More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0814 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0814  voltage-gated chloride channel  100 
 
 		 461 aa  913    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802011  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0956  Chloride channel core  100 
 
 		 461 aa  913    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  39.18 
 
 		 629 aa  288  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0630  Chloride channel core  33.69 
 
 		 475 aa  209  1e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0815  voltage-gated chloride channel  39.91 
 
 		 590 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0957  Chloride channel core  39.64 
 
 		 615 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.56 
 
 		 587 aa  192  9e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  35.25 
 
 		 615 aa  179  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  35.76 
 
 		 626 aa  177  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  34.54 
 
 		 608 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.41 
 
 		 754 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6569  Cl- channel, voltage gated  42.33 
 
 		 420 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.458011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  31.47 
 
 		 598 aa  171  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  34.72 
 
 		 600 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  32.8 
 
 		 669 aa  170  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  31.54 
 
 		 613 aa  169  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  30.41 
 
 		 462 aa  167  4e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  30.09 
 
 		 457 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  31.52 
 
 		 614 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  32 
 
 		 606 aa  160  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  31.18 
 
 		 613 aa  160  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.47 
 
 		 594 aa  157  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  30.71 
 
 		 470 aa  155  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  31.22 
 
 		 598 aa  151  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  32.72 
 
 		 584 aa  151  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.36 
 
 		 580 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  30.75 
 
 		 586 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.24 
 
 		 582 aa  147  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  33.03 
 
 		 597 aa  146  9e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  32.24 
 
 		 625 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4484  chloride channel core  30.19 
 
 		 605 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5761  chloride channel core  31.59 
 
 		 595 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3825  Cl- channel, voltage gated  31.52 
 
 		 595 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4543  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.52 
 
 		 595 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763229  normal  0.0966247 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3967  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.36 
 
 		 595 aa  143  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995893  normal  0.198047 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  31.05 
 
 		 582 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4429  chloride channel core  31.29 
 
 		 595 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  31.48 
 
 		 627 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1302  Cl- channel, voltage gated  30.66 
 
 		 595 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719917  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  31.51 
 
 		 605 aa  139  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  27.32 
 
 		 603 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  27.55 
 
 		 604 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  29.49 
 
 		 633 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0357  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.79 
 
 		 588 aa  138  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4117  chloride channel core  30.91 
 
 		 595 aa  137  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  34.1 
 
 		 638 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  30.52 
 
 		 585 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.19 
 
 		 612 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  29.19 
 
 		 600 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.62 
 
 		 591 aa  134  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3930  voltage-gated chloride channel  31.39 
 
 		 599 aa  134  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000147499 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.23 
 
 		 598 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.61 
 
 		 598 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  31.84 
 
 		 640 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  32.65 
 
 		 577 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  31.52 
 
 		 533 aa  129  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  31.2 
 
 		 402 aa  129  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  32.21 
 
 		 651 aa  129  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  34.44 
 
 		 612 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.66 
 
 		 591 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  34.44 
 
 		 634 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2699  Chloride channel core  30.02 
 
 		 605 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  27.59 
 
 		 617 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2431  hypothetical protein  31.46 
 
 		 599 aa  128  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  29.46 
 
 		 602 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.93 
 
 		 575 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2309  Chloride channel core  29.57 
 
 		 605 aa  126  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76278  hitchhiker  0.00000714896 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  33.11 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2674  CBS:Cl- channel, voltage gated  28.74 
 
 		 584 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.21 
 
 		 577 aa  126  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  30.28 
 
 		 466 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  28.04 
 
 		 569 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6375  Chloride channel core  30.79 
 
 		 595 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.28 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  27 
 
 		 603 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  27.13 
 
 		 606 aa  124  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0837  Chloride channel core  31.59 
 
 		 596 aa  123  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.03 
 
 		 628 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.66 
 
 		 620 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1039  Chloride channel core  33.26 
 
 		 453 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.03 
 
 		 579 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.03 
 
 		 579 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.03 
 
 		 636 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.03 
 
 		 579 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  29.4 
 
 		 631 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.21 
 
 		 589 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  35.54 
 
 		 605 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.21 
 
 		 589 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.21 
 
 		 589 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2094  Chloride channel core  28.54 
 
 		 603 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5812  chloride channel core  30.08 
 
 		 634 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468888 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1486  chloride channel (ClC) family protein  30.06 
 
 		 623 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1401  chloride channel (ClC) family protein  30.06 
 
 		 623 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1199  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  30.28 
 
 		 634 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.383794  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1138  chloride channel (ClC) family protein  30.28 
 
 		 634 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0439  chloride channel (ClC) family protein  30.28 
 
 		 634 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.662875  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0161  chloride channel (ClC) family protein  30.28 
 
 		 634 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740673  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.74 
 
 		 591 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.8 
 
 		 612 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0584  Cl- channel, voltage gated  29.82 
 
 		 637 aa  117  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>