More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1369 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1369  Chloride channel core  100 
 
 		 420 aa  832    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4920  Cl- channel, voltage-gated family protein  52.3 
 
 		 426 aa  431  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5286  Chloride channel core  48.65 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2520  Chloride channel core  32.11 
 
 		 594 aa  186  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.62 
 
 		 594 aa  154  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  27.54 
 
 		 598 aa  152  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.74 
 
 		 598 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  27.75 
 
 		 617 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0552  Chloride channel core  27.54 
 
 		 614 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  25.13 
 
 		 470 aa  114  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  26.48 
 
 		 625 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  24.65 
 
 		 602 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  26.34 
 
 		 627 aa  99.8  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  29.01 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.04 
 
 		 587 aa  95.5  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  29.41 
 
 		 528 aa  94.4  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.3 
 
 		 754 aa  94.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  28.31 
 
 		 626 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  24.77 
 
 		 602 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1650  Chloride channel core  25 
 
 		 604 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  24.73 
 
 		 608 aa  90.9  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  25.61 
 
 		 584 aa  90.9  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  25.86 
 
 		 512 aa  90.9  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  21.48 
 
 		 569 aa  90.5  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  28.09 
 
 		 631 aa  87.4  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  23.31 
 
 		 614 aa  87.4  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.23 
 
 		 414 aa  86.7  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.23 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  23.37 
 
 		 669 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.35 
 
 		 582 aa  85.9  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  23.22 
 
 		 462 aa  84.3  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  25.13 
 
 		 606 aa  83.2  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  26.33 
 
 		 600 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.19 
 
 		 526 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  24.48 
 
 		 605 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  22.64 
 
 		 613 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  25.7 
 
 		 519 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  26.35 
 
 		 628 aa  80.5  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  24.44 
 
 		 559 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  25.84 
 
 		 603 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3539  Chloride channel core  25.59 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  25.21 
 
 		 598 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2371  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.87 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.596743  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  26.17 
 
 		 519 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  27.65 
 
 		 627 aa  77.8  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  24.1 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  24.01 
 
 		 585 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  25.77 
 
 		 603 aa  77  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.9 
 
 		 591 aa  77  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  26.92 
 
 		 863 aa  76.6  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.08 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  24.3 
 
 		 473 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  24.3 
 
 		 473 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.59 
 
 		 437 aa  76.3  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  24.3 
 
 		 473 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  24.3 
 
 		 473 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  24.32 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3981  Chloride channel core  26.28 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0516  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.64 
 
 		 601 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132092  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4094  Chloride channel core  26.28 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.089965  normal  0.148511 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  21.83 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  27.25 
 
 		 523 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.31 
 
 		 560 aa  74.3  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  26.88 
 
 		 523 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.31 
 
 		 598 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  24.81 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  22.42 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6375  Chloride channel core  23.4 
 
 		 595 aa  72.8  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  23.58 
 
 		 479 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  25.14 
 
 		 604 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  21.75 
 
 		 613 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  22.49 
 
 		 528 aa  71.2  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.6 
 
 		 620 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  25.78 
 
 		 579 aa  70.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1160  chloride channel core  23.76 
 
 		 494 aa  71.2  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4429  chloride channel core  24.08 
 
 		 595 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1346  chloride channel protein  25.94 
 
 		 527 aa  70.9  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  22.9 
 
 		 615 aa  70.1  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0570  voltage-gated chloride channel family protein  25.59 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  25.69 
 
 		 603 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  24.23 
 
 		 470 aa  70.5  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3967  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.61 
 
 		 595 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995893  normal  0.198047 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  22.8 
 
 		 579 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  22.8 
 
 		 579 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  27.27 
 
 		 624 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  22.8 
 
 		 579 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  25.81 
 
 		 586 aa  70.1  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4117  chloride channel core  24.18 
 
 		 595 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  23.25 
 
 		 510 aa  69.7  0.00000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.44 
 
 		 577 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  22.8 
 
 		 636 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1257  chloride channel-like  25 
 
 		 615 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.95023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  23.59 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  23.59 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3746  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.49 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  22.19 
 
 		 628 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3825  Cl- channel, voltage gated  24.02 
 
 		 595 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722895  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  23.44 
 
 		 518 aa  68.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4543  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.02 
 
 		 595 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763229  normal  0.0966247 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  21.32 
 
 		 589 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>