More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3793 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3685  chloride channel core  95.4 
 
 		 468 aa  730    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.36379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2302  Cl- channel, voltage gated  97.09 
 
 		 413 aa  768    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3731  chloride channel core  99.27 
 
 		 413 aa  798    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.597122 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4570  Cl- channel, voltage gated  100 
 
 		 413 aa  802    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5519  Cl- channel, voltage-gated family protein  95.4 
 
 		 413 aa  732    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720023  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3793  Cl- channel, voltage-gated family protein  100 
 
 		 413 aa  802    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258404  normal  0.231279 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4940  chloride channel core  93.46 
 
 		 413 aa  710    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530885 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  76.85 
 
 		 436 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0508  voltage-gated chloride channel  81.82 
 
 		 435 aa  598  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1406  voltage-gated chloride channel  80.4 
 
 		 427 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0225  voltage-gated chloride channel  80.4 
 
 		 427 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0261  voltage-gated chloride channel  80.4 
 
 		 427 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1603  voltage-gated chloride channel  80.4 
 
 		 436 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845541  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0961  voltage-gated chloride channel  80.15 
 
 		 435 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2677  chloride channel (ClC) family protein  80 
 
 		 435 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267166  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2534  chloride channel (ClC) family protein  80.15 
 
 		 435 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4094  Chloride channel core  68.37 
 
 		 426 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.089965  normal  0.148511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3981  Chloride channel core  68.37 
 
 		 426 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1803  hypothetical protein  70.13 
 
 		 431 aa  488  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1732  chloride channel core  61.48 
 
 		 431 aa  472  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01048  Cl- channel, voltage gated  61.48 
 
 		 443 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371868  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06118  Cl- channel, voltage gated  61.48 
 
 		 443 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4619  voltage-gated chloride channel family protein  62.31 
 
 		 452 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1486  Cl- channel, voltage gated  62.31 
 
 		 448 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2064  chloride channel core  66.84 
 
 		 440 aa  459  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0178242 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0545  Chloride channel core  46.8 
 
 		 417 aa  403  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0459516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2371  Cl- channel, voltage-gated family protein  48.72 
 
 		 418 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.596743  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  48.79 
 
 		 452 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3539  Chloride channel core  50.13 
 
 		 415 aa  360  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0837  Cl- channel, voltage-gated family protein  50.61 
 
 		 462 aa  354  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115914  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1136  hypothetical protein  48.56 
 
 		 482 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0839262  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0556  voltage gated chloride channel family protein  43.32 
 
 		 437 aa  346  3e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4018  Chloride channel core  46.68 
 
 		 453 aa  345  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2639  Chloride channel core  51.73 
 
 		 457 aa  344  1e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.311853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0570  voltage-gated chloride channel family protein  42.82 
 
 		 437 aa  342  8e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1026  chloride channel core  50.13 
 
 		 421 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.724519  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2367  Chloride channel core  42.64 
 
 		 438 aa  262  1e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2180  Cl- channel, voltage gated  37.14 
 
 		 435 aa  219  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000426596  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1199  chloride channel protein EriC  33.76 
 
 		 403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0541  voltage-gated chloride channel family protein  37.56 
 
 		 398 aa  212  9e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2620  Cl- channel voltage-gated family protein  33.67 
 
 		 452 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1160  chloride channel core  35.89 
 
 		 494 aa  207  3e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3273  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.59 
 
 		 481 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0274  Chloride channel core  35.41 
 
 		 455 aa  199  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0292  chloride channel core protein  36.21 
 
 		 455 aa  193  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158347  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1145  chloride channel protein EriC  35.16 
 
 		 408 aa  177  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000190492  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  32.8 
 
 		 606 aa  159  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  26.45 
 
 		 598 aa  122  9e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  24.81 
 
 		 429 aa  119  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  25.86 
 
 		 462 aa  117  5e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13300  chloride channel protein EriC  31.66 
 
 		 414 aa  116  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.95 
 
 		 580 aa  105  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.53 
 
 		 598 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.42 
 
 		 593 aa  99.8  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.42 
 
 		 589 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.42 
 
 		 593 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.42 
 
 		 589 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  27.06 
 
 		 614 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  27.78 
 
 		 613 aa  98.6  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.15 
 
 		 589 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.06 
 
 		 628 aa  97.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.76 
 
 		 589 aa  96.3  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.43 
 
 		 591 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  27.38 
 
 		 608 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  30.54 
 
 		 456 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  29.66 
 
 		 625 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.27 
 
 		 612 aa  94.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.39 
 
 		 579 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  28.31 
 
 		 434 aa  93.6  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.58 
 
 		 636 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.39 
 
 		 579 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.39 
 
 		 579 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  28.48 
 
 		 457 aa  93.2  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.73 
 
 		 587 aa  91.7  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.03 
 
 		 612 aa  91.3  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  27.62 
 
 		 470 aa  90.5  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  26.2 
 
 		 586 aa  90.5  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.23 
 
 		 582 aa  90.1  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.83 
 
 		 591 aa  89.7  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.9 
 
 		 577 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.99 
 
 		 426 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  26.98 
 
 		 582 aa  88.6  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.23 
 
 		 560 aa  89  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  30.49 
 
 		 634 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  29.07 
 
 		 626 aa  87  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  30.49 
 
 		 612 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.41 
 
 		 582 aa  87  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  26.74 
 
 		 602 aa  86.7  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  31.33 
 
 		 640 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  33.76 
 
 		 638 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  33.09 
 
 		 579 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  27.33 
 
 		 585 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.21 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  30.51 
 
 		 584 aa  82.4  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  27.8 
 
 		 533 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  29.92 
 
 		 600 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  31.97 
 
 		 669 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  29.04 
 
 		 451 aa  80.9  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  28.95 
 
 		 605 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  28.43 
 
 		 490 aa  80.5  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>