More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3967 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2431  hypothetical protein  70.44 
 
 
599 aa  707    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4429  chloride channel core  98.66 
 
 
595 aa  1163    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0837  Chloride channel core  80.1 
 
 
596 aa  820    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1199  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  73.42 
 
 
634 aa  826    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.383794  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2699  Chloride channel core  69.58 
 
 
605 aa  730    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0439  chloride channel (ClC) family protein  73.42 
 
 
634 aa  826    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.662875  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2674  CBS:Cl- channel, voltage gated  65.17 
 
 
584 aa  684    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1486  chloride channel (ClC) family protein  74.48 
 
 
623 aa  828    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0005  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  75.17 
 
 
590 aa  792    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1302  Cl- channel, voltage gated  94.45 
 
 
595 aa  1054    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719917  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2309  Chloride channel core  69.41 
 
 
605 aa  728    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76278  hitchhiker  0.00000714896 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1397  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  76.46 
 
 
618 aa  814    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3930  voltage-gated chloride channel  77.16 
 
 
599 aa  766    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000147499 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0584  Cl- channel, voltage gated  65.98 
 
 
637 aa  694    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3825  Cl- channel, voltage gated  93.61 
 
 
595 aa  1050    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722895  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1401  chloride channel (ClC) family protein  74.72 
 
 
623 aa  828    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4484  chloride channel core  77.66 
 
 
605 aa  844    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4117  chloride channel core  91.6 
 
 
595 aa  1041    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3967  Cl- channel, voltage-gated family protein  100 
 
 
595 aa  1176    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995893  normal  0.198047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5761  chloride channel core  93.95 
 
 
595 aa  1056    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6375  Chloride channel core  69.79 
 
 
595 aa  755    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4543  Cl- channel, voltage-gated family protein  93.61 
 
 
595 aa  1050    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763229  normal  0.0966247 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0161  chloride channel (ClC) family protein  73.42 
 
 
634 aa  826    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740673  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1138  chloride channel (ClC) family protein  73.42 
 
 
634 aa  826    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  51.38 
 
 
604 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  50.43 
 
 
606 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  50.87 
 
 
603 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  49.39 
 
 
600 aa  485  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3157  CBS domain-containing protein  50.87 
 
 
593 aa  479  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.687522  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  50.78 
 
 
605 aa  481  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2094  Chloride channel core  51.2 
 
 
603 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  48.63 
 
 
633 aa  455  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5812  chloride channel core  51.71 
 
 
634 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00468888 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  43.81 
 
 
613 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3070  chloride channel core  49.15 
 
 
590 aa  434  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal  0.0360231 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3462  CBS domain-containing protein  48.36 
 
 
634 aa  424  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0315  CBS domain-containing protein  48.4 
 
 
609 aa  415  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  31.65 
 
 
577 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  32.34 
 
 
629 aa  204  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  32 
 
 
590 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  31.35 
 
 
593 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  28.11 
 
 
608 aa  189  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  31.05 
 
 
669 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.97 
 
 
587 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.02 
 
 
582 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  28.04 
 
 
598 aa  174  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  32.15 
 
 
615 aa  171  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  31.84 
 
 
600 aa  168  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  36.77 
 
 
626 aa  167  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  30.02 
 
 
597 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  27.86 
 
 
613 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  26.67 
 
 
614 aa  154  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  31.29 
 
 
584 aa  154  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.61 
 
 
754 aa  150  8e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.8 
 
 
580 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  30.83 
 
 
470 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  34.2 
 
 
456 aa  148  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  27.17 
 
 
606 aa  146  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0956  Chloride channel core  31.29 
 
 
461 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0814  voltage-gated chloride channel  31.29 
 
 
461 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  31.09 
 
 
402 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0630  Chloride channel core  30.23 
 
 
475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  25.37 
 
 
598 aa  141  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  26.24 
 
 
569 aa  140  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  24.96 
 
 
631 aa  137  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.98 
 
 
591 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.48 
 
 
598 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  28.17 
 
 
627 aa  135  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4920  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.96 
 
 
426 aa  134  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.73 
 
 
612 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  27.51 
 
 
862 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0957  Chloride channel core  31.38 
 
 
615 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.05 
 
 
593 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.05 
 
 
593 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0815  voltage-gated chloride channel  31.38 
 
 
590 aa  131  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  26.17 
 
 
602 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.28 
 
 
589 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.28 
 
 
589 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.57 
 
 
577 aa  130  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.24 
 
 
591 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.28 
 
 
589 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6569  Cl- channel, voltage gated  35.99 
 
 
420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.458011  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.46 
 
 
575 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.13 
 
 
589 aa  127  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  27.27 
 
 
579 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  24.51 
 
 
579 aa  124  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  26.11 
 
 
859 aa  124  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.63 
 
 
560 aa  124  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  29.47 
 
 
859 aa  123  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  28.73 
 
 
627 aa  123  9e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  27.4 
 
 
562 aa  123  9e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.04 
 
 
594 aa  123  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  25.5 
 
 
586 aa  123  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  25.66 
 
 
863 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.35 
 
 
620 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  29.43 
 
 
582 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25 
 
 
591 aa  120  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  24.87 
 
 
617 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.49 
 
 
636 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.49 
 
 
579 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>