More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0292 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0292  chloride channel core protein  100 
 
 		 455 aa  903    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0274  Chloride channel core  95.6 
 
 		 455 aa  834    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3273  Cl- channel, voltage-gated family protein  65.86 
 
 		 481 aa  565  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2620  Cl- channel voltage-gated family protein  40.52 
 
 		 452 aa  305  8.000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1160  chloride channel core  43.98 
 
 		 494 aa  301  1e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1732  chloride channel core  38.77 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4619  voltage-gated chloride channel family protein  39.61 
 
 		 452 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1486  Cl- channel, voltage gated  39.61 
 
 		 448 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4094  Chloride channel core  36.58 
 
 		 426 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.089965  normal  0.148511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3981  Chloride channel core  36.58 
 
 		 426 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0556  voltage gated chloride channel family protein  35.24 
 
 		 437 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01048  Cl- channel, voltage gated  37.31 
 
 		 443 aa  224  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371868  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06118  Cl- channel, voltage gated  37.31 
 
 		 443 aa  224  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0570  voltage-gated chloride channel family protein  36.18 
 
 		 437 aa  223  7e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0545  Chloride channel core  33.17 
 
 		 417 aa  219  6e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0459516  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  34.19 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2064  chloride channel core  38.59 
 
 		 440 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0178242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1803  hypothetical protein  40.12 
 
 		 431 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2302  Cl- channel, voltage gated  35.16 
 
 		 413 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0508  voltage-gated chloride channel  35.68 
 
 		 435 aa  206  7e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4570  Cl- channel, voltage gated  35.41 
 
 		 413 aa  206  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3793  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.41 
 
 		 413 aa  206  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258404  normal  0.231279 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3731  chloride channel core  35.41 
 
 		 413 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.597122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  33.92 
 
 		 436 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5519  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.91 
 
 		 413 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720023  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3685  chloride channel core  34.91 
 
 		 468 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.36379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0837  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.56 
 
 		 462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0961  voltage-gated chloride channel  36.25 
 
 		 435 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3539  Chloride channel core  36.59 
 
 		 415 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0261  voltage-gated chloride channel  35.61 
 
 		 427 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0225  voltage-gated chloride channel  35.61 
 
 		 427 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1406  voltage-gated chloride channel  35.61 
 
 		 427 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1603  voltage-gated chloride channel  35.61 
 
 		 436 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845541  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2677  chloride channel (ClC) family protein  35.61 
 
 		 435 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267166  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4940  chloride channel core  35.16 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530885 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1136  hypothetical protein  34.92 
 
 		 482 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0839262  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2534  chloride channel (ClC) family protein  36 
 
 		 435 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2639  Chloride channel core  38.2 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.311853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2371  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.89 
 
 		 418 aa  182  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.596743  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4018  Chloride channel core  31.4 
 
 		 453 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1026  chloride channel core  35.51 
 
 		 421 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.724519  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2367  Chloride channel core  35.91 
 
 		 438 aa  169  7e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  36.83 
 
 		 606 aa  169  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  35.65 
 
 		 598 aa  168  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  32.02 
 
 		 582 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  33 
 
 		 754 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  32.75 
 
 		 462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.78 
 
 		 580 aa  158  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  34.12 
 
 		 586 aa  153  5.9999999999999996e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0357  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.42 
 
 		 588 aa  150  6e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.05 
 
 		 582 aa  146  9e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  33.78 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  36.29 
 
 		 669 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  31.32 
 
 		 625 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2180  Cl- channel, voltage gated  30.15 
 
 		 435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000426596  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.89 
 
 		 612 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0541  voltage-gated chloride channel family protein  30.75 
 
 		 398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1145  chloride channel protein EriC  31.27 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000190492  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2595  Cl- channel, voltage gated  32.52 
 
 		 544 aa  128  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4857  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  30.93 
 
 		 651 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  30.58 
 
 		 602 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  30.45 
 
 		 470 aa  124  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.5 
 
 		 612 aa  123  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1199  chloride channel protein EriC  26.07 
 
 		 403 aa  117  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  34.15 
 
 		 456 aa  116  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.43 
 
 		 582 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  27.21 
 
 		 617 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  29.95 
 
 		 629 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  32.28 
 
 		 584 aa  114  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.73 
 
 		 636 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.73 
 
 		 579 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.73 
 
 		 579 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.73 
 
 		 579 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  27.11 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.32 
 
 		 591 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  32.19 
 
 		 615 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.01 
 
 		 628 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  30.5 
 
 		 569 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  30.38 
 
 		 614 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  30.06 
 
 		 613 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  31.49 
 
 		 608 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.14 
 
 		 594 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  32.18 
 
 		 626 aa  107  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.77 
 
 		 598 aa  106  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1431  Chloride channel core  28.23 
 
 		 605 aa  106  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.87 
 
 		 598 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  27.73 
 
 		 603 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  29.02 
 
 		 638 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  31.3 
 
 		 579 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  29.29 
 
 		 612 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  30.07 
 
 		 605 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.35 
 
 		 591 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  28.39 
 
 		 634 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  30.38 
 
 		 605 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.87 
 
 		 589 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0956  Chloride channel core  31.01 
 
 		 461 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0814  voltage-gated chloride channel  31.01 
 
 		 461 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  32.02 
 
 		 600 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  25.85 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  25.9 
 
 		 598 aa  98.2  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>