More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0583 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  100 
 
 
462 aa  910    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  58.54 
 
 
586 aa  488  1e-136  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.406579 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  56.67 
 
 
582 aa  456  1e-127  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0357  Cl- channel, voltage-gated family protein  56 
 
 
588 aa  444  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  50.33 
 
 
598 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  52.68 
 
 
582 aa  383  1e-105  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  44.92 
 
 
754 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  46.59 
 
 
580 aa  347  2e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  42.89 
 
 
606 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  43.58 
 
 
457 aa  327  3e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  41.83 
 
 
625 aa  308  9e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1039  Chloride channel core  43.97 
 
 
453 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  42.7 
 
 
612 aa  291  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  43.99 
 
 
612 aa  289  6e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10144  transmembrane protein  41.61 
 
 
492 aa  279  8e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  37.89 
 
 
603 aa  276  7e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  38.11 
 
 
602 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2595  Cl- channel, voltage gated  40.32 
 
 
544 aa  264  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4857  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2971  Chloride channel core  37.83 
 
 
605 aa  256  6e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  42.06 
 
 
605 aa  251  3e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2485  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.96 
 
 
603 aa  249  9e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  38.42 
 
 
651 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1241  Cl- channel, voltage-gated family protein  39.51 
 
 
428 aa  245  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.730218 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  37.2 
 
 
605 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1431  Chloride channel core  39.67 
 
 
605 aa  234  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3129  voltage-gated chloride channel  33.91 
 
 
467 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.831797  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2728  Chloride channel core  33.91 
 
 
474 aa  223  7e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.969759  hitchhiker  0.00000000119016 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  35.59 
 
 
638 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  35.59 
 
 
612 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  35.35 
 
 
634 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  33.26 
 
 
669 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  36.99 
 
 
402 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  32.94 
 
 
626 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  32.95 
 
 
613 aa  180  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2388  chloride channel core  34.64 
 
 
650 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.360488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.1 
 
 
582 aa  174  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  34.81 
 
 
600 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  31.69 
 
 
614 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  30.77 
 
 
608 aa  171  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2552  Chloride channel core  35.06 
 
 
531 aa  170  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  28.67 
 
 
470 aa  170  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  33.63 
 
 
615 aa  169  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  33.33 
 
 
584 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  30.08 
 
 
569 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.64 
 
 
587 aa  160  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  31.25 
 
 
629 aa  156  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3273  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.54 
 
 
481 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.97 
 
 
598 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  28.9 
 
 
429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  29.59 
 
 
613 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0274  Chloride channel core  32.75 
 
 
455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0292  chloride channel core protein  32.75 
 
 
455 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158347  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  28.91 
 
 
631 aa  144  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.61 
 
 
594 aa  143  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  31.99 
 
 
533 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  29.88 
 
 
627 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  27.39 
 
 
543 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0956  Chloride channel core  30.41 
 
 
461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0814  voltage-gated chloride channel  30.41 
 
 
461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802011  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.03 
 
 
591 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  25.82 
 
 
564 aa  139  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31 
 
 
589 aa  139  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  31.8 
 
 
456 aa  138  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  31.71 
 
 
598 aa  137  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.41 
 
 
577 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.47 
 
 
620 aa  137  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.18 
 
 
593 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.18 
 
 
593 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.77 
 
 
579 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.77 
 
 
579 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.77 
 
 
579 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  32.35 
 
 
627 aa  133  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.77 
 
 
636 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  32.82 
 
 
617 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  28.18 
 
 
577 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  29.22 
 
 
466 aa  130  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  31.31 
 
 
473 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  31.31 
 
 
473 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  31.31 
 
 
473 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  31.31 
 
 
473 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  31.31 
 
 
473 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  30.32 
 
 
597 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3981  Chloride channel core  27.43 
 
 
426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.43 
 
 
589 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.43 
 
 
589 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4094  Chloride channel core  27.43 
 
 
426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.089965  normal  0.148511 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.15 
 
 
589 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  29.7 
 
 
519 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0630  Chloride channel core  32.29 
 
 
475 aa  127  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  29.7 
 
 
519 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.24 
 
 
628 aa  126  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.65 
 
 
598 aa  126  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  27.75 
 
 
633 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  30.41 
 
 
606 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  29.03 
 
 
640 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  26.61 
 
 
436 aa  123  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  31.03 
 
 
471 aa  123  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.03 
 
 
591 aa  123  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  25.61 
 
 
603 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1160  chloride channel core  28.39 
 
 
494 aa  121  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>