More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0815 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0815  voltage-gated chloride channel  100 
 
 		 590 aa  1172    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0957  Chloride channel core  99.83 
 
 		 615 aa  1171    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  42.24 
 
 		 629 aa  388  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0630  Chloride channel core  46.82 
 
 		 475 aa  334  3e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6569  Cl- channel, voltage gated  56.56 
 
 		 420 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.458011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0956  Chloride channel core  40.55 
 
 		 461 aa  260  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0814  voltage-gated chloride channel  40.55 
 
 		 461 aa  260  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802011  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  44.03 
 
 		 584 aa  259  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  39.75 
 
 		 615 aa  256  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  37.78 
 
 		 626 aa  250  5e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  39.63 
 
 		 587 aa  250  5e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.57 
 
 		 582 aa  243  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  32.85 
 
 		 669 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  35.77 
 
 		 613 aa  233  6e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  40.94 
 
 		 600 aa  211  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  32.33 
 
 		 597 aa  201  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  33.82 
 
 		 606 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  32.31 
 
 		 604 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  33.25 
 
 		 470 aa  195  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  32.52 
 
 		 603 aa  194  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  35.2 
 
 		 606 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2674  CBS:Cl- channel, voltage gated  36.74 
 
 		 584 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6375  Chloride channel core  36.38 
 
 		 595 aa  191  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  31.76 
 
 		 600 aa  191  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0584  Cl- channel, voltage gated  36.59 
 
 		 637 aa  187  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  34.17 
 
 		 598 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2699  Chloride channel core  35.46 
 
 		 605 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  33.26 
 
 		 569 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2309  Chloride channel core  35.46 
 
 		 605 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76278  hitchhiker  0.00000714896 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4484  chloride channel core  31.88 
 
 		 605 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.44 
 
 		 594 aa  185  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4117  chloride channel core  33.46 
 
 		 595 aa  183  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2431  hypothetical protein  36.98 
 
 		 599 aa  183  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3967  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.17 
 
 		 595 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995893  normal  0.198047 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  32.46 
 
 		 608 aa  182  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  34.46 
 
 		 633 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  28.76 
 
 		 627 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  31.17 
 
 		 614 aa  180  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5761  chloride channel core  33.01 
 
 		 595 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3825  Cl- channel, voltage gated  33.01 
 
 		 595 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4543  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.01 
 
 		 595 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763229  normal  0.0966247 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4429  chloride channel core  31.89 
 
 		 595 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1302  Cl- channel, voltage gated  33.55 
 
 		 595 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719917  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  31.7 
 
 		 625 aa  178  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2094  Chloride channel core  31.76 
 
 		 603 aa  178  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  34.1 
 
 		 605 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0837  Chloride channel core  32.76 
 
 		 596 aa  174  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  31.11 
 
 		 613 aa  174  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  29.51 
 
 		 577 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0161  chloride channel (ClC) family protein  36.7 
 
 		 634 aa  173  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740673  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1199  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  36.7 
 
 		 634 aa  173  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.383794  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0439  chloride channel (ClC) family protein  36.7 
 
 		 634 aa  173  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.662875  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1401  chloride channel (ClC) family protein  36.7 
 
 		 623 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1138  chloride channel (ClC) family protein  36.7 
 
 		 634 aa  173  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1486  chloride channel (ClC) family protein  36.7 
 
 		 623 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  37.01 
 
 		 456 aa  169  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  30.41 
 
 		 631 aa  168  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  29.55 
 
 		 624 aa  167  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0005  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  36.6 
 
 		 590 aa  167  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3157  CBS domain-containing protein  32.7 
 
 		 593 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.687522  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.29 
 
 		 598 aa  166  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.48 
 
 		 754 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3930  voltage-gated chloride channel  36.55 
 
 		 599 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000147499 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  31.11 
 
 		 462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  29.11 
 
 		 543 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5812  chloride channel core  32.13 
 
 		 634 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468888 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  29.82 
 
 		 603 aa  161  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  28.84 
 
 		 640 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.7 
 
 		 580 aa  160  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3070  chloride channel core  34.12 
 
 		 590 aa  160  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal  0.0360231 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1397  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  37.24 
 
 		 618 aa  160  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.98 
 
 		 579 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.98 
 
 		 579 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.98 
 
 		 579 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.97 
 
 		 591 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.98 
 
 		 636 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0315  CBS domain-containing protein  32.38 
 
 		 609 aa  159  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  31.14 
 
 		 628 aa  158  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  34.04 
 
 		 402 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  33.51 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3462  CBS domain-containing protein  32.62 
 
 		 634 aa  155  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  32.67 
 
 		 863 aa  155  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  33.26 
 
 		 579 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  30.41 
 
 		 627 aa  154  5e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.33 
 
 		 575 aa  154  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.6 
 
 		 628 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  27.36 
 
 		 617 aa  153  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  30.17 
 
 		 605 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  28.12 
 
 		 585 aa  152  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  29.91 
 
 		 478 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  29.91 
 
 		 478 aa  151  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.77 
 
 		 620 aa  151  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  30 
 
 		 478 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.4 
 
 		 591 aa  151  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  30.43 
 
 		 473 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.6 
 
 		 577 aa  150  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  27.12 
 
 		 598 aa  149  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  30.43 
 
 		 473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  30.43 
 
 		 473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  31.15 
 
 		 586 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>