More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0147 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  99.58 
 
 		 473 aa  935    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  77.59 
 
 		 473 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  99.58 
 
 		 473 aa  935    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  100 
 
 		 473 aa  940    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  99.37 
 
 		 473 aa  934    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  99.58 
 
 		 473 aa  935    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  78.01 
 
 		 473 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  99.58 
 
 		 473 aa  935    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  99.37 
 
 		 473 aa  934    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  78.01 
 
 		 473 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  77.59 
 
 		 473 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  99.37 
 
 		 473 aa  934    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  75.38 
 
 		 466 aa  672    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  99.58 
 
 		 473 aa  935    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  78.01 
 
 		 473 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  69.48 
 
 		 479 aa  624  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  70.4 
 
 		 478 aa  605  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  70.4 
 
 		 478 aa  605  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  70.4 
 
 		 478 aa  605  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  65.02 
 
 		 471 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  65.85 
 
 		 472 aa  529  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  55.43 
 
 		 468 aa  458  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  55.88 
 
 		 467 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06233  chloride channel protein  55.18 
 
 		 468 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  46.41 
 
 		 470 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  44.99 
 
 		 466 aa  353  4e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  39.96 
 
 		 463 aa  306  4.0000000000000004e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  41 
 
 		 456 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  40.94 
 
 		 427 aa  272  9e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  39.06 
 
 		 427 aa  271  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  42.74 
 
 		 455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  42.33 
 
 		 455 aa  243  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  42.58 
 
 		 455 aa  237  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  37.8 
 
 		 533 aa  225  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  33.84 
 
 		 519 aa  203  4e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  33.84 
 
 		 519 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2460  chloride channel core  38.5 
 
 		 459 aa  199  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11718  normal  0.460638 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  30.43 
 
 		 510 aa  195  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  38.52 
 
 		 436 aa  190  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  37.98 
 
 		 435 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  38.84 
 
 		 539 aa  182  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  37.2 
 
 		 455 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  31.86 
 
 		 512 aa  177  4e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  31.9 
 
 		 528 aa  174  2.9999999999999996e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.18 
 
 		 437 aa  172  9e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  30.38 
 
 		 563 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  32.65 
 
 		 523 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  33.67 
 
 		 523 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  31.88 
 
 		 569 aa  171  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.81 
 
 		 526 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.44 
 
 		 439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  33.92 
 
 		 615 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  32.65 
 
 		 510 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  34.4 
 
 		 859 aa  163  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  29.65 
 
 		 534 aa  162  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  33.09 
 
 		 487 aa  161  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  32.41 
 
 		 516 aa  161  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0118  chloride transporter, ClC family  33.48 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  31.36 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  33.56 
 
 		 863 aa  157  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  29.6 
 
 		 538 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.42 
 
 		 439 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  33.42 
 
 		 439 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.42 
 
 		 439 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  29.52 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  29.5 
 
 		 528 aa  154  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  27.82 
 
 		 470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  30.61 
 
 		 512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  29.66 
 
 		 614 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  33.71 
 
 		 597 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  32.87 
 
 		 862 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.54 
 
 		 443 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.81 
 
 		 587 aa  144  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1346  chloride channel protein  34.04 
 
 		 527 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  32.12 
 
 		 613 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  29.69 
 
 		 627 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  32.06 
 
 		 606 aa  137  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  33.64 
 
 		 608 aa  137  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  29.74 
 
 		 518 aa  135  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1794  putative chloride channel  29.35 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  31.74 
 
 		 600 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  28.93 
 
 		 445 aa  134  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19111  putative chloride channel  29.57 
 
 		 452 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  31.52 
 
 		 875 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18921  putative chloride channel  30 
 
 		 452 aa  133  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.708029  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  27.66 
 
 		 631 aa  133  6e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.08 
 
 		 598 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  29.26 
 
 		 626 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  29.81 
 
 		 462 aa  130  7.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  30.38 
 
 		 453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  29.25 
 
 		 584 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  33.09 
 
 		 879 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18921  putative chloride channel  30.17 
 
 		 452 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  33.09 
 
 		 879 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  32.05 
 
 		 897 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.63 
 
 		 591 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  29.89 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  29.89 
 
 		 490 aa  124  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  26.19 
 
 		 416 aa  123  7e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.97 
 
 		 580 aa  123  7e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>