More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3939 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5812  chloride channel core  65.59 
 
 
634 aa  635    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00468888 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  100 
 
 
600 aa  1193    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  60.59 
 
 
605 aa  662    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2094  Chloride channel core  65.47 
 
 
603 aa  692    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  72.1 
 
 
603 aa  853    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  72.1 
 
 
604 aa  854    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3157  CBS domain-containing protein  56.25 
 
 
593 aa  581  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.687522  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4484  chloride channel core  51.55 
 
 
605 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3462  CBS domain-containing protein  51.54 
 
 
634 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4117  chloride channel core  50.61 
 
 
595 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6375  Chloride channel core  49.48 
 
 
595 aa  490  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3967  Cl- channel, voltage-gated family protein  49.39 
 
 
595 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995893  normal  0.198047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5761  chloride channel core  49.22 
 
 
595 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0584  Cl- channel, voltage gated  47.95 
 
 
637 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3825  Cl- channel, voltage gated  49.22 
 
 
595 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722895  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0315  CBS domain-containing protein  51.4 
 
 
609 aa  482  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4429  chloride channel core  48.87 
 
 
595 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4543  Cl- channel, voltage-gated family protein  49.22 
 
 
595 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763229  normal  0.0966247 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2674  CBS:Cl- channel, voltage gated  50.09 
 
 
584 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1302  Cl- channel, voltage gated  49.04 
 
 
595 aa  478  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719917  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2699  Chloride channel core  50.36 
 
 
605 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0837  Chloride channel core  51.65 
 
 
596 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2309  Chloride channel core  50.36 
 
 
605 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76278  hitchhiker  0.00000714896 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1401  chloride channel (ClC) family protein  48.59 
 
 
623 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1486  chloride channel (ClC) family protein  48.59 
 
 
623 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3070  chloride channel core  52.35 
 
 
590 aa  465  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal  0.0360231 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1199  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  47.72 
 
 
634 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.383794  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0161  chloride channel (ClC) family protein  47.72 
 
 
634 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740673  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0439  chloride channel (ClC) family protein  47.72 
 
 
634 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.662875  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1138  chloride channel (ClC) family protein  47.72 
 
 
634 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0005  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  49.39 
 
 
590 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  47.68 
 
 
606 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  47.68 
 
 
633 aa  458  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1397  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  49 
 
 
618 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2431  hypothetical protein  51.8 
 
 
599 aa  444  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3930  voltage-gated chloride channel  49.22 
 
 
599 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000147499 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  40.54 
 
 
613 aa  395  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  32.29 
 
 
577 aa  244  3e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  30.8 
 
 
593 aa  212  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  28.66 
 
 
608 aa  199  9e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  30.99 
 
 
590 aa  197  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  29.11 
 
 
613 aa  188  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.83 
 
 
582 aa  183  8.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  31.97 
 
 
629 aa  182  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  27.44 
 
 
614 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.95 
 
 
587 aa  179  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  29.19 
 
 
615 aa  176  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  28.79 
 
 
569 aa  176  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  28.25 
 
 
669 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  30.17 
 
 
470 aa  174  5.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  31.27 
 
 
626 aa  170  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  29.35 
 
 
624 aa  170  9e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  30.53 
 
 
600 aa  169  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  29.08 
 
 
597 aa  168  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  27.9 
 
 
598 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.29 
 
 
620 aa  167  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  27.98 
 
 
627 aa  167  5e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  28.88 
 
 
584 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  25.7 
 
 
598 aa  162  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  26.81 
 
 
631 aa  161  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  26.22 
 
 
627 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  24.91 
 
 
617 aa  156  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.17 
 
 
580 aa  154  5e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  32.09 
 
 
402 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  26.19 
 
 
628 aa  145  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  26.83 
 
 
863 aa  144  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  29.6 
 
 
464 aa  144  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  25.12 
 
 
606 aa  144  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  29.6 
 
 
464 aa  144  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  25.94 
 
 
602 aa  143  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  27.12 
 
 
862 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  31.82 
 
 
456 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  22.87 
 
 
594 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.85 
 
 
612 aa  140  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.18 
 
 
579 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.18 
 
 
579 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.18 
 
 
636 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.48 
 
 
754 aa  138  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.18 
 
 
579 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.67 
 
 
598 aa  137  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.95 
 
 
461 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.39 
 
 
577 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.28 
 
 
628 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  25.14 
 
 
603 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.91 
 
 
575 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2520  Chloride channel core  26.95 
 
 
594 aa  133  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0630  Chloride channel core  28.07 
 
 
475 aa  132  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.79 
 
 
565 aa  132  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.2 
 
 
591 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  25.43 
 
 
595 aa  129  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  28.35 
 
 
586 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2595  Cl- channel, voltage gated  30.33 
 
 
544 aa  128  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4857  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.02 
 
 
589 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.02 
 
 
589 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.4 
 
 
591 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.02 
 
 
589 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.85 
 
 
593 aa  127  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  25.48 
 
 
605 aa  127  8.000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.43 
 
 
591 aa  127  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  22.32 
 
 
598 aa  126  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>