More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2810 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  74.66 
 
 		 471 aa  640    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  100 
 
 		 472 aa  925    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  71.4 
 
 		 479 aa  613  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  67.6 
 
 		 473 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  69.59 
 
 		 473 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  69.59 
 
 		 473 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  69.59 
 
 		 473 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  69.37 
 
 		 473 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  69.41 
 
 		 466 aa  592  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  66.88 
 
 		 478 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  66.88 
 
 		 478 aa  580  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  66.88 
 
 		 478 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  66.29 
 
 		 473 aa  512  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  66.29 
 
 		 473 aa  512  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  66.29 
 
 		 473 aa  512  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  66.29 
 
 		 473 aa  512  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  66.29 
 
 		 473 aa  512  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  66.29 
 
 		 473 aa  512  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  66.29 
 
 		 473 aa  511  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  66.29 
 
 		 473 aa  511  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  66.06 
 
 		 473 aa  509  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  58.28 
 
 		 468 aa  479  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  59.19 
 
 		 467 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06233  chloride channel protein  58.26 
 
 		 468 aa  430  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  49.56 
 
 		 470 aa  397  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  44.81 
 
 		 466 aa  345  8.999999999999999e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  43.5 
 
 		 456 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  41.81 
 
 		 463 aa  311  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  44 
 
 		 427 aa  280  3e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  44.27 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  41.13 
 
 		 455 aa  249  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  41.09 
 
 		 455 aa  247  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  39.76 
 
 		 455 aa  243  7e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  38.39 
 
 		 533 aa  236  7e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  34.77 
 
 		 519 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  34.78 
 
 		 519 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2460  chloride channel core  42.94 
 
 		 459 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11718  normal  0.460638 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  38.15 
 
 		 436 aa  199  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  31.15 
 
 		 510 aa  186  9e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  37.91 
 
 		 435 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  38.93 
 
 		 539 aa  183  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.08 
 
 		 437 aa  177  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  33.78 
 
 		 512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.28 
 
 		 526 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  35.28 
 
 		 859 aa  170  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  32.44 
 
 		 523 aa  170  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  30.23 
 
 		 563 aa  169  7e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  32.06 
 
 		 523 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.8 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  31.75 
 
 		 528 aa  168  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  33.8 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.8 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.75 
 
 		 439 aa  167  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  39.78 
 
 		 455 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  31.74 
 
 		 569 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.57 
 
 		 443 aa  161  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  34.04 
 
 		 863 aa  161  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  31.21 
 
 		 510 aa  158  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  31.18 
 
 		 534 aa  158  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  29.52 
 
 		 457 aa  156  9e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  32.71 
 
 		 615 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  33.51 
 
 		 512 aa  154  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  34.35 
 
 		 597 aa  155  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  35.58 
 
 		 862 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  32.39 
 
 		 875 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  30.43 
 
 		 516 aa  147  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  29.91 
 
 		 614 aa  147  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  28.2 
 
 		 538 aa  146  6e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  29.95 
 
 		 613 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0118  chloride transporter, ClC family  32.71 
 
 		 455 aa  143  5e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  26.8 
 
 		 428 aa  144  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  32 
 
 		 518 aa  143  6e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  29.29 
 
 		 584 aa  143  9e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  34.32 
 
 		 626 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  30.11 
 
 		 445 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  28.15 
 
 		 528 aa  141  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1346  chloride channel protein  35.62 
 
 		 527 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  33.44 
 
 		 608 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  31.61 
 
 		 487 aa  139  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  34.64 
 
 		 669 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  35.32 
 
 		 863 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  25.65 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  36.46 
 
 		 859 aa  133  6.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  32.02 
 
 		 606 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  32.77 
 
 		 600 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  31.47 
 
 		 440 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  34.27 
 
 		 879 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  34.27 
 
 		 879 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  30.48 
 
 		 470 aa  130  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  30.94 
 
 		 449 aa  130  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.82 
 
 		 598 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.13 
 
 		 589 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.78 
 
 		 587 aa  126  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.74 
 
 		 593 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.74 
 
 		 593 aa  126  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18351  putative chloride channel  29.85 
 
 		 452 aa  126  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  30 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  33.51 
 
 		 444 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  27.46 
 
 		 559 aa  124  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  31.32 
 
 		 449 aa  124  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>