More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2054 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  100 
 
 
565 aa  1103    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  39.15 
 
 
543 aa  301  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  39.26 
 
 
562 aa  289  9e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.5 
 
 
582 aa  287  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  36.51 
 
 
564 aa  271  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1534  Cl- channel, voltage gated  41.39 
 
 
527 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.123029  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  33.99 
 
 
615 aa  231  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.54 
 
 
587 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  35.8 
 
 
600 aa  210  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  28.18 
 
 
614 aa  207  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.61 
 
 
591 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  31.37 
 
 
569 aa  196  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.63 
 
 
628 aa  195  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.29 
 
 
636 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.03 
 
 
579 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.03 
 
 
579 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.03 
 
 
579 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.07 
 
 
593 aa  194  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.96 
 
 
598 aa  193  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  29.05 
 
 
597 aa  192  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  29.64 
 
 
627 aa  192  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.85 
 
 
593 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  32.2 
 
 
669 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  32.24 
 
 
613 aa  191  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.24 
 
 
589 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.24 
 
 
589 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.24 
 
 
589 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  29.56 
 
 
470 aa  187  5e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.6 
 
 
589 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1772  Cl- channel, voltage-gated family protein  42.12 
 
 
585 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  30.47 
 
 
624 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  35.51 
 
 
626 aa  183  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  33.7 
 
 
456 aa  183  7e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  29.41 
 
 
631 aa  182  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  33.73 
 
 
584 aa  182  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.59 
 
 
577 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.18 
 
 
591 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  30.84 
 
 
628 aa  181  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  28.46 
 
 
608 aa  179  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.02 
 
 
575 aa  179  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  29.45 
 
 
577 aa  178  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.85 
 
 
620 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  33.73 
 
 
640 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  34.09 
 
 
575 aa  174  5.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  30.61 
 
 
598 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.89 
 
 
591 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.18 
 
 
461 aa  169  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  31.02 
 
 
464 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  31.02 
 
 
464 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  30.79 
 
 
627 aa  167  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.84 
 
 
591 aa  166  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  28.33 
 
 
602 aa  164  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  31.94 
 
 
471 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.10029 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  31.3 
 
 
606 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  30.85 
 
 
402 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2374  Chloride channel core  33.02 
 
 
596 aa  158  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124913  decreased coverage  0.00191401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2134  Chloride channel core  33.49 
 
 
596 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262546  normal  0.105647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  32.58 
 
 
602 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  27.47 
 
 
590 aa  156  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.12 
 
 
580 aa  156  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0490  voltage gated chloride channel family protein  30.09 
 
 
596 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.889673  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3300  Cl- channel, voltage gated  31.15 
 
 
585 aa  154  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0616826  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  32.58 
 
 
579 aa  152  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0604  chloride channel core  31.82 
 
 
597 aa  150  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3883  chloride channel core  31.41 
 
 
603 aa  150  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2859  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.84 
 
 
606 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5810  Chloride channel core  32.97 
 
 
606 aa  148  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.688487  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  28.04 
 
 
603 aa  148  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5245  chloride channel core  32.65 
 
 
606 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  decreased coverage  0.00444672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  31.66 
 
 
605 aa  147  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.71 
 
 
754 aa  146  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2144  Cl- channel voltage-gated family protein  29.32 
 
 
604 aa  146  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  29.57 
 
 
629 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.01 
 
 
426 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  28 
 
 
633 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  31.79 
 
 
585 aa  144  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  26.13 
 
 
613 aa  144  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  28.2 
 
 
604 aa  143  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2747  CLC-type chloride channel protein  28.38 
 
 
595 aa  143  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171436  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  30.15 
 
 
593 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3006  Chloride channel core  31.33 
 
 
614 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0264261  normal  0.0792273 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  30.59 
 
 
600 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  27.76 
 
 
559 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  30.3 
 
 
586 aa  141  3.9999999999999997e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1483  Chloride channel core  34.11 
 
 
628 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  31.02 
 
 
579 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2902  Chloride channel core  32.45 
 
 
614 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452389  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2779  chloride channel core  30.58 
 
 
649 aa  137  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.674097  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1650  Chloride channel core  33.42 
 
 
604 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  29.93 
 
 
473 aa  137  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  29.93 
 
 
473 aa  137  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  29.93 
 
 
473 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  29.93 
 
 
473 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  29.93 
 
 
473 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2161  chloride channel protein  30.5 
 
 
594 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  31.28 
 
 
471 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  30.41 
 
 
462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2181  Cl- channel voltage-gated family protein  34.67 
 
 
634 aa  129  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3124  Cl- channel, voltage gated  32.27 
 
 
596 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1634  Chloride channel core  30.38 
 
 
601 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0200608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>