More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_29991 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_29991  putative chloride channel  100 
 
 
450 aa  887    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.593355 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2297  putative chloride channel  71.43 
 
 
460 aa  615  1e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.73973  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18351  putative chloride channel  68.08 
 
 
452 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2668  putative chloride channel  71.01 
 
 
481 aa  561  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18921  putative chloride channel  63.15 
 
 
452 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.708029  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19111  putative chloride channel  61.95 
 
 
452 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1794  putative chloride channel  62.17 
 
 
452 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21821  putative chloride channel  67.12 
 
 
452 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.607028 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18921  putative chloride channel  61.73 
 
 
452 aa  538  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_2187  hypothetical protein  64.56 
 
 
160 aa  197  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  33.03 
 
 
863 aa  195  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  34.81 
 
 
863 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  34.82 
 
 
862 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  33.33 
 
 
859 aa  187  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  35.63 
 
 
897 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  32.32 
 
 
875 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  32.77 
 
 
879 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  32.77 
 
 
879 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  31.29 
 
 
463 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  28.95 
 
 
466 aa  130  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  33.24 
 
 
859 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  29.57 
 
 
471 aa  127  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  28.99 
 
 
473 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  28.99 
 
 
473 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  28.99 
 
 
473 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  28.99 
 
 
473 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  28.99 
 
 
473 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  27.27 
 
 
519 aa  123  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  31.3 
 
 
533 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  28.03 
 
 
519 aa  120  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.54 
 
 
526 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  31.64 
 
 
470 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  28.24 
 
 
479 aa  116  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  32.42 
 
 
435 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  27.82 
 
 
598 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  28.89 
 
 
468 aa  111  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  30.73 
 
 
625 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  29.9 
 
 
606 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  29.47 
 
 
466 aa  109  8.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.54 
 
 
439 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.54 
 
 
439 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  30.54 
 
 
439 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  30.85 
 
 
669 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  27.59 
 
 
629 aa  107  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  26.92 
 
 
510 aa  107  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  26.65 
 
 
603 aa  104  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  29.4 
 
 
510 aa  104  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.68 
 
 
591 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  29.19 
 
 
597 aa  100  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  29.79 
 
 
472 aa  100  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  31.62 
 
 
626 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  25.96 
 
 
538 aa  99  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  28.29 
 
 
523 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  28.08 
 
 
523 aa  99.8  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  27.12 
 
 
608 aa  99  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  27.64 
 
 
569 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  27.25 
 
 
470 aa  98.6  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.68 
 
 
437 aa  97.8  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  31 
 
 
455 aa  97.8  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.07 
 
 
582 aa  97.4  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  28.16 
 
 
600 aa  97.1  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  24.35 
 
 
563 aa  97.1  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  29.98 
 
 
615 aa  96.7  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  26.44 
 
 
631 aa  96.3  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  27.49 
 
 
604 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  27.49 
 
 
603 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  29.13 
 
 
455 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.84 
 
 
587 aa  95.9  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  27.03 
 
 
614 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  28.9 
 
 
455 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  26.87 
 
 
613 aa  95.5  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  29.31 
 
 
640 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  29.53 
 
 
427 aa  94.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  27.13 
 
 
528 aa  94.4  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  29.98 
 
 
427 aa  94  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  33.25 
 
 
436 aa  94  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.34 
 
 
591 aa  93.2  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  29.43 
 
 
518 aa  93.2  8e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.34 
 
 
439 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  28.46 
 
 
512 aa  93.2  8e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  30.54 
 
 
455 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  26.1 
 
 
528 aa  90.9  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  31.02 
 
 
473 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  31.02 
 
 
473 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  25 
 
 
585 aa  90.9  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  31.02 
 
 
473 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  31.02 
 
 
473 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  31.02 
 
 
473 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  30.75 
 
 
473 aa  90.1  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  31.02 
 
 
473 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  31.02 
 
 
473 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  30.75 
 
 
473 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  29.11 
 
 
651 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  24.3 
 
 
416 aa  89  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.08 
 
 
575 aa  89.7  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.08 
 
 
443 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  25.38 
 
 
457 aa  88.2  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  26.45 
 
 
462 aa  87.8  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.94 
 
 
598 aa  87.4  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  26.97 
 
 
586 aa  86.7  8e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.406579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>