
 		 859 aa  114  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  29.88 
 
 		 468 aa  110  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.06 
 
 		 436 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  31.52 
 
 		 897 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  30.05 
 
 		 626 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  28.39 
 
 		 585 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  29.95 
 
 		 600 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  26.44 
 
 		 559 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  27.42 
 
 		 863 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  29.31 
 
 		 862 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.63 
 
 		 591 aa  100  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.08 
 
 		 598 aa  99.8  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  31.53 
 
 		 435 aa  99.8  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  31.53 
 
 		 435 aa  99.8  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  30.02 
 
 		 440 aa  99.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4920  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.25 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.81 
 
 		 577 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.79 
 
 		 454 aa  97.8  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  30.61 
 
 		 439 aa  97.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  30.32 
 
 		 474 aa  97.1  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  25.76 
 
 		 453 aa  97.1  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  30.34 
 
 		 563 aa  96.7  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.11 
 
 		 521 aa  96.7  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5286  Chloride channel core  25.12 
 
 		 431 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  31.36 
 
 		 435 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  29.74 
 
 		 597 aa  95.1  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.1 
 
 		 591 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  31.64 
 
 		 520 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  31.5 
 
 		 518 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>