More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1803 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1803  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  837    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4094  Chloride channel core  87.8 
 
 		 426 aa  690    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.089965  normal  0.148511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3981  Chloride channel core  87.8 
 
 		 426 aa  690    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  67.3 
 
 		 436 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2302  Cl- channel, voltage gated  70.56 
 
 		 413 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3731  chloride channel core  69.87 
 
 		 413 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.597122 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4570  Cl- channel, voltage gated  70.13 
 
 		 413 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3793  Cl- channel, voltage-gated family protein  70.13 
 
 		 413 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258404  normal  0.231279 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3685  chloride channel core  70.71 
 
 		 468 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.36379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0508  voltage-gated chloride channel  69.54 
 
 		 435 aa  501  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5519  Cl- channel, voltage-gated family protein  70.45 
 
 		 413 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720023  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06118  Cl- channel, voltage gated  60.23 
 
 		 443 aa  498  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4619  voltage-gated chloride channel family protein  61.5 
 
 		 452 aa  498  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01048  Cl- channel, voltage gated  60.23 
 
 		 443 aa  498  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371868  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1486  Cl- channel, voltage gated  61.5 
 
 		 448 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4940  chloride channel core  69.42 
 
 		 413 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1732  chloride channel core  60.28 
 
 		 431 aa  494  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1406  voltage-gated chloride channel  69.04 
 
 		 427 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0225  voltage-gated chloride channel  69.04 
 
 		 427 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1603  voltage-gated chloride channel  69.04 
 
 		 436 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845541  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0261  voltage-gated chloride channel  69.04 
 
 		 427 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0961  voltage-gated chloride channel  68.78 
 
 		 435 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2677  chloride channel (ClC) family protein  68.78 
 
 		 435 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267166  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2534  chloride channel (ClC) family protein  69.29 
 
 		 435 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2064  chloride channel core  65.21 
 
 		 440 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0178242 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2371  Cl- channel, voltage-gated family protein  53.21 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.596743  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0545  Chloride channel core  48.11 
 
 		 417 aa  397  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0459516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3539  Chloride channel core  53.87 
 
 		 415 aa  383  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  49.2 
 
 		 452 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0556  voltage gated chloride channel family protein  45.63 
 
 		 437 aa  361  1e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0837  Cl- channel, voltage-gated family protein  52.2 
 
 		 462 aa  359  6e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115914  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0570  voltage-gated chloride channel family protein  45.84 
 
 		 437 aa  358  8e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2639  Chloride channel core  51.96 
 
 		 457 aa  351  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.311853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4018  Chloride channel core  47.93 
 
 		 453 aa  351  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1136  hypothetical protein  47.74 
 
 		 482 aa  345  7e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0839262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1026  chloride channel core  50.89 
 
 		 421 aa  299  8e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.724519  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2367  Chloride channel core  43.03 
 
 		 438 aa  257  3e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2620  Cl- channel voltage-gated family protein  34.54 
 
 		 452 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0274  Chloride channel core  38.39 
 
 		 455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1199  chloride channel protein EriC  35.23 
 
 		 403 aa  217  4e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2180  Cl- channel, voltage gated  36.46 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000426596  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0292  chloride channel core protein  38.71 
 
 		 455 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3273  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.09 
 
 		 481 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1160  chloride channel core  35.4 
 
 		 494 aa  202  9.999999999999999e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0541  voltage-gated chloride channel family protein  37.43 
 
 		 398 aa  199  7e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1145  chloride channel protein EriC  36.46 
 
 		 408 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000190492  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  27.6 
 
 		 606 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  26.3 
 
 		 429 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  27.85 
 
 		 462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  29.47 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  26.27 
 
 		 598 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  27.45 
 
 		 586 aa  107  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.89 
 
 		 580 aa  100  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.23 
 
 		 591 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13300  chloride channel protein EriC  28.69 
 
 		 414 aa  99  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  26.7 
 
 		 585 aa  97.8  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  26.41 
 
 		 582 aa  97.1  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.76 
 
 		 612 aa  91.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.63 
 
 		 598 aa  90.1  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.3 
 
 		 589 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.08 
 
 		 612 aa  87  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  26.73 
 
 		 456 aa  86.7  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.56 
 
 		 754 aa  85.9  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.73 
 
 		 591 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.98 
 
 		 560 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.71 
 
 		 593 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.38 
 
 		 589 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  28.57 
 
 		 634 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.71 
 
 		 593 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.63 
 
 		 589 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.63 
 
 		 589 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.37 
 
 		 577 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  28.33 
 
 		 612 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  36.05 
 
 		 638 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0357  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.6 
 
 		 588 aa  82  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1362  Chloride channel core  31.11 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00220045  normal  0.308625 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.35 
 
 		 582 aa  81.3  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1241  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.84 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.730218 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  30.08 
 
 		 579 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  27.68 
 
 		 625 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.47 
 
 		 636 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  29.64 
 
 		 605 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  26.12 
 
 		 457 aa  79.7  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.41 
 
 		 579 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.41 
 
 		 579 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.41 
 
 		 579 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.46 
 
 		 628 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  29.27 
 
 		 669 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1431  Chloride channel core  31.6 
 
 		 605 aa  77.4  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.96 
 
 		 587 aa  77.4  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.83 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  26.99 
 
 		 602 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  29.53 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  29.53 
 
 		 490 aa  74.7  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6375  Chloride channel core  30.7 
 
 		 595 aa  74.7  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  26.84 
 
 		 603 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3883  chloride channel core  28.72 
 
 		 603 aa  73.9  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  28.32 
 
 		 603 aa  73.9  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  31.73 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  27.39 
 
 		 614 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>