More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6375 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1486  chloride channel (ClC) family protein  67.55 
 
 		 623 aa  720    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2431  hypothetical protein  75.75 
 
 		 599 aa  745    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1138  chloride channel (ClC) family protein  66.56 
 
 		 634 aa  717    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6375  Chloride channel core  100 
 
 		 595 aa  1175    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1401  chloride channel (ClC) family protein  67.55 
 
 		 623 aa  720    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1199  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  66.56 
 
 		 634 aa  717    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.383794  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2674  CBS:Cl- channel, voltage gated  67.98 
 
 		 584 aa  710    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4484  chloride channel core  70.96 
 
 		 605 aa  766    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0005  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  68.87 
 
 		 590 aa  699    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0161  chloride channel (ClC) family protein  66.56 
 
 		 634 aa  717    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740673  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1302  Cl- channel, voltage gated  68.75 
 
 		 595 aa  731    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719917  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1397  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  68.01 
 
 		 618 aa  700    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2309  Chloride channel core  75.35 
 
 		 605 aa  779    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76278  hitchhiker  0.00000714896 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3930  voltage-gated chloride channel  71.68 
 
 		 599 aa  698    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000147499 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0584  Cl- channel, voltage gated  67.93 
 
 		 637 aa  726    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3825  Cl- channel, voltage gated  69.97 
 
 		 595 aa  738    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722895  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5761  chloride channel core  69.62 
 
 		 595 aa  734    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0837  Chloride channel core  72.44 
 
 		 596 aa  744    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4117  chloride channel core  69.79 
 
 		 595 aa  743    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4429  chloride channel core  69.62 
 
 		 595 aa  739    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3967  Cl- channel, voltage-gated family protein  69.79 
 
 		 595 aa  740    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995893  normal  0.198047 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0439  chloride channel (ClC) family protein  66.56 
 
 		 634 aa  717    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.662875  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2699  Chloride channel core  75.18 
 
 		 605 aa  780    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4543  Cl- channel, voltage-gated family protein  69.97 
 
 		 595 aa  738    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763229  normal  0.0966247 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  51.29 
 
 		 606 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  51.49 
 
 		 603 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  51.75 
 
 		 604 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  52.44 
 
 		 605 aa  495  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  49.48 
 
 		 600 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2094  Chloride channel core  52.62 
 
 		 603 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3157  CBS domain-containing protein  49.3 
 
 		 593 aa  462  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.687522  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  49.06 
 
 		 633 aa  458  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5812  chloride channel core  53.28 
 
 		 634 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468888 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0315  CBS domain-containing protein  50 
 
 		 609 aa  423  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3462  CBS domain-containing protein  49.66 
 
 		 634 aa  425  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  42.44 
 
 		 613 aa  421  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3070  chloride channel core  49.31 
 
 		 590 aa  421  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal  0.0360231 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  31.25 
 
 		 577 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  30.3 
 
 		 593 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  32.08 
 
 		 629 aa  181  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  29.52 
 
 		 669 aa  177  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  30.47 
 
 		 590 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  28.02 
 
 		 608 aa  172  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  29.06 
 
 		 598 aa  170  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.19 
 
 		 582 aa  170  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  32.01 
 
 		 615 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  29.58 
 
 		 569 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  35.31 
 
 		 626 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  29.41 
 
 		 597 aa  159  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  34.75 
 
 		 456 aa  155  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.56 
 
 		 587 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  33.24 
 
 		 402 aa  153  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.92 
 
 		 580 aa  151  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  27.11 
 
 		 614 aa  151  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  32.08 
 
 		 600 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  25.41 
 
 		 598 aa  147  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  28.96 
 
 		 584 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  28.4 
 
 		 631 aa  147  6e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.21 
 
 		 598 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  30.77 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  25.7 
 
 		 613 aa  143  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0630  Chloride channel core  31.63 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.04 
 
 		 577 aa  141  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.92 
 
 		 591 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  28.17 
 
 		 606 aa  140  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0957  Chloride channel core  36.16 
 
 		 615 aa  137  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0815  voltage-gated chloride channel  36.16 
 
 		 590 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  26.77 
 
 		 603 aa  137  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  27.59 
 
 		 875 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.5 
 
 		 589 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.5 
 
 		 589 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.27 
 
 		 593 aa  133  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  27.95 
 
 		 862 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  30.5 
 
 		 596 aa  132  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.5 
 
 		 589 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.29 
 
 		 636 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.27 
 
 		 593 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  27.62 
 
 		 605 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.46 
 
 		 579 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.46 
 
 		 579 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.46 
 
 		 579 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  26.58 
 
 		 897 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.25 
 
 		 628 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  28.68 
 
 		 640 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.35 
 
 		 594 aa  128  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.33 
 
 		 589 aa  127  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  26.68 
 
 		 863 aa  127  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  27.41 
 
 		 602 aa  127  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  28.88 
 
 		 627 aa  126  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.86 
 
 		 591 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  27.38 
 
 		 617 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  29.54 
 
 		 582 aa  124  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6569  Cl- channel, voltage gated  37 
 
 		 420 aa  125  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.458011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.85 
 
 		 575 aa  123  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.15 
 
 		 612 aa  123  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  26.59 
 
 		 462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  26.79 
 
 		 625 aa  121  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  26.07 
 
 		 863 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  25.88 
 
 		 859 aa  120  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  31.02 
 
 		 627 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>