More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1750 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  83.62 
 
 		 579 aa  953    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  83.28 
 
 		 636 aa  954    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  83.62 
 
 		 579 aa  953    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  94.57 
 
 		 598 aa  1133    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  75.39 
 
 		 577 aa  863    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  83.1 
 
 		 628 aa  961    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  74.87 
 
 		 591 aa  861    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  76.08 
 
 		 591 aa  849    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  99.49 
 
 		 589 aa  1183    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  100 
 
 		 589 aa  1186    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  94.94 
 
 		 593 aa  1112    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  83.62 
 
 		 579 aa  953    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  94.23 
 
 		 589 aa  1073    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  99.49 
 
 		 589 aa  1183    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  95.28 
 
 		 593 aa  1116    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  44.65 
 
 		 591 aa  411  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  52.86 
 
 		 464 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  52.86 
 
 		 464 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  52.51 
 
 		 461 aa  405  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  51.43 
 
 		 471 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.10029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0516  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  35.45 
 
 		 601 aa  282  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132092  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  34.68 
 
 		 596 aa  280  7e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  32.06 
 
 		 614 aa  279  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  33.33 
 
 		 615 aa  277  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  35.73 
 
 		 560 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  32.04 
 
 		 595 aa  269  1e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  42.96 
 
 		 426 aa  261  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  31.48 
 
 		 613 aa  259  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  30.36 
 
 		 608 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  43.95 
 
 		 414 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  43.95 
 
 		 426 aa  241  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.34 
 
 		 582 aa  241  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3746  Cl- channel, voltage-gated family protein  42.6 
 
 		 414 aa  239  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  29.17 
 
 		 631 aa  238  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  31.38 
 
 		 627 aa  233  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  33.56 
 
 		 470 aa  232  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  30.53 
 
 		 627 aa  221  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  33.45 
 
 		 626 aa  219  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  31.37 
 
 		 624 aa  217  4e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  29.83 
 
 		 597 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.58 
 
 		 620 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  29.71 
 
 		 577 aa  211  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  30.14 
 
 		 628 aa  209  8e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  29.56 
 
 		 669 aa  208  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1666  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  38.24 
 
 		 418 aa  204  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2051  Chloride channel core  38.44 
 
 		 418 aa  204  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01561  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  38.24 
 
 		 418 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01551  hypothetical protein  38.24 
 
 		 418 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1800  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  38.24 
 
 		 418 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2038  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  38.24 
 
 		 418 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2303  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  38.24 
 
 		 418 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0264865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1592  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  38.97 
 
 		 429 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0733959 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1607  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  38.46 
 
 		 418 aa  201  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  32.64 
 
 		 590 aa  200  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1779  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  37.77 
 
 		 418 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  34.65 
 
 		 456 aa  199  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  29.01 
 
 		 625 aa  195  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  30.62 
 
 		 569 aa  194  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  33.12 
 
 		 600 aa  194  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1660  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  39.2 
 
 		 429 aa  193  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1682  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  39.2 
 
 		 429 aa  193  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.669275  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1601  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  39.2 
 
 		 429 aa  193  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.262233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  29.31 
 
 		 584 aa  191  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1849  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  39.37 
 
 		 417 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  25.78 
 
 		 603 aa  187  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  31.3 
 
 		 593 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  27.9 
 
 		 606 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  30.74 
 
 		 579 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  30.24 
 
 		 402 aa  182  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  33.33 
 
 		 543 aa  178  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.3 
 
 		 587 aa  177  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  33.03 
 
 		 564 aa  176  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  27.18 
 
 		 613 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2526  Chloride channel core  32.21 
 
 		 589 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0525  Cl- channel voltage-gated family protein  27.24 
 
 		 579 aa  172  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2439  chloride channel core protein  32.01 
 
 		 589 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590865  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  27.43 
 
 		 598 aa  170  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  30.73 
 
 		 562 aa  169  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  31.81 
 
 		 586 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1534  Cl- channel, voltage gated  30.65 
 
 		 527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.123029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  25 
 
 		 617 aa  163  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  26.2 
 
 		 602 aa  163  9e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  31.75 
 
 		 575 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  30.8 
 
 		 863 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.68 
 
 		 580 aa  160  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.81 
 
 		 591 aa  160  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  27.24 
 
 		 859 aa  160  7e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2161  chloride channel protein  26.46 
 
 		 594 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  27.71 
 
 		 640 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3883  chloride channel core  27.29 
 
 		 603 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  29.44 
 
 		 605 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.01 
 
 		 565 aa  154  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  25.09 
 
 		 598 aa  154  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3006  Chloride channel core  28.27 
 
 		 614 aa  154  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0264261  normal  0.0792273 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.58 
 
 		 575 aa  154  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2595  Cl- channel, voltage gated  30.75 
 
 		 544 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4857  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1772  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.12 
 
 		 585 aa  152  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  34.53 
 
 		 466 aa  151  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.47 
 
 		 612 aa  150  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  29.34 
 
 		 582 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>