More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1130 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0552  Chloride channel core  61.54 
 
 		 614 aa  778    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  100 
 
 		 617 aa  1246    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  42.08 
 
 		 594 aa  481  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  43.21 
 
 		 598 aa  461  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  34.36 
 
 		 598 aa  342  1e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2520  Chloride channel core  34.88 
 
 		 594 aa  335  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  27.75 
 
 		 608 aa  213  7.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4920  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.99 
 
 		 426 aa  192  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  29.97 
 
 		 584 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  29.23 
 
 		 577 aa  177  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  29 
 
 		 470 aa  177  4e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  27.15 
 
 		 603 aa  176  8e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  26.42 
 
 		 613 aa  177  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  27.09 
 
 		 606 aa  171  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.17 
 
 		 598 aa  171  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  27.63 
 
 		 631 aa  170  8e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  23.78 
 
 		 614 aa  170  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  26.21 
 
 		 602 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.18 
 
 		 589 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  27.86 
 
 		 598 aa  165  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  29.06 
 
 		 597 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.33 
 
 		 579 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.33 
 
 		 579 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.33 
 
 		 636 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.33 
 
 		 579 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5286  Chloride channel core  31.88 
 
 		 431 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  26.18 
 
 		 669 aa  161  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.51 
 
 		 582 aa  160  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.68 
 
 		 593 aa  160  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.67 
 
 		 628 aa  160  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.68 
 
 		 593 aa  160  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.02 
 
 		 591 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  27.59 
 
 		 627 aa  157  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25 
 
 		 589 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.17 
 
 		 589 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.17 
 
 		 589 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  27.23 
 
 		 615 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  26.8 
 
 		 626 aa  154  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  27.87 
 
 		 627 aa  154  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  27.43 
 
 		 628 aa  154  5.9999999999999996e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  26.95 
 
 		 605 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  25.98 
 
 		 625 aa  150  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.72 
 
 		 587 aa  150  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  26.09 
 
 		 629 aa  148  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.67 
 
 		 620 aa  147  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  26.34 
 
 		 613 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  27.22 
 
 		 605 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  25.9 
 
 		 604 aa  145  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  27.18 
 
 		 624 aa  141  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  25.86 
 
 		 603 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.96 
 
 		 577 aa  140  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.65 
 
 		 591 aa  140  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  26.98 
 
 		 606 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.58 
 
 		 612 aa  134  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2094  Chloride channel core  27.02 
 
 		 603 aa  133  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  24.74 
 
 		 600 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  32.82 
 
 		 462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  25.69 
 
 		 590 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  26.84 
 
 		 651 aa  130  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1369  Chloride channel core  27.85 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  26.07 
 
 		 593 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  27.04 
 
 		 859 aa  129  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.81 
 
 		 591 aa  127  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  24.2 
 
 		 596 aa  127  8.000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  25 
 
 		 582 aa  126  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  30.1 
 
 		 402 aa  124  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  25.47 
 
 		 600 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  28.47 
 
 		 464 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  28.47 
 
 		 464 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2971  Chloride channel core  25.36 
 
 		 605 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  27.29 
 
 		 586 aa  122  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  25.28 
 
 		 640 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  26.24 
 
 		 603 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.1 
 
 		 582 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  26.56 
 
 		 633 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  26.33 
 
 		 863 aa  119  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0191  chloride channel core  24.9 
 
 		 635 aa  118  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  24.05 
 
 		 579 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  25.4 
 
 		 595 aa  115  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3070  chloride channel core  26.57 
 
 		 590 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal  0.0360231 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2485  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.51 
 
 		 603 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  25.86 
 
 		 862 aa  115  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  26.16 
 
 		 543 aa  115  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.11 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.93 
 
 		 426 aa  113  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.93 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1257  chloride channel-like  26.73 
 
 		 615 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.95023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  23.87 
 
 		 585 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3157  CBS domain-containing protein  26.15 
 
 		 593 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.687522  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6375  Chloride channel core  27.38 
 
 		 595 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.86 
 
 		 580 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  22.56 
 
 		 602 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.96 
 
 		 426 aa  110  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2699  Chloride channel core  26.85 
 
 		 605 aa  110  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0292  chloride channel core protein  27.72 
 
 		 455 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158347  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  24.96 
 
 		 875 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0315  CBS domain-containing protein  24.1 
 
 		 609 aa  110  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2309  Chloride channel core  26.85 
 
 		 605 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76278  hitchhiker  0.00000714896 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.96 
 
 		 754 aa  107  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3462  CBS domain-containing protein  23.79 
 
 		 634 aa  107  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>