More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2944 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  100 
 
 
526 aa  1043    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  48.61 
 
 
523 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  48.41 
 
 
523 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  47.48 
 
 
519 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  44.71 
 
 
518 aa  390  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  46.49 
 
 
519 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  41.31 
 
 
563 aa  369  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  43.14 
 
 
512 aa  364  3e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  41.04 
 
 
510 aa  358  9.999999999999999e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  38.62 
 
 
538 aa  341  2e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  39.4 
 
 
528 aa  340  2.9999999999999998e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  43.44 
 
 
539 aa  330  5.0000000000000004e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1346  chloride channel protein  39.42 
 
 
527 aa  325  1e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  37.94 
 
 
516 aa  321  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  38.56 
 
 
528 aa  320  3.9999999999999996e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  37.28 
 
 
534 aa  314  2.9999999999999996e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  37.13 
 
 
510 aa  298  2e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  36.05 
 
 
533 aa  281  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  39.19 
 
 
512 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  36.57 
 
 
487 aa  267  4e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  38.04 
 
 
457 aa  250  4e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0118  chloride transporter, ClC family  39.95 
 
 
455 aa  245  9.999999999999999e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  34.76 
 
 
445 aa  231  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  37.88 
 
 
428 aa  207  5e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  32.81 
 
 
473 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  32.81 
 
 
473 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  32.81 
 
 
473 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  32.58 
 
 
473 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  32.58 
 
 
473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  36.39 
 
 
435 aa  199  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  30.07 
 
 
416 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  33.26 
 
 
479 aa  197  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  32.38 
 
 
478 aa  196  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  32.38 
 
 
478 aa  196  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  33.95 
 
 
471 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  32.38 
 
 
478 aa  196  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  34.56 
 
 
468 aa  195  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  37.59 
 
 
436 aa  190  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  33.33 
 
 
466 aa  190  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0318  Chloride channel core  33.18 
 
 
511 aa  189  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  30.25 
 
 
463 aa  188  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  32.97 
 
 
470 aa  187  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.63 
 
 
437 aa  179  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.69 
 
 
439 aa  179  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2460  chloride channel core  36.69 
 
 
459 aa  177  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11718  normal  0.460638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  34.65 
 
 
862 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  32.41 
 
 
467 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  32.47 
 
 
569 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  33.15 
 
 
455 aa  171  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.84 
 
 
439 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.84 
 
 
439 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  30.84 
 
 
439 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  31.07 
 
 
456 aa  170  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  31.82 
 
 
863 aa  169  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  35.05 
 
 
455 aa  168  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  33.69 
 
 
859 aa  168  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  31.04 
 
 
427 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  34.75 
 
 
466 aa  168  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  34.28 
 
 
472 aa  167  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  30.57 
 
 
427 aa  166  8e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  33.15 
 
 
455 aa  166  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  32.5 
 
 
455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06233  chloride channel protein  33.95 
 
 
468 aa  163  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.68 
 
 
443 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  34.19 
 
 
875 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  33.51 
 
 
473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  33.02 
 
 
897 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  32.27 
 
 
613 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  32.81 
 
 
473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  32.55 
 
 
473 aa  147  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  32.55 
 
 
473 aa  147  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  32.27 
 
 
614 aa  147  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  32.55 
 
 
473 aa  147  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  32.55 
 
 
473 aa  147  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  32.55 
 
 
473 aa  147  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  32.55 
 
 
473 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  32.55 
 
 
473 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.99 
 
 
582 aa  143  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  32.87 
 
 
863 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  31.91 
 
 
879 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  29.52 
 
 
615 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  31.91 
 
 
879 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  29.48 
 
 
606 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  30.08 
 
 
598 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.4 
 
 
587 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.32 
 
 
598 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  28.35 
 
 
625 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.03 
 
 
436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  29.87 
 
 
626 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  29.6 
 
 
462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  28.42 
 
 
600 aa  128  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.86 
 
 
575 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4624  voltage-gated chloride channel  28.6 
 
 
574 aa  127  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.29 
 
 
589 aa  127  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  27.41 
 
 
559 aa  126  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  29.87 
 
 
605 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  28.27 
 
 
464 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  28.27 
 
 
464 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  27.54 
 
 
602 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  29.97 
 
 
440 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>