More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_21821 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_21821  putative chloride channel  100 
 
 		 452 aa  898    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.607028 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29991  putative chloride channel  67.12 
 
 		 450 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.593355 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18351  putative chloride channel  68.48 
 
 		 452 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1794  putative chloride channel  68.24 
 
 		 452 aa  581  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19111  putative chloride channel  68.69 
 
 		 452 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18921  putative chloride channel  66.37 
 
 		 452 aa  579  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.708029  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2297  putative chloride channel  65.04 
 
 		 460 aa  575  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.73973  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18921  putative chloride channel  67.57 
 
 		 452 aa  567  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2668  putative chloride channel  64.72 
 
 		 481 aa  527  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_2187  hypothetical protein  99.38 
 
 		 160 aa  313  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  29.48 
 
 		 863 aa  194  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  33.72 
 
 		 863 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  33.18 
 
 		 862 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  31.8 
 
 		 859 aa  176  6e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  32.41 
 
 		 897 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  31.89 
 
 		 875 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  30.41 
 
 		 879 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  30.41 
 
 		 879 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  29.57 
 
 		 471 aa  139  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  29.06 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  27.95 
 
 		 473 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  27.29 
 
 		 473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  27.29 
 
 		 473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  27.29 
 
 		 473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  27.73 
 
 		 473 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  29.61 
 
 		 598 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  28.36 
 
 		 606 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  29.08 
 
 		 463 aa  125  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  27.57 
 
 		 519 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  27.32 
 
 		 519 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  29.49 
 
 		 533 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.46 
 
 		 591 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  29.23 
 
 		 859 aa  117  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  26.17 
 
 		 538 aa  117  5e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  28.21 
 
 		 479 aa  116  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  29.98 
 
 		 625 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  28.73 
 
 		 669 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  28.54 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  27.69 
 
 		 468 aa  111  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  25.92 
 
 		 478 aa  110  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  25.92 
 
 		 478 aa  110  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  25.92 
 
 		 478 aa  110  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  26.71 
 
 		 456 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  26.24 
 
 		 563 aa  109  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0814  voltage-gated chloride channel  27.82 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802011  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0956  Chloride channel core  27.82 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  27.32 
 
 		 585 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  26.83 
 
 		 528 aa  108  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.18 
 
 		 579 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.18 
 
 		 579 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.18 
 
 		 579 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  28.76 
 
 		 523 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.78 
 
 		 437 aa  107  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.18 
 
 		 636 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  27.03 
 
 		 416 aa  107  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  31.09 
 
 		 615 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.64 
 
 		 577 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  28.76 
 
 		 523 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  30.77 
 
 		 466 aa  107  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  28.26 
 
 		 472 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.34 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.34 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  26.34 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  25.63 
 
 		 617 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  28.25 
 
 		 603 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.77 
 
 		 628 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  26.84 
 
 		 569 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  27.48 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  28.95 
 
 		 626 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  25.88 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  27.63 
 
 		 534 aa  101  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.09 
 
 		 593 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.96 
 
 		 598 aa  99.8  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.09 
 
 		 593 aa  99.8  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  27.25 
 
 		 427 aa  99.8  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  28.65 
 
 		 510 aa  99.4  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.69 
 
 		 591 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.32 
 
 		 587 aa  99.8  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.63 
 
 		 589 aa  99  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.12 
 
 		 589 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.06 
 
 		 591 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  27.5 
 
 		 435 aa  98.2  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.88 
 
 		 589 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.88 
 
 		 589 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  26.97 
 
 		 629 aa  97.8  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  27.23 
 
 		 402 aa  97.1  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  28.22 
 
 		 462 aa  97.1  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.66 
 
 		 526 aa  97.1  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.42 
 
 		 580 aa  97.1  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  27.34 
 
 		 597 aa  96.3  9e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  28.64 
 
 		 518 aa  95.9  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  23.17 
 
 		 559 aa  95.9  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  28.77 
 
 		 528 aa  94.7  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  25.97 
 
 		 464 aa  94.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  25.97 
 
 		 464 aa  94.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  25 
 
 		 439 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  24.15 
 
 		 453 aa  93.2  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.79 
 
 		 582 aa  93.2  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  24.41 
 
 		 631 aa  92  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  25.44 
 
 		 604 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>