More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2431 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0439  chloride channel (ClC) family protein  69.84 
 
 		 634 aa  753    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.662875  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2431  hypothetical protein  100 
 
 		 599 aa  1168    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4117  chloride channel core  71.43 
 
 		 595 aa  753    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1199  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  69.84 
 
 		 634 aa  753    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.383794  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1401  chloride channel (ClC) family protein  71.12 
 
 		 623 aa  756    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2699  Chloride channel core  89.17 
 
 		 605 aa  966    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2674  CBS:Cl- channel, voltage gated  68.54 
 
 		 584 aa  704    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0005  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  72.9 
 
 		 590 aa  744    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6375  Chloride channel core  75.39 
 
 		 595 aa  801    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1302  Cl- channel, voltage gated  70.91 
 
 		 595 aa  751    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719917  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5761  chloride channel core  71.43 
 
 		 595 aa  759    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1397  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  71.21 
 
 		 618 aa  735    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3930  voltage-gated chloride channel  71.19 
 
 		 599 aa  720    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000147499 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0584  Cl- channel, voltage gated  69.78 
 
 		 637 aa  714    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3825  Cl- channel, voltage gated  71.6 
 
 		 595 aa  761    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722895  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0837  Chloride channel core  73.88 
 
 		 596 aa  763    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4484  chloride channel core  69.32 
 
 		 605 aa  768    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4429  chloride channel core  70.73 
 
 		 595 aa  751    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3967  Cl- channel, voltage-gated family protein  70.56 
 
 		 595 aa  749    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995893  normal  0.198047 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1486  chloride channel (ClC) family protein  71.12 
 
 		 623 aa  756    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1138  chloride channel (ClC) family protein  69.84 
 
 		 634 aa  753    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0161  chloride channel (ClC) family protein  69.84 
 
 		 634 aa  753    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740673  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4543  Cl- channel, voltage-gated family protein  71.6 
 
 		 595 aa  761    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763229  normal  0.0966247 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2309  Chloride channel core  89.17 
 
 		 605 aa  968    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76278  hitchhiker  0.00000714896 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  51.84 
 
 		 606 aa  514  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  51.53 
 
 		 605 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  51.3 
 
 		 604 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  51.21 
 
 		 603 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  50.34 
 
 		 600 aa  480  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2094  Chloride channel core  53.29 
 
 		 603 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3157  CBS domain-containing protein  50.61 
 
 		 593 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.687522  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3070  chloride channel core  52.08 
 
 		 590 aa  443  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal  0.0360231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  48.44 
 
 		 633 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3462  CBS domain-containing protein  49.31 
 
 		 634 aa  431  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5812  chloride channel core  53.02 
 
 		 634 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468888 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0315  CBS domain-containing protein  49.38 
 
 		 609 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  41.81 
 
 		 613 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  33.46 
 
 		 577 aa  237  6e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  33.03 
 
 		 593 aa  196  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  31.3 
 
 		 590 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  33.45 
 
 		 615 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  35.08 
 
 		 629 aa  188  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.03 
 
 		 582 aa  182  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  29.76 
 
 		 608 aa  180  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  29.2 
 
 		 614 aa  171  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  28.8 
 
 		 598 aa  170  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.53 
 
 		 587 aa  169  9e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  28.52 
 
 		 669 aa  169  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  31.74 
 
 		 597 aa  167  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0630  Chloride channel core  32.18 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  35.29 
 
 		 626 aa  154  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  32.55 
 
 		 600 aa  153  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  27.53 
 
 		 613 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  35.35 
 
 		 456 aa  151  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.3 
 
 		 580 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  28.49 
 
 		 569 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  31.67 
 
 		 584 aa  146  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  28.71 
 
 		 631 aa  146  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  31.81 
 
 		 402 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  31.96 
 
 		 470 aa  144  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  28.6 
 
 		 606 aa  144  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  28 
 
 		 602 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0957  Chloride channel core  35.44 
 
 		 615 aa  139  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  27.88 
 
 		 862 aa  136  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.2 
 
 		 591 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.4 
 
 		 575 aa  136  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.85 
 
 		 754 aa  135  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0815  voltage-gated chloride channel  36.18 
 
 		 590 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  27 
 
 		 605 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  26.14 
 
 		 603 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.49 
 
 		 577 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.08 
 
 		 598 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.27 
 
 		 589 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.27 
 
 		 589 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.27 
 
 		 589 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  28.39 
 
 		 627 aa  128  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  28.31 
 
 		 875 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  27.31 
 
 		 863 aa  126  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.86 
 
 		 594 aa  126  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  26.19 
 
 		 579 aa  125  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  28.37 
 
 		 897 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  32.76 
 
 		 640 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.44 
 
 		 591 aa  124  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.12 
 
 		 593 aa  124  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  28.57 
 
 		 859 aa  123  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  27.89 
 
 		 627 aa  123  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0814  voltage-gated chloride channel  31.54 
 
 		 461 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802011  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0956  Chloride channel core  31.54 
 
 		 461 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.97 
 
 		 589 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  26.71 
 
 		 617 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  24.57 
 
 		 598 aa  122  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.96 
 
 		 560 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.47 
 
 		 591 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.27 
 
 		 593 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.97 
 
 		 612 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.45 
 
 		 636 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.45 
 
 		 579 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.45 
 
 		 579 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.45 
 
 		 579 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  29.19 
 
 		 579 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>