More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2620 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2620  Cl- channel voltage-gated family protein  100 
 
 		 452 aa  902    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1160  chloride channel core  37.55 
 
 		 494 aa  289  8e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3273  Cl- channel, voltage-gated family protein  40.7 
 
 		 481 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0274  Chloride channel core  40.28 
 
 		 455 aa  277  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0292  chloride channel core protein  40.52 
 
 		 455 aa  277  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158347  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01048  Cl- channel, voltage gated  33.92 
 
 		 443 aa  227  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371868  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06118  Cl- channel, voltage gated  33.92 
 
 		 443 aa  227  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3981  Chloride channel core  32.54 
 
 		 426 aa  226  6e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4094  Chloride channel core  32.54 
 
 		 426 aa  226  6e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.089965  normal  0.148511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4018  Chloride channel core  32 
 
 		 453 aa  216  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0556  voltage gated chloride channel family protein  33.49 
 
 		 437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1136  hypothetical protein  34.42 
 
 		 482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0839262  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0570  voltage-gated chloride channel family protein  33.8 
 
 		 437 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1732  chloride channel core  32.73 
 
 		 431 aa  209  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2302  Cl- channel, voltage gated  33.16 
 
 		 413 aa  209  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191548  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1803  hypothetical protein  34.54 
 
 		 431 aa  204  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4619  voltage-gated chloride channel family protein  30.43 
 
 		 452 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1486  Cl- channel, voltage gated  30.43 
 
 		 448 aa  202  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  31.19 
 
 		 452 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0545  Chloride channel core  32.33 
 
 		 417 aa  199  7e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0459516  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4940  chloride channel core  33.15 
 
 		 413 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4570  Cl- channel, voltage gated  33.96 
 
 		 413 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3793  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.96 
 
 		 413 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258404  normal  0.231279 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  31.78 
 
 		 436 aa  199  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5519  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.29 
 
 		 413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720023  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3731  chloride channel core  33.69 
 
 		 413 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.597122 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0837  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.18 
 
 		 462 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115914  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3685  chloride channel core  32.64 
 
 		 468 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.36379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0508  voltage-gated chloride channel  33.25 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0961  voltage-gated chloride channel  32.91 
 
 		 435 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0225  voltage-gated chloride channel  32.91 
 
 		 427 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0261  voltage-gated chloride channel  32.91 
 
 		 427 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2677  chloride channel (ClC) family protein  32.91 
 
 		 435 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267166  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1406  voltage-gated chloride channel  32.91 
 
 		 427 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1603  voltage-gated chloride channel  32.91 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845541  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2064  chloride channel core  32.17 
 
 		 440 aa  184  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0178242 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2534  chloride channel (ClC) family protein  32.66 
 
 		 435 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2371  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.12 
 
 		 418 aa  171  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.596743  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1026  chloride channel core  32.14 
 
 		 421 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.724519  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3539  Chloride channel core  30.87 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2639  Chloride channel core  32.43 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.311853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1199  chloride channel protein EriC  29.44 
 
 		 403 aa  146  6e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2180  Cl- channel, voltage gated  28.89 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000426596  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2367  Chloride channel core  30.37 
 
 		 438 aa  140  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0541  voltage-gated chloride channel family protein  31.17 
 
 		 398 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.18 
 
 		 580 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  32.58 
 
 		 606 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  28.11 
 
 		 582 aa  125  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1145  chloride channel protein EriC  28.9 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000190492  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  29.19 
 
 		 586 aa  120  6e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  27.61 
 
 		 598 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  28.18 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  31.82 
 
 		 651 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.89 
 
 		 582 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0357  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.66 
 
 		 588 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.47 
 
 		 612 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.57 
 
 		 426 aa  103  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  28 
 
 		 602 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2595  Cl- channel, voltage gated  28.84 
 
 		 544 aa  99.8  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4857  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1241  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.99 
 
 		 428 aa  99.8  8e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.730218 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  27.2 
 
 		 457 aa  99.4  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  27.16 
 
 		 429 aa  97.1  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  27.91 
 
 		 625 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  25 
 
 		 754 aa  94  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  24.38 
 
 		 434 aa  93.2  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.43 
 
 		 612 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  26.53 
 
 		 456 aa  91.3  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  26.36 
 
 		 470 aa  90.9  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  44.07 
 
 		 605 aa  90.5  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.56 
 
 		 591 aa  89.7  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  26.61 
 
 		 608 aa  89.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  29.77 
 
 		 615 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.39 
 
 		 587 aa  88.6  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.76 
 
 		 414 aa  88.2  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  35.77 
 
 		 638 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  35.77 
 
 		 612 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  35.77 
 
 		 634 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  28.32 
 
 		 605 aa  87  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  27.09 
 
 		 627 aa  86.7  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.09 
 
 		 636 aa  86.7  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.09 
 
 		 579 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.09 
 
 		 579 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.09 
 
 		 579 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.44 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.67 
 
 		 591 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.13 
 
 		 598 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0956  Chloride channel core  24.86 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.95 
 
 		 593 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0814  voltage-gated chloride channel  24.86 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802011  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.27 
 
 		 589 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1431  Chloride channel core  28.46 
 
 		 605 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.27 
 
 		 589 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.27 
 
 		 589 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.82 
 
 		 589 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.37 
 
 		 593 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  29.64 
 
 		 579 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.17 
 
 		 628 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  28.07 
 
 		 603 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  25.81 
 
 		 617 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2485  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.53 
 
 		 603 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>