More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5804 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  100 
 
 		 633 aa  1248    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  50.51 
 
 		 606 aa  519  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  47.24 
 
 		 604 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  46.97 
 
 		 603 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4484  chloride channel core  49.15 
 
 		 605 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6375  Chloride channel core  49.06 
 
 		 595 aa  471  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0584  Cl- channel, voltage gated  50.77 
 
 		 637 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2674  CBS:Cl- channel, voltage gated  51.29 
 
 		 584 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4117  chloride channel core  49.49 
 
 		 595 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3967  Cl- channel, voltage-gated family protein  48.63 
 
 		 595 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995893  normal  0.198047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  46.82 
 
 		 605 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4429  chloride channel core  48.14 
 
 		 595 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  47.78 
 
 		 600 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1302  Cl- channel, voltage gated  48.03 
 
 		 595 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719917  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5761  chloride channel core  48.45 
 
 		 595 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3825  Cl- channel, voltage gated  48.28 
 
 		 595 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4543  Cl- channel, voltage-gated family protein  48.28 
 
 		 595 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763229  normal  0.0966247 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2699  Chloride channel core  49.46 
 
 		 605 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2094  Chloride channel core  50.59 
 
 		 603 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2309  Chloride channel core  49.46 
 
 		 605 aa  442  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76278  hitchhiker  0.00000714896 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1486  chloride channel (ClC) family protein  47.15 
 
 		 623 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0837  Chloride channel core  49.32 
 
 		 596 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1401  chloride channel (ClC) family protein  47.15 
 
 		 623 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0439  chloride channel (ClC) family protein  46.78 
 
 		 634 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.662875  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1199  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  46.78 
 
 		 634 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.383794  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1138  chloride channel (ClC) family protein  46.78 
 
 		 634 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0161  chloride channel (ClC) family protein  46.78 
 
 		 634 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740673  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3157  CBS domain-containing protein  46.01 
 
 		 593 aa  432  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.687522  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2431  hypothetical protein  51.07 
 
 		 599 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0005  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  48.11 
 
 		 590 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1397  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  47.71 
 
 		 618 aa  429  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5812  chloride channel core  47.36 
 
 		 634 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468888 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3070  chloride channel core  48.96 
 
 		 590 aa  429  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal  0.0360231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3930  voltage-gated chloride channel  46.86 
 
 		 599 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000147499 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3462  CBS domain-containing protein  45.33 
 
 		 634 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  41.33 
 
 		 613 aa  391  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0315  CBS domain-containing protein  46.95 
 
 		 609 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  31.83 
 
 		 577 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.07 
 
 		 587 aa  188  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  28.9 
 
 		 606 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  30 
 
 		 615 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  33 
 
 		 600 aa  185  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  27.75 
 
 		 608 aa  182  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  28.55 
 
 		 669 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  29.31 
 
 		 629 aa  181  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  33.87 
 
 		 626 aa  180  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  31.5 
 
 		 590 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  30.95 
 
 		 593 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  31.71 
 
 		 470 aa  172  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  28.99 
 
 		 613 aa  171  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.49 
 
 		 620 aa  171  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  29.76 
 
 		 614 aa  170  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  30.49 
 
 		 584 aa  169  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.2 
 
 		 582 aa  167  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  31.56 
 
 		 631 aa  166  8e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  33.57 
 
 		 627 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.2 
 
 		 575 aa  160  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  30.23 
 
 		 598 aa  157  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  25.39 
 
 		 602 aa  154  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  32.8 
 
 		 597 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  32.08 
 
 		 627 aa  153  8.999999999999999e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  29.57 
 
 		 569 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  28.15 
 
 		 605 aa  153  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  33.18 
 
 		 624 aa  146  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.74 
 
 		 612 aa  141  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  26.56 
 
 		 617 aa  140  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  33.02 
 
 		 628 aa  140  8.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  27.8 
 
 		 462 aa  140  8.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.29 
 
 		 598 aa  140  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  27.01 
 
 		 579 aa  138  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.91 
 
 		 591 aa  137  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  29.92 
 
 		 402 aa  136  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  33 
 
 		 640 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  25.59 
 
 		 598 aa  135  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.59 
 
 		 577 aa  134  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.73 
 
 		 636 aa  133  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0815  voltage-gated chloride channel  33.18 
 
 		 590 aa  131  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.73 
 
 		 579 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.73 
 
 		 579 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0957  Chloride channel core  33.18 
 
 		 615 aa  131  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.79 
 
 		 593 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.73 
 
 		 579 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.79 
 
 		 593 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  31.58 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  31.58 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  31.58 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  31.58 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  31.58 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.06 
 
 		 589 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.82 
 
 		 589 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.82 
 
 		 589 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.8 
 
 		 628 aa  127  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  29.32 
 
 		 586 aa  127  5e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0513  Chloride channel core  30.42 
 
 		 421 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0630  Chloride channel core  27.61 
 
 		 475 aa  127  7e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  31.15 
 
 		 582 aa  126  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.45 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0956  Chloride channel core  28.44 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0814  voltage-gated chloride channel  28.44 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802011  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.62 
 
 		 565 aa  125  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.345027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>