More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5126 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  86.59 
 
 
455 aa  698    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  87.25 
 
 
455 aa  702    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  100 
 
 
455 aa  881    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2460  chloride channel core  48.98 
 
 
459 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11718  normal  0.460638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  41.18 
 
 
473 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  41.18 
 
 
473 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  41.18 
 
 
473 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  40.95 
 
 
473 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  41.31 
 
 
473 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  40.83 
 
 
466 aa  290  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  41.78 
 
 
479 aa  284  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  42.2 
 
 
468 aa  279  6e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  41.97 
 
 
471 aa  278  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  40.94 
 
 
478 aa  278  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  40.94 
 
 
478 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  40.94 
 
 
478 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  39.37 
 
 
463 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  41.4 
 
 
470 aa  257  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  40.46 
 
 
467 aa  250  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  39.95 
 
 
472 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  40 
 
 
473 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  40 
 
 
473 aa  243  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  40 
 
 
473 aa  244  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  40 
 
 
473 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  40 
 
 
473 aa  244  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  40 
 
 
473 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  40 
 
 
473 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  40 
 
 
473 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06233  chloride channel protein  41 
 
 
468 aa  241  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  38.46 
 
 
427 aa  240  4e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  39.55 
 
 
473 aa  240  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  38.7 
 
 
427 aa  238  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  37.65 
 
 
456 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  38.43 
 
 
533 aa  227  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  40.82 
 
 
466 aa  220  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  32.8 
 
 
519 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  33.06 
 
 
519 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  37.5 
 
 
435 aa  196  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.86 
 
 
439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  33.86 
 
 
439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.86 
 
 
439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.66 
 
 
437 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.16 
 
 
443 aa  180  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  31.57 
 
 
510 aa  180  5.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  39.08 
 
 
539 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.06 
 
 
526 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  37.97 
 
 
455 aa  177  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  36.13 
 
 
436 aa  176  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  32.54 
 
 
523 aa  171  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  32.54 
 
 
523 aa  169  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.29 
 
 
439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  32.97 
 
 
512 aa  159  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  27.69 
 
 
563 aa  152  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  30.26 
 
 
528 aa  152  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  31.65 
 
 
457 aa  151  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  29.38 
 
 
538 aa  150  6e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  30.79 
 
 
512 aa  143  6e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  34.17 
 
 
626 aa  143  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  29.38 
 
 
534 aa  142  9e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  31.05 
 
 
569 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  30.52 
 
 
510 aa  141  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  27.86 
 
 
516 aa  141  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  30.15 
 
 
487 aa  138  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  30.08 
 
 
859 aa  137  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1346  chloride channel protein  31.05 
 
 
527 aa  135  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0118  chloride transporter, ClC family  31.44 
 
 
455 aa  134  5e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  27.74 
 
 
614 aa  133  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  34.08 
 
 
600 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  30.73 
 
 
863 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  31.17 
 
 
518 aa  131  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  27.93 
 
 
445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  32.49 
 
 
863 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  31.64 
 
 
597 aa  126  7e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  31.86 
 
 
862 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  31.33 
 
 
615 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.59 
 
 
587 aa  125  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  27.49 
 
 
613 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  31.39 
 
 
875 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3300  Cl- channel, voltage gated  32.69 
 
 
585 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0616826  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  25.84 
 
 
428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18921  putative chloride channel  27.93 
 
 
452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.708029  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  32.6 
 
 
897 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  27.73 
 
 
470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1794  putative chloride channel  27.83 
 
 
452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  30.79 
 
 
402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.35 
 
 
582 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19111  putative chloride channel  27.53 
 
 
452 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18921  putative chloride channel  27.53 
 
 
452 aa  110  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.41 
 
 
754 aa  109  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18351  putative chloride channel  28.9 
 
 
452 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  25.34 
 
 
606 aa  107  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  31.71 
 
 
629 aa  107  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  26.79 
 
 
559 aa  107  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  28.57 
 
 
528 aa  106  9e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  27.5 
 
 
627 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0318  Chloride channel core  29.95 
 
 
511 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.53 
 
 
591 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.85 
 
 
436 aa  104  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  28.5 
 
 
584 aa  104  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.18 
 
 
591 aa  104  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>