More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1448 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  70.19 
 
 
470 aa  660    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  74.19 
 
 
624 aa  872    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  67.96 
 
 
631 aa  837    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  100 
 
 
627 aa  1257    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  73.84 
 
 
627 aa  885    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  73.02 
 
 
620 aa  870    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  83.41 
 
 
628 aa  1011    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.27 
 
 
582 aa  313  6.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  35.71 
 
 
615 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  35.54 
 
 
577 aa  292  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  32.48 
 
 
608 aa  290  4e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  35.39 
 
 
614 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  35.74 
 
 
669 aa  283  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  33.01 
 
 
613 aa  273  9e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  32.18 
 
 
597 aa  270  5e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.42 
 
 
598 aa  258  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  35.07 
 
 
626 aa  258  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.23 
 
 
628 aa  257  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.54 
 
 
593 aa  256  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.58 
 
 
579 aa  256  9e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.58 
 
 
579 aa  256  9e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.48 
 
 
636 aa  256  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.58 
 
 
579 aa  256  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  32.05 
 
 
584 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.54 
 
 
593 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  35.71 
 
 
600 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.12 
 
 
589 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.12 
 
 
589 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.12 
 
 
589 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.79 
 
 
591 aa  249  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.99 
 
 
577 aa  248  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.4 
 
 
589 aa  248  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  36.35 
 
 
590 aa  243  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  29.6 
 
 
606 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.27 
 
 
591 aa  237  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.14 
 
 
587 aa  236  7e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.22 
 
 
594 aa  236  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  30.08 
 
 
625 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.36 
 
 
580 aa  233  5e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.7 
 
 
591 aa  230  7e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  31.67 
 
 
569 aa  228  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  31.45 
 
 
602 aa  226  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  35.24 
 
 
593 aa  220  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  29.41 
 
 
598 aa  219  8.999999999999998e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  32.02 
 
 
579 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  36.76 
 
 
402 aa  213  7.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  26.85 
 
 
603 aa  211  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.82 
 
 
598 aa  208  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  32 
 
 
464 aa  208  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  32 
 
 
464 aa  208  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.86 
 
 
461 aa  206  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  29.89 
 
 
562 aa  205  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  31.53 
 
 
613 aa  200  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1534  Cl- channel, voltage gated  34.27 
 
 
527 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.123029  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.87 
 
 
612 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  30.5 
 
 
603 aa  197  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  31.02 
 
 
640 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  28.57 
 
 
543 aa  196  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  35.96 
 
 
456 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  27.55 
 
 
651 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  32.28 
 
 
629 aa  192  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.81 
 
 
754 aa  189  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.18 
 
 
575 aa  187  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  31.08 
 
 
586 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  31.32 
 
 
564 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  28.65 
 
 
863 aa  185  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  29.24 
 
 
606 aa  183  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2439  chloride channel core protein  31.75 
 
 
589 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590865  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  25.76 
 
 
617 aa  182  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.64 
 
 
591 aa  182  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  26.82 
 
 
598 aa  181  4e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2526  Chloride channel core  31.75 
 
 
589 aa  180  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  28.57 
 
 
575 aa  180  9e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  29.29 
 
 
605 aa  180  9e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1257  chloride channel-like  33.63 
 
 
615 aa  179  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.95023  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  33.57 
 
 
633 aa  175  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.84 
 
 
565 aa  175  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  28.43 
 
 
586 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  29.36 
 
 
462 aa  174  5e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3124  Cl- channel, voltage gated  32.38 
 
 
596 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  26.01 
 
 
585 aa  173  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2485  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.25 
 
 
603 aa  172  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  34.97 
 
 
471 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.10029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2595  Cl- channel, voltage gated  33.59 
 
 
544 aa  171  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4857  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2971  Chloride channel core  30.1 
 
 
605 aa  170  8e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3300  Cl- channel, voltage gated  26.22 
 
 
585 aa  169  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0616826  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0525  Cl- channel voltage-gated family protein  26.01 
 
 
579 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2181  Cl- channel voltage-gated family protein  32.01 
 
 
634 aa  167  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  30.86 
 
 
533 aa  167  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  27.78 
 
 
605 aa  167  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  31.15 
 
 
863 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  25.83 
 
 
604 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  30.61 
 
 
473 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  30.61 
 
 
473 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.72 
 
 
560 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  30.61 
 
 
473 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  30.61 
 
 
473 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2520  Chloride channel core  30.77 
 
 
594 aa  165  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  30.37 
 
 
473 aa  164  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  25.9 
 
 
600 aa  162  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>