More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2543 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  100 
 
 		 591 aa  1175    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  45.58 
 
 		 591 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  45.13 
 
 		 579 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  45.13 
 
 		 636 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  45.13 
 
 		 579 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  44.42 
 
 		 598 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  45.13 
 
 		 579 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  45.13 
 
 		 628 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  44.6 
 
 		 591 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  44.42 
 
 		 593 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  44.07 
 
 		 577 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  44.42 
 
 		 593 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  44.07 
 
 		 589 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  44.07 
 
 		 589 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  44.07 
 
 		 589 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  45.31 
 
 		 589 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  46.79 
 
 		 461 aa  341  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  47.75 
 
 		 464 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  47.75 
 
 		 464 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  35.48 
 
 		 596 aa  293  5e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  46.8 
 
 		 471 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.10029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0516  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  37.19 
 
 		 601 aa  286  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132092  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  36.33 
 
 		 560 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.4 
 
 		 582 aa  273  8.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  33.45 
 
 		 615 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  32.41 
 
 		 608 aa  268  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  32.93 
 
 		 595 aa  258  2e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  29.28 
 
 		 614 aa  257  5e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  44.55 
 
 		 414 aa  253  8.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  44.55 
 
 		 426 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  30.3 
 
 		 613 aa  251  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  39.73 
 
 		 426 aa  246  9e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3746  Cl- channel, voltage-gated family protein  40.8 
 
 		 414 aa  228  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  34.12 
 
 		 579 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  32.72 
 
 		 627 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  27.68 
 
 		 606 aa  217  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  34.16 
 
 		 669 aa  217  5.9999999999999996e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  30.2 
 
 		 631 aa  212  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  31.91 
 
 		 597 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  30.89 
 
 		 577 aa  208  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  29.5 
 
 		 625 aa  207  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  35.12 
 
 		 586 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  33.27 
 
 		 626 aa  205  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2439  chloride channel core protein  34.86 
 
 		 589 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2526  Chloride channel core  34.92 
 
 		 589 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  32.56 
 
 		 593 aa  203  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  31.79 
 
 		 600 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  30.89 
 
 		 590 aa  199  9e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.72 
 
 		 580 aa  194  4e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  29.09 
 
 		 569 aa  189  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  30.65 
 
 		 627 aa  187  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  33.43 
 
 		 470 aa  186  7e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  31.85 
 
 		 628 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  33.57 
 
 		 456 aa  184  6e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  30.78 
 
 		 640 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1666  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  37.97 
 
 		 418 aa  182  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1607  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  37.97 
 
 		 418 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01561  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  37.97 
 
 		 418 aa  181  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2051  Chloride channel core  37.97 
 
 		 418 aa  181  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2038  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  37.97 
 
 		 418 aa  181  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1800  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  37.97 
 
 		 418 aa  181  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01551  hypothetical protein  37.97 
 
 		 418 aa  181  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  26.09 
 
 		 603 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.99 
 
 		 620 aa  180  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2303  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  37.97 
 
 		 418 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0264865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1592  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  39.71 
 
 		 429 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0733959 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  31.23 
 
 		 624 aa  178  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1779  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  37.68 
 
 		 418 aa  177  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  25.65 
 
 		 617 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  31.68 
 
 		 402 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.85 
 
 		 587 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  31.21 
 
 		 584 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  29.26 
 
 		 605 aa  174  5e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1601  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  40 
 
 		 429 aa  173  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.262233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1682  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  40 
 
 		 429 aa  173  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.669275  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  26.33 
 
 		 602 aa  172  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  28.79 
 
 		 613 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1660  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  39.71 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.91 
 
 		 575 aa  171  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1849  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  39.71 
 
 		 417 aa  170  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.63 
 
 		 594 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  27.15 
 
 		 598 aa  169  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  29.15 
 
 		 859 aa  168  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  28.51 
 
 		 603 aa  166  9e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.84 
 
 		 598 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  27.54 
 
 		 604 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  28.97 
 
 		 629 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  28.1 
 
 		 605 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  28.73 
 
 		 651 aa  159  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  28.98 
 
 		 602 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2971  Chloride channel core  28.01 
 
 		 605 aa  157  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  30.97 
 
 		 543 aa  156  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43785  predicted protein  31.35 
 
 		 588 aa  155  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000378872  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  26.95 
 
 		 603 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  28.22 
 
 		 863 aa  154  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.74 
 
 		 591 aa  154  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  28.44 
 
 		 862 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.57 
 
 		 612 aa  153  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  31.14 
 
 		 575 aa  152  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  28.72 
 
 		 863 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>