More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4402 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  69.01 
 
 
594 aa  850    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  100 
 
 
598 aa  1197    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0552  Chloride channel core  45.14 
 
 
614 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  43.21 
 
 
617 aa  480  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2520  Chloride channel core  38.15 
 
 
594 aa  360  4e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  35.97 
 
 
598 aa  355  1e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  32.94 
 
 
608 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  31.2 
 
 
614 aa  229  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  29.9 
 
 
613 aa  223  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  29.93 
 
 
615 aa  219  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.92 
 
 
582 aa  219  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  27.82 
 
 
627 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  29.11 
 
 
631 aa  189  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  30.3 
 
 
669 aa  187  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  27.32 
 
 
584 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  26.69 
 
 
598 aa  180  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  25.71 
 
 
606 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  32.66 
 
 
470 aa  179  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.98 
 
 
620 aa  178  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  26.19 
 
 
603 aa  176  8e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  26.87 
 
 
602 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5286  Chloride channel core  31.71 
 
 
431 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4920  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.75 
 
 
426 aa  176  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  30.71 
 
 
597 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.45 
 
 
591 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  27.64 
 
 
626 aa  171  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  28.5 
 
 
577 aa  171  4e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  29.22 
 
 
627 aa  169  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  26.74 
 
 
625 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  27 
 
 
624 aa  168  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  29.18 
 
 
628 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  26.47 
 
 
629 aa  166  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  27.72 
 
 
603 aa  165  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  27.89 
 
 
579 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  27.93 
 
 
862 aa  156  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.68 
 
 
587 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  27.09 
 
 
582 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  26.99 
 
 
605 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.49 
 
 
754 aa  154  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2971  Chloride channel core  26.67 
 
 
605 aa  153  8e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.74 
 
 
580 aa  151  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  27.39 
 
 
605 aa  150  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  25.24 
 
 
600 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  25.69 
 
 
859 aa  149  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  27.35 
 
 
879 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  27.35 
 
 
879 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  26.58 
 
 
586 aa  148  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  26.84 
 
 
651 aa  148  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  25.82 
 
 
863 aa  147  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2485  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.94 
 
 
603 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  28.65 
 
 
586 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1369  Chloride channel core  29.18 
 
 
420 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2526  Chloride channel core  28.36 
 
 
589 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  26.71 
 
 
593 aa  144  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2439  chloride channel core protein  28.17 
 
 
589 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590865  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  26.21 
 
 
602 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.54 
 
 
598 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  32.6 
 
 
402 aa  139  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  28.65 
 
 
462 aa  139  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  26.5 
 
 
875 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.51 
 
 
589 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1431  Chloride channel core  26.78 
 
 
605 aa  138  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  25.05 
 
 
590 aa  137  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.84 
 
 
591 aa  136  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  26.73 
 
 
575 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  25.35 
 
 
604 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.76 
 
 
577 aa  133  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.49 
 
 
636 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  28.95 
 
 
559 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  25.25 
 
 
603 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.04 
 
 
579 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.04 
 
 
579 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.04 
 
 
579 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.61 
 
 
426 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.45 
 
 
628 aa  132  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.61 
 
 
414 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.36 
 
 
426 aa  131  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  29.06 
 
 
640 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.46 
 
 
612 aa  130  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.08 
 
 
582 aa  128  3e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0525  Cl- channel voltage-gated family protein  24.61 
 
 
579 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.65 
 
 
591 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  26.52 
 
 
897 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  26.39 
 
 
464 aa  125  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.26 
 
 
593 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  26.39 
 
 
464 aa  125  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0956  Chloride channel core  30.61 
 
 
461 aa  124  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0814  voltage-gated chloride channel  30.61 
 
 
461 aa  124  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802011  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  26.11 
 
 
863 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0630  Chloride channel core  30.81 
 
 
475 aa  124  5e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  29.81 
 
 
456 aa  124  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  25.05 
 
 
600 aa  123  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.1 
 
 
593 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0357  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.42 
 
 
588 aa  120  4.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.6 
 
 
589 aa  120  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  25.76 
 
 
633 aa  120  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  27.22 
 
 
457 aa  120  9e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0191  chloride channel core  26.12 
 
 
635 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66054  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.51 
 
 
612 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  26.84 
 
 
613 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>