More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1084 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  100 
 
 
606 aa  1197    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4484  chloride channel core  51.1 
 
 
605 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6375  Chloride channel core  51.29 
 
 
595 aa  533  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4429  chloride channel core  50.61 
 
 
595 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4117  chloride channel core  50.09 
 
 
595 aa  527  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3967  Cl- channel, voltage-gated family protein  50.43 
 
 
595 aa  525  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995893  normal  0.198047 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1401  chloride channel (ClC) family protein  49.25 
 
 
623 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1486  chloride channel (ClC) family protein  49.25 
 
 
623 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5761  chloride channel core  49.83 
 
 
595 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1302  Cl- channel, voltage gated  49.57 
 
 
595 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719917  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2699  Chloride channel core  51.14 
 
 
605 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  50.51 
 
 
633 aa  518  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2309  Chloride channel core  51.31 
 
 
605 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76278  hitchhiker  0.00000714896 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0161  chloride channel (ClC) family protein  48.7 
 
 
634 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740673  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1199  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  48.7 
 
 
634 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.383794  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1138  chloride channel (ClC) family protein  48.7 
 
 
634 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0439  chloride channel (ClC) family protein  48.7 
 
 
634 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.662875  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3825  Cl- channel, voltage gated  49.66 
 
 
595 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4543  Cl- channel, voltage-gated family protein  49.66 
 
 
595 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763229  normal  0.0966247 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0837  Chloride channel core  50.34 
 
 
596 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0005  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  50.44 
 
 
590 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  48.5 
 
 
604 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2431  hypothetical protein  53.61 
 
 
599 aa  495  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  48.68 
 
 
603 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1397  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  48.92 
 
 
618 aa  491  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3930  voltage-gated chloride channel  50.43 
 
 
599 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000147499 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0584  Cl- channel, voltage gated  48.22 
 
 
637 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2674  CBS:Cl- channel, voltage gated  49.04 
 
 
584 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3070  chloride channel core  49.56 
 
 
590 aa  462  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal  0.0360231 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  47.68 
 
 
600 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  45.38 
 
 
605 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3157  CBS domain-containing protein  46.97 
 
 
593 aa  442  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.687522  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2094  Chloride channel core  45.54 
 
 
603 aa  445  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  42.76 
 
 
613 aa  434  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5812  chloride channel core  47.24 
 
 
634 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00468888 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3462  CBS domain-containing protein  44.65 
 
 
634 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0315  CBS domain-containing protein  44.01 
 
 
609 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  32.83 
 
 
577 aa  238  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  32.74 
 
 
593 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  33.39 
 
 
590 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  33.47 
 
 
629 aa  209  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.89 
 
 
582 aa  208  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  32.27 
 
 
631 aa  196  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  32.72 
 
 
669 aa  195  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  28.74 
 
 
608 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  29.95 
 
 
615 aa  192  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  28.12 
 
 
613 aa  191  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  29.24 
 
 
627 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  26.91 
 
 
614 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  31.25 
 
 
470 aa  184  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  32.13 
 
 
584 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  29.46 
 
 
598 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.36 
 
 
587 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  29.64 
 
 
626 aa  171  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.3 
 
 
580 aa  170  6e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  27.55 
 
 
627 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  29.98 
 
 
606 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  28.83 
 
 
624 aa  164  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  26.9 
 
 
617 aa  163  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  28.37 
 
 
628 aa  161  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.04 
 
 
620 aa  160  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  29.13 
 
 
600 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  30.02 
 
 
569 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  34.84 
 
 
456 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  27.3 
 
 
597 aa  155  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  24.95 
 
 
602 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  28.82 
 
 
582 aa  150  5e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0513  Chloride channel core  30.56 
 
 
421 aa  150  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  33.15 
 
 
402 aa  150  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.34 
 
 
594 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  30.41 
 
 
462 aa  147  6e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  25.85 
 
 
598 aa  146  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0630  Chloride channel core  28.1 
 
 
475 aa  145  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.37 
 
 
591 aa  144  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.37 
 
 
577 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  27.06 
 
 
605 aa  141  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.24 
 
 
612 aa  141  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  26.87 
 
 
579 aa  140  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.26 
 
 
598 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.21 
 
 
591 aa  138  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.06 
 
 
591 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  27.29 
 
 
586 aa  137  8e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.58 
 
 
754 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0957  Chloride channel core  30.63 
 
 
615 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2595  Cl- channel, voltage gated  30.46 
 
 
544 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4857  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.89 
 
 
591 aa  133  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.7 
 
 
593 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.7 
 
 
593 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  28.06 
 
 
595 aa  131  4.0000000000000003e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  26.09 
 
 
579 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0815  voltage-gated chloride channel  30.88 
 
 
590 aa  130  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  27.7 
 
 
605 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  25.48 
 
 
863 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.61 
 
 
589 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.13 
 
 
589 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.13 
 
 
589 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.15 
 
 
598 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3124  Cl- channel, voltage gated  29.14 
 
 
596 aa  127  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  25.21 
 
 
862 aa  126  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2728  Chloride channel core  29.47 
 
 
474 aa  126  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.969759  hitchhiker  0.00000000119016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>