More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2509 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  100 
 
 		 455 aa  875    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  48.09 
 
 		 533 aa  338  9.999999999999999e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  50.23 
 
 		 436 aa  271  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  43.6 
 
 		 463 aa  261  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  38.3 
 
 		 456 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  38.76 
 
 		 427 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  39 
 
 		 427 aa  241  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  39.37 
 
 		 468 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  38.62 
 
 		 473 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  38.62 
 
 		 473 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  38.62 
 
 		 473 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  38.39 
 
 		 473 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  38.39 
 
 		 473 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  40.93 
 
 		 471 aa  227  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  42.59 
 
 		 467 aa  226  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  44.9 
 
 		 539 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  36.18 
 
 		 466 aa  223  6e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  37.16 
 
 		 479 aa  223  7e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  38.34 
 
 		 470 aa  219  8.999999999999998e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.35 
 
 		 526 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  39.78 
 
 		 466 aa  215  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  37.3 
 
 		 478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  37.3 
 
 		 478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  37.3 
 
 		 478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  33.56 
 
 		 563 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  34.39 
 
 		 569 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  32.12 
 
 		 510 aa  210  4e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06233  chloride channel protein  41.24 
 
 		 468 aa  207  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  41.99 
 
 		 435 aa  205  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  38.95 
 
 		 455 aa  202  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  38.73 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  38.73 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  38.73 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  38.73 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  38.3 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  38.73 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  38.73 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  38.73 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  38.73 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  38.5 
 
 		 473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  38.34 
 
 		 472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  38.21 
 
 		 455 aa  199  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  35.31 
 
 		 519 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  36.26 
 
 		 512 aa  193  5e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  34.97 
 
 		 519 aa  193  6e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  39.67 
 
 		 443 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  38.83 
 
 		 859 aa  189  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.97 
 
 		 437 aa  188  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  36.57 
 
 		 863 aa  185  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.67 
 
 		 439 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  37.67 
 
 		 439 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.67 
 
 		 439 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  40.11 
 
 		 862 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  38.01 
 
 		 523 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  37.76 
 
 		 523 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2460  chloride channel core  39.86 
 
 		 459 aa  180  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11718  normal  0.460638 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  28.8 
 
 		 538 aa  177  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  32.63 
 
 		 528 aa  177  3e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  32.53 
 
 		 510 aa  176  9e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.13 
 
 		 439 aa  173  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  35.93 
 
 		 897 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  31.85 
 
 		 518 aa  167  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  34.99 
 
 		 512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  33.56 
 
 		 875 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  35.77 
 
 		 487 aa  160  3e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  31.54 
 
 		 534 aa  157  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  29.97 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  32.12 
 
 		 457 aa  151  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  39.6 
 
 		 859 aa  150  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  31.63 
 
 		 516 aa  150  7e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  34.68 
 
 		 863 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  31.46 
 
 		 615 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  30.57 
 
 		 606 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1346  chloride channel protein  36.93 
 
 		 527 aa  145  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  32.75 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  32.24 
 
 		 584 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  31 
 
 		 582 aa  139  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  33.33 
 
 		 626 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  34.06 
 
 		 629 aa  138  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  29.49 
 
 		 445 aa  137  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0118  chloride transporter, ClC family  32.21 
 
 		 455 aa  136  9e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  32.31 
 
 		 600 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  33.41 
 
 		 879 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  33.41 
 
 		 879 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29991  putative chloride channel  30.82 
 
 		 450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.593355 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18921  putative chloride channel  30.44 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18921  putative chloride channel  29.56 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.708029  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  30.18 
 
 		 453 aa  131  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  33.8 
 
 		 597 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  30.18 
 
 		 614 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.77 
 
 		 598 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1794  putative chloride channel  30.07 
 
 		 452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.68 
 
 		 587 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18351  putative chloride channel  30.72 
 
 		 452 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  30.05 
 
 		 462 aa  127  4.0000000000000003e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.9 
 
 		 580 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  30.8 
 
 		 470 aa  127  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.6 
 
 		 577 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.09 
 
 		 589 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  31.6 
 
 		 613 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>