More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1327 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  100 
 
 
579 aa  1150    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  35.21 
 
 
585 aa  260  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3300  Cl- channel, voltage gated  34.13 
 
 
585 aa  246  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0616826  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2144  Cl- channel voltage-gated family protein  37.41 
 
 
604 aa  233  5e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.82 
 
 
575 aa  229  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.45 
 
 
591 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2817  Cl- channel, voltage gated  32.96 
 
 
574 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2978  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.29 
 
 
574 aa  189  9e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  36.23 
 
 
575 aa  188  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  29.37 
 
 
559 aa  187  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0983  chloride channel core  35.58 
 
 
573 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20295  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4624  voltage-gated chloride channel  33.72 
 
 
574 aa  172  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01599  putative Voltage-gated ClC-type chloride channel clcA  31.41 
 
 
538 aa  170  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1201  chloride channel core  33.18 
 
 
575 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000459194 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1093  Cl-channel, voltage-gated family protein  31 
 
 
569 aa  161  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00228292  decreased coverage  0.00554461 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1121  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.56 
 
 
574 aa  161  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1015  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.08 
 
 
569 aa  161  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.411818  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1161  chloride channel core  33.11 
 
 
574 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.541504  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3151  Chloride channel core  33.11 
 
 
574 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1206  chloride channel core  33.11 
 
 
574 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1239  chloride channel core  33.11 
 
 
574 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.675776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1302  chloride channel  33.99 
 
 
574 aa  155  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0841  chloride channel  31.58 
 
 
571 aa  151  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.690246 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  27.9 
 
 
614 aa  150  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2891  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.11 
 
 
574 aa  150  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0598145  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2973  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.11 
 
 
574 aa  150  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000658505 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3069  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.11 
 
 
574 aa  150  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.724246  hitchhiker  0.00000035598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  27.75 
 
 
613 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  30.82 
 
 
470 aa  139  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.43 
 
 
582 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  29.21 
 
 
608 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  29.74 
 
 
669 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.17 
 
 
587 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  26.92 
 
 
633 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  25.83 
 
 
606 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.97 
 
 
580 aa  124  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.73 
 
 
565 aa  123  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  30.86 
 
 
577 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  27.27 
 
 
602 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.6 
 
 
598 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  26.04 
 
 
625 aa  117  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  28.6 
 
 
626 aa  117  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  23.69 
 
 
595 aa  116  8.999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  31.29 
 
 
471 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  25.49 
 
 
603 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  25.69 
 
 
604 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  28.57 
 
 
606 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  28.2 
 
 
615 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  28.79 
 
 
569 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  24.4 
 
 
613 aa  114  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.11 
 
 
589 aa  113  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  27.4 
 
 
538 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2309  Chloride channel core  26.19 
 
 
605 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76278  hitchhiker  0.00000714896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  29.67 
 
 
600 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4117  chloride channel core  25.18 
 
 
595 aa  111  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0315  CBS domain-containing protein  24.16 
 
 
609 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  23.85 
 
 
600 aa  110  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3462  CBS domain-containing protein  24.06 
 
 
634 aa  109  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  29.93 
 
 
470 aa  109  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.36 
 
 
560 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  24.93 
 
 
519 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3967  Cl- channel, voltage-gated family protein  25 
 
 
595 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995893  normal  0.198047 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2431  hypothetical protein  26.19 
 
 
599 aa  108  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5761  chloride channel core  24.73 
 
 
595 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2699  Chloride channel core  25.93 
 
 
605 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  27.33 
 
 
627 aa  107  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4429  chloride channel core  27.08 
 
 
595 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3825  Cl- channel, voltage gated  24.91 
 
 
595 aa  107  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4543  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.91 
 
 
595 aa  107  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763229  normal  0.0966247 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3070  chloride channel core  26.44 
 
 
590 aa  106  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal  0.0360231 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  25.76 
 
 
603 aa  106  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  27.36 
 
 
605 aa  106  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3157  CBS domain-containing protein  24.54 
 
 
593 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.687522  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2674  CBS:Cl- channel, voltage gated  25.42 
 
 
584 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  24.36 
 
 
519 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  29.51 
 
 
629 aa  104  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  28.16 
 
 
473 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.14 
 
 
593 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.14 
 
 
593 aa  104  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1302  Cl- channel, voltage gated  26.63 
 
 
595 aa  104  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719917  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  28.16 
 
 
473 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  28.16 
 
 
473 aa  104  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  28.16 
 
 
473 aa  104  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  28.16 
 
 
473 aa  104  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.89 
 
 
589 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.89 
 
 
589 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  31.63 
 
 
539 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  26.67 
 
 
579 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.89 
 
 
589 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  29.68 
 
 
590 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  25.72 
 
 
563 aa  101  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0584  Cl- channel, voltage gated  25 
 
 
637 aa  100  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  29.02 
 
 
593 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  25 
 
 
598 aa  100  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3930  voltage-gated chloride channel  26.85 
 
 
599 aa  99.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000147499 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  25.95 
 
 
562 aa  99  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4484  chloride channel core  25.13 
 
 
605 aa  99  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0525  Cl- channel voltage-gated family protein  28.64 
 
 
579 aa  99.4  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  26.35 
 
 
512 aa  99.4  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.47 
 
 
526 aa  99.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>