More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3157 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3157  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 593 aa  1152    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.687522  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  57.47 
 
 		 604 aa  632  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  56.6 
 
 		 603 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  56.25 
 
 		 600 aa  585  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2094  Chloride channel core  56.99 
 
 		 603 aa  585  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  55.96 
 
 		 605 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5812  chloride channel core  58.38 
 
 		 634 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468888 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4484  chloride channel core  49.48 
 
 		 605 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3967  Cl- channel, voltage-gated family protein  50.87 
 
 		 595 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995893  normal  0.198047 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4117  chloride channel core  50.43 
 
 		 595 aa  488  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5761  chloride channel core  50.17 
 
 		 595 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4429  chloride channel core  50.52 
 
 		 595 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3825  Cl- channel, voltage gated  50.17 
 
 		 595 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4543  Cl- channel, voltage-gated family protein  50.17 
 
 		 595 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763229  normal  0.0966247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1302  Cl- channel, voltage gated  49.4 
 
 		 595 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719917  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6375  Chloride channel core  49.3 
 
 		 595 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2674  CBS:Cl- channel, voltage gated  47.85 
 
 		 584 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0837  Chloride channel core  49.57 
 
 		 596 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2699  Chloride channel core  50.98 
 
 		 605 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2309  Chloride channel core  50.98 
 
 		 605 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76278  hitchhiker  0.00000714896 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0584  Cl- channel, voltage gated  47.33 
 
 		 637 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3070  chloride channel core  49.4 
 
 		 590 aa  444  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal  0.0360231 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  46.97 
 
 		 606 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1401  chloride channel (ClC) family protein  47.15 
 
 		 623 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1486  chloride channel (ClC) family protein  47.32 
 
 		 623 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2431  hypothetical protein  52.56 
 
 		 599 aa  439  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1199  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  46.46 
 
 		 634 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.383794  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0439  chloride channel (ClC) family protein  46.46 
 
 		 634 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.662875  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1138  chloride channel (ClC) family protein  46.46 
 
 		 634 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0161  chloride channel (ClC) family protein  46.46 
 
 		 634 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740673  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3462  CBS domain-containing protein  47.88 
 
 		 634 aa  435  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0005  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  48.42 
 
 		 590 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3930  voltage-gated chloride channel  49.48 
 
 		 599 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000147499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  46.01 
 
 		 633 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0315  CBS domain-containing protein  48.09 
 
 		 609 aa  426  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1397  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  48.84 
 
 		 618 aa  429  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  39.86 
 
 		 613 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  29.04 
 
 		 577 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  32.81 
 
 		 615 aa  196  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  32.17 
 
 		 629 aa  193  8e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.85 
 
 		 582 aa  190  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  29.31 
 
 		 614 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  31.54 
 
 		 593 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  29.58 
 
 		 669 aa  183  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  30.12 
 
 		 608 aa  180  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  28.99 
 
 		 613 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  30.69 
 
 		 597 aa  178  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  27.93 
 
 		 598 aa  177  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  31.57 
 
 		 590 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  28.36 
 
 		 606 aa  174  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  32.99 
 
 		 470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  30.12 
 
 		 626 aa  161  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  29.13 
 
 		 600 aa  160  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  27.15 
 
 		 602 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.72 
 
 		 587 aa  159  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.19 
 
 		 580 aa  158  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  27.87 
 
 		 569 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.06 
 
 		 754 aa  157  6e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  31.3 
 
 		 584 aa  154  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  27.31 
 
 		 631 aa  153  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.8 
 
 		 620 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  32.8 
 
 		 402 aa  147  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  29.56 
 
 		 627 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  32.95 
 
 		 456 aa  140  7e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  28.84 
 
 		 603 aa  140  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.53 
 
 		 594 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.79 
 
 		 612 aa  138  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  23.46 
 
 		 598 aa  136  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.67 
 
 		 598 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  25 
 
 		 605 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.24 
 
 		 591 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  30.42 
 
 		 897 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  28.28 
 
 		 605 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.29 
 
 		 579 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  27.43 
 
 		 617 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.29 
 
 		 579 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  27.13 
 
 		 624 aa  131  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.29 
 
 		 579 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.29 
 
 		 636 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  24.96 
 
 		 603 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1431  Chloride channel core  26.95 
 
 		 605 aa  130  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.89 
 
 		 591 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.1 
 
 		 591 aa  130  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  26.25 
 
 		 627 aa  130  8.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  27.62 
 
 		 586 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.73 
 
 		 577 aa  127  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  31.13 
 
 		 640 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.05 
 
 		 628 aa  127  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0630  Chloride channel core  28.12 
 
 		 475 aa  126  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  24.81 
 
 		 863 aa  124  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.6 
 
 		 598 aa  123  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.51 
 
 		 560 aa  123  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2485  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.46 
 
 		 603 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0513  Chloride channel core  30.74 
 
 		 421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.73 
 
 		 589 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.55 
 
 		 589 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.55 
 
 		 589 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.09 
 
 		 593 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.09 
 
 		 593 aa  120  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.82 
 
 		 575 aa  120  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>