More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0762 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  100 
 
 		 518 aa  1017    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  44.53 
 
 		 526 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  43.73 
 
 		 523 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  44.11 
 
 		 523 aa  382  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  41.33 
 
 		 519 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  40.6 
 
 		 519 aa  349  8e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  40.08 
 
 		 563 aa  348  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  40.32 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  38.68 
 
 		 510 aa  339  9e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  37.64 
 
 		 538 aa  309  9e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  36.81 
 
 		 528 aa  299  9e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  35.79 
 
 		 516 aa  296  5e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  35.03 
 
 		 528 aa  288  2e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1346  chloride channel protein  35.82 
 
 		 527 aa  286  5.999999999999999e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  35.57 
 
 		 510 aa  280  5e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  35.28 
 
 		 534 aa  276  9e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  37.12 
 
 		 533 aa  262  8.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  37.09 
 
 		 539 aa  251  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  36.96 
 
 		 512 aa  240  4e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  32.6 
 
 		 487 aa  229  1e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  38.14 
 
 		 457 aa  222  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  31.74 
 
 		 445 aa  212  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0118  chloride transporter, ClC family  35.73 
 
 		 455 aa  209  1e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.29 
 
 		 439 aa  190  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  30.75 
 
 		 473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  31.03 
 
 		 473 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  31.03 
 
 		 473 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  31.03 
 
 		 473 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  31.03 
 
 		 473 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  35.17 
 
 		 436 aa  183  7e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  32.42 
 
 		 471 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  34.37 
 
 		 428 aa  179  9e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  29.96 
 
 		 479 aa  174  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  30.02 
 
 		 466 aa  173  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.05 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.05 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  30.05 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  31.97 
 
 		 435 aa  171  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  28.64 
 
 		 416 aa  168  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  29.85 
 
 		 478 aa  168  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  30.18 
 
 		 478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  30.18 
 
 		 478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.82 
 
 		 443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  33.72 
 
 		 875 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0318  Chloride channel core  29.01 
 
 		 511 aa  160  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.04 
 
 		 437 aa  157  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  34.22 
 
 		 468 aa  153  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  33.79 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  29.5 
 
 		 569 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2460  chloride channel core  32.7 
 
 		 459 aa  151  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11718  normal  0.460638 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  30.95 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  28.46 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  28.9 
 
 		 863 aa  148  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  32.86 
 
 		 859 aa  147  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  30.95 
 
 		 427 aa  146  9e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  32 
 
 		 472 aa  146  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  30.36 
 
 		 862 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  31.11 
 
 		 456 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  31.83 
 
 		 455 aa  144  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  31.41 
 
 		 897 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  32.78 
 
 		 466 aa  141  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  32.22 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  29.32 
 
 		 559 aa  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.12 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  30.62 
 
 		 455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06233  chloride channel protein  32.27 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  28.1 
 
 		 473 aa  131  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  31.23 
 
 		 879 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  31.23 
 
 		 879 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  30.56 
 
 		 473 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  28.1 
 
 		 473 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  28.1 
 
 		 473 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  30.27 
 
 		 455 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  30.27 
 
 		 455 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  28.1 
 
 		 473 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  28.1 
 
 		 473 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  28.1 
 
 		 473 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  28.1 
 
 		 473 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  28.1 
 
 		 473 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  25.24 
 
 		 614 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  28.77 
 
 		 863 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  31.16 
 
 		 449 aa  124  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  26.94 
 
 		 444 aa  123  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  33.42 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  26.4 
 
 		 584 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.95 
 
 		 582 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  24.76 
 
 		 613 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.38 
 
 		 591 aa  120  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.76 
 
 		 594 aa  120  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  27.38 
 
 		 605 aa  120  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.54 
 
 		 636 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  29.05 
 
 		 468 aa  120  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.54 
 
 		 579 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.54 
 
 		 579 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.54 
 
 		 579 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  26.28 
 
 		 606 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  31.74 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4624  voltage-gated chloride channel  29.27 
 
 		 574 aa  119  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.98 
 
 		 628 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  30.79 
 
 		 451 aa  118  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>