More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1620 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  100 
 
 
606 aa  1211    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  45.64 
 
 
605 aa  449  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  42.88 
 
 
602 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  41.3 
 
 
580 aa  424  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  40.76 
 
 
598 aa  416  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  41.25 
 
 
603 aa  415  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  43.51 
 
 
612 aa  402  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  42.01 
 
 
625 aa  395  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  42.96 
 
 
651 aa  391  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2485  Cl- channel, voltage-gated family protein  42.11 
 
 
603 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  40.88 
 
 
605 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.23 
 
 
754 aa  374  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2971  Chloride channel core  42.47 
 
 
605 aa  360  5e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  38.03 
 
 
586 aa  333  5e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  42.89 
 
 
462 aa  327  3e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  37.37 
 
 
615 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  40.45 
 
 
612 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  36.9 
 
 
582 aa  313  5.999999999999999e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2595  Cl- channel, voltage gated  40.72 
 
 
544 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4857  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  41.2 
 
 
457 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.75 
 
 
582 aa  300  8e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1431  Chloride channel core  38.49 
 
 
605 aa  295  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0357  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.96 
 
 
588 aa  284  3.0000000000000004e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  34.23 
 
 
669 aa  280  6e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.18 
 
 
582 aa  276  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  34.5 
 
 
608 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  32.29 
 
 
614 aa  270  8e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  32.93 
 
 
613 aa  264  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1039  Chloride channel core  42.76 
 
 
453 aa  261  2e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  40.98 
 
 
587 aa  254  3e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  35.17 
 
 
638 aa  249  8e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  36.14 
 
 
626 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  35.95 
 
 
600 aa  237  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  34.66 
 
 
634 aa  236  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  34.48 
 
 
612 aa  233  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  31.21 
 
 
569 aa  233  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  28.96 
 
 
631 aa  228  3e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  35.57 
 
 
402 aa  224  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10144  transmembrane protein  36.92 
 
 
492 aa  223  6e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  33.72 
 
 
470 aa  223  7e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2388  chloride channel core  35.96 
 
 
650 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.360488 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  30.46 
 
 
577 aa  216  8e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  29.3 
 
 
613 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  29.6 
 
 
627 aa  211  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  37.65 
 
 
584 aa  209  9e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  35.75 
 
 
456 aa  206  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  31.63 
 
 
597 aa  204  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.68 
 
 
591 aa  201  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  32.25 
 
 
590 aa  201  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.55 
 
 
620 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  29.39 
 
 
628 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  30.69 
 
 
627 aa  196  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  27.86 
 
 
603 aa  194  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  31.95 
 
 
593 aa  194  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.83 
 
 
598 aa  192  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.41 
 
 
594 aa  189  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  30.18 
 
 
629 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  28.79 
 
 
624 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.68 
 
 
591 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.76 
 
 
577 aa  182  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.5 
 
 
591 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  30.45 
 
 
640 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.25 
 
 
593 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.25 
 
 
593 aa  178  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.85 
 
 
579 aa  178  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.85 
 
 
579 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.85 
 
 
636 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.85 
 
 
579 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2728  Chloride channel core  29.31 
 
 
474 aa  177  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.969759  hitchhiker  0.00000000119016 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3129  voltage-gated chloride channel  29.96 
 
 
467 aa  177  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.831797  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.08 
 
 
628 aa  177  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1241  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.05 
 
 
428 aa  177  7e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.730218 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.36 
 
 
575 aa  176  7e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  26.56 
 
 
598 aa  176  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.53 
 
 
589 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.1 
 
 
589 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.1 
 
 
589 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.9 
 
 
589 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0525  Cl- channel voltage-gated family protein  27.98 
 
 
579 aa  173  9e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  27.09 
 
 
617 aa  171  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  31.17 
 
 
543 aa  170  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  28.76 
 
 
633 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  33.63 
 
 
429 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.71 
 
 
598 aa  165  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  30.96 
 
 
579 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3124  Cl- channel, voltage gated  28.52 
 
 
596 aa  163  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2181  Cl- channel voltage-gated family protein  28.97 
 
 
634 aa  163  7e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  30.18 
 
 
464 aa  163  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  30.18 
 
 
464 aa  163  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  30.05 
 
 
434 aa  161  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  26.49 
 
 
859 aa  161  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.21 
 
 
461 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  28.14 
 
 
585 aa  160  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  30.07 
 
 
436 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  28.81 
 
 
863 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  28.84 
 
 
605 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.01 
 
 
591 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2520  Chloride channel core  27.44 
 
 
594 aa  154  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3070  chloride channel core  30.19 
 
 
590 aa  154  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal  0.0360231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  28.79 
 
 
533 aa  153  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>