More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3981 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1803  hypothetical protein  87.8 
 
 		 431 aa  639    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3981  Chloride channel core  100 
 
 		 426 aa  832    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4094  Chloride channel core  100 
 
 		 426 aa  832    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.089965  normal  0.148511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  67.33 
 
 		 436 aa  548  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2302  Cl- channel, voltage gated  67.41 
 
 		 413 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0508  voltage-gated chloride channel  67.73 
 
 		 435 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4570  Cl- channel, voltage gated  68.37 
 
 		 413 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3793  Cl- channel, voltage-gated family protein  68.37 
 
 		 413 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258404  normal  0.231279 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3731  chloride channel core  68.11 
 
 		 413 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.597122 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0225  voltage-gated chloride channel  67.83 
 
 		 427 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2677  chloride channel (ClC) family protein  67.58 
 
 		 435 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0961  voltage-gated chloride channel  66.83 
 
 		 435 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0261  voltage-gated chloride channel  67.83 
 
 		 427 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1406  voltage-gated chloride channel  67.83 
 
 		 427 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1603  voltage-gated chloride channel  67.07 
 
 		 436 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845541  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01048  Cl- channel, voltage gated  62.2 
 
 		 443 aa  495  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371868  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06118  Cl- channel, voltage gated  62.2 
 
 		 443 aa  495  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3685  chloride channel core  68.37 
 
 		 468 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.36379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5519  Cl- channel, voltage-gated family protein  66.34 
 
 		 413 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720023  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4940  chloride channel core  65.84 
 
 		 413 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530885 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2534  chloride channel (ClC) family protein  67.32 
 
 		 435 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1732  chloride channel core  59.13 
 
 		 431 aa  487  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4619  voltage-gated chloride channel family protein  61.31 
 
 		 452 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1486  Cl- channel, voltage gated  61.31 
 
 		 448 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2064  chloride channel core  62.8 
 
 		 440 aa  461  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0178242 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0545  Chloride channel core  47.64 
 
 		 417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0459516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2371  Cl- channel, voltage-gated family protein  51.41 
 
 		 418 aa  402  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.596743  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3539  Chloride channel core  53.4 
 
 		 415 aa  382  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  50.12 
 
 		 452 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0837  Cl- channel, voltage-gated family protein  50.81 
 
 		 462 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115914  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4018  Chloride channel core  47.41 
 
 		 453 aa  353  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0570  voltage-gated chloride channel family protein  46.17 
 
 		 437 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0556  voltage gated chloride channel family protein  44.1 
 
 		 437 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2639  Chloride channel core  49.41 
 
 		 457 aa  342  9e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.311853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1136  hypothetical protein  49.04 
 
 		 482 aa  339  5e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0839262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1026  chloride channel core  49.23 
 
 		 421 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.724519  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2367  Chloride channel core  41.42 
 
 		 438 aa  248  2e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2620  Cl- channel voltage-gated family protein  32.54 
 
 		 452 aa  226  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2180  Cl- channel, voltage gated  36.22 
 
 		 435 aa  223  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000426596  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1199  chloride channel protein EriC  33.68 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0541  voltage-gated chloride channel family protein  36.54 
 
 		 398 aa  211  3e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0274  Chloride channel core  36.71 
 
 		 455 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3273  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.32 
 
 		 481 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0292  chloride channel core protein  36.58 
 
 		 455 aa  207  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158347  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1160  chloride channel core  33.5 
 
 		 494 aa  197  4.0000000000000005e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1145  chloride channel protein EriC  34.46 
 
 		 408 aa  178  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000190492  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  29.61 
 
 		 606 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  27.43 
 
 		 462 aa  129  9.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  29.18 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  26.15 
 
 		 429 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  27.19 
 
 		 598 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  25.27 
 
 		 586 aa  108  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.65 
 
 		 580 aa  107  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.39 
 
 		 591 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13300  chloride channel protein EriC  29.48 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  26.99 
 
 		 582 aa  97.8  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.58 
 
 		 598 aa  97.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.11 
 
 		 612 aa  96.7  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.68 
 
 		 754 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.89 
 
 		 589 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  25.68 
 
 		 585 aa  94.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.3 
 
 		 593 aa  94.4  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.91 
 
 		 612 aa  94  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0357  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.38 
 
 		 588 aa  92.4  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  26.39 
 
 		 457 aa  92.4  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.48 
 
 		 593 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  37.21 
 
 		 612 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.3 
 
 		 589 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.3 
 
 		 589 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.25 
 
 		 628 aa  90.5  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.02 
 
 		 589 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  36.63 
 
 		 634 aa  90.5  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  36.05 
 
 		 638 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1362  Chloride channel core  31.13 
 
 		 393 aa  90.1  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00220045  normal  0.308625 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  27.14 
 
 		 603 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.61 
 
 		 577 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.25 
 
 		 560 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.38 
 
 		 591 aa  89  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6375  Chloride channel core  30.31 
 
 		 595 aa  88.2  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  27.57 
 
 		 456 aa  87.4  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  27.53 
 
 		 604 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.7 
 
 		 579 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.7 
 
 		 579 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.7 
 
 		 579 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.7 
 
 		 636 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  29.51 
 
 		 600 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  27.9 
 
 		 605 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1241  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.19 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.730218 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  26.96 
 
 		 625 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0584  Cl- channel, voltage gated  30.39 
 
 		 637 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3883  chloride channel core  29.05 
 
 		 603 aa  81.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2674  CBS:Cl- channel, voltage gated  28.35 
 
 		 584 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  25.51 
 
 		 602 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.75 
 
 		 587 aa  80.1  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1431  Chloride channel core  28.75 
 
 		 605 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.56 
 
 		 582 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  27.7 
 
 		 603 aa  79  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2699  Chloride channel core  28.16 
 
 		 605 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3746  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.92 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2309  Chloride channel core  27.91 
 
 		 605 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76278  hitchhiker  0.00000714896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>