More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1953 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  100 
 
 		 429 aa  844    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.34 
 
 		 580 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  30.21 
 
 		 598 aa  182  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  33.63 
 
 		 606 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  28.9 
 
 		 462 aa  154  4e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  29.44 
 
 		 586 aa  153  5e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  28.16 
 
 		 582 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  28.26 
 
 		 625 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  27.92 
 
 		 602 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2595  Cl- channel, voltage gated  30.62 
 
 		 544 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4857  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.57 
 
 		 754 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  26.41 
 
 		 614 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  28 
 
 		 603 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.33 
 
 		 582 aa  124  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3981  Chloride channel core  26.15 
 
 		 426 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4094  Chloride channel core  26.15 
 
 		 426 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.089965  normal  0.148511 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  26.74 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  25.6 
 
 		 452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  26.8 
 
 		 613 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0545  Chloride channel core  27.36 
 
 		 417 aa  119  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0459516  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  25.24 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0357  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.34 
 
 		 588 aa  118  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1732  chloride channel core  26.11 
 
 		 431 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.02 
 
 		 582 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2971  Chloride channel core  28.06 
 
 		 605 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  27.95 
 
 		 608 aa  116  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  28.24 
 
 		 605 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.06 
 
 		 598 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.02 
 
 		 587 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2302  Cl- channel, voltage gated  24.45 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2485  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.4 
 
 		 603 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  28.32 
 
 		 605 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  27.37 
 
 		 651 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  28.05 
 
 		 456 aa  109  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  23 
 
 		 434 aa  109  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3129  voltage-gated chloride channel  28.02 
 
 		 467 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.831797  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2728  Chloride channel core  28.02 
 
 		 474 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.969759  hitchhiker  0.00000000119016 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4570  Cl- channel, voltage gated  25.06 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3793  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.06 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258404  normal  0.231279 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0508  voltage-gated chloride channel  24.88 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10144  transmembrane protein  28.1 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  25.96 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  29.97 
 
 		 569 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3731  chloride channel core  25.31 
 
 		 413 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.597122 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  27.67 
 
 		 596 aa  107  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  26.62 
 
 		 638 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1486  Cl- channel, voltage gated  24.94 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.25 
 
 		 612 aa  107  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  25.91 
 
 		 669 aa  107  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4619  voltage-gated chloride channel family protein  24.94 
 
 		 452 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1803  hypothetical protein  26.73 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2371  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.5 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.596743  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0961  voltage-gated chloride channel  24.58 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  32.94 
 
 		 600 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1603  voltage-gated chloride channel  24.34 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845541  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0225  voltage-gated chloride channel  24.34 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1039  Chloride channel core  29.03 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2677  chloride channel (ClC) family protein  24.34 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267166  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1406  voltage-gated chloride channel  24.34 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0261  voltage-gated chloride channel  24.34 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06118  Cl- channel, voltage gated  24.76 
 
 		 443 aa  104  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01048  Cl- channel, voltage gated  24.76 
 
 		 443 aa  104  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371868  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.01 
 
 		 575 aa  104  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.52 
 
 		 612 aa  104  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  27.2 
 
 		 615 aa  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3746  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.5 
 
 		 414 aa  103  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.92 
 
 		 591 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.36 
 
 		 589 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3539  Chloride channel core  27.17 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.36 
 
 		 589 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.36 
 
 		 589 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.57 
 
 		 560 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1241  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.99 
 
 		 428 aa  98.6  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.730218 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  25.44 
 
 		 603 aa  99  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  24.69 
 
 		 612 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1160  chloride channel core  25.69 
 
 		 494 aa  98.6  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2534  chloride channel (ClC) family protein  24.82 
 
 		 435 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2620  Cl- channel voltage-gated family protein  27.58 
 
 		 452 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  24.69 
 
 		 634 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5519  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.41 
 
 		 413 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720023  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4940  chloride channel core  23.82 
 
 		 413 aa  97.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530885 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.46 
 
 		 426 aa  97.1  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3685  chloride channel core  23.41 
 
 		 468 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.36379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  24.42 
 
 		 595 aa  96.7  7e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.32 
 
 		 594 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  29.5 
 
 		 626 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  27.71 
 
 		 402 aa  95.5  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.65 
 
 		 577 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4018  Chloride channel core  26.03 
 
 		 453 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.42 
 
 		 589 aa  94.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.58 
 
 		 461 aa  94.4  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  26.15 
 
 		 464 aa  94.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  26.15 
 
 		 464 aa  94.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.87 
 
 		 591 aa  94  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.82 
 
 		 579 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.82 
 
 		 579 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3273  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.67 
 
 		 481 aa  93.2  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.82 
 
 		 579 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.37 
 
 		 636 aa  93.2  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  27.22 
 
 		 579 aa  92.8  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>