More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01048 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01048  Cl- channel, voltage gated  100 
 
 		 443 aa  879    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371868  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06118  Cl- channel, voltage gated  100 
 
 		 443 aa  879    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4619  voltage-gated chloride channel family protein  69.49 
 
 		 452 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1486  Cl- channel, voltage gated  69.49 
 
 		 448 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1732  chloride channel core  70.09 
 
 		 431 aa  600  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  59.68 
 
 		 436 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3981  Chloride channel core  62.2 
 
 		 426 aa  495  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4094  Chloride channel core  62.2 
 
 		 426 aa  495  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.089965  normal  0.148511 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2064  chloride channel core  64 
 
 		 440 aa  482  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0178242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2302  Cl- channel, voltage gated  61.06 
 
 		 413 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191548  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1803  hypothetical protein  61.9 
 
 		 431 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0225  voltage-gated chloride channel  61.33 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0508  voltage-gated chloride channel  61.82 
 
 		 435 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0261  voltage-gated chloride channel  61.33 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4570  Cl- channel, voltage gated  62.16 
 
 		 413 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3793  Cl- channel, voltage-gated family protein  62.16 
 
 		 413 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258404  normal  0.231279 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1406  voltage-gated chloride channel  61.33 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1603  voltage-gated chloride channel  61.33 
 
 		 436 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845541  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0961  voltage-gated chloride channel  61.08 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3731  chloride channel core  61.9 
 
 		 413 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.597122 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2677  chloride channel (ClC) family protein  61.08 
 
 		 435 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267166  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3685  chloride channel core  61.99 
 
 		 468 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.36379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5519  Cl- channel, voltage-gated family protein  61.99 
 
 		 413 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720023  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4940  chloride channel core  60.9 
 
 		 413 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530885 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2534  chloride channel (ClC) family protein  60.84 
 
 		 435 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0545  Chloride channel core  45.67 
 
 		 417 aa  388  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0459516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2371  Cl- channel, voltage-gated family protein  46.53 
 
 		 418 aa  382  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.596743  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  49.77 
 
 		 452 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0837  Cl- channel, voltage-gated family protein  48.12 
 
 		 462 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0556  voltage gated chloride channel family protein  45.5 
 
 		 437 aa  363  4e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2639  Chloride channel core  52.76 
 
 		 457 aa  362  6e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.311853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4018  Chloride channel core  48.8 
 
 		 453 aa  361  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0570  voltage-gated chloride channel family protein  44.9 
 
 		 437 aa  360  4e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3539  Chloride channel core  48.35 
 
 		 415 aa  346  6e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1136  hypothetical protein  49.51 
 
 		 482 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0839262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1026  chloride channel core  47.62 
 
 		 421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.724519  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2367  Chloride channel core  40.79 
 
 		 438 aa  263  6.999999999999999e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2620  Cl- channel voltage-gated family protein  33.92 
 
 		 452 aa  227  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2180  Cl- channel, voltage gated  35.49 
 
 		 435 aa  216  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000426596  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1160  chloride channel core  35.66 
 
 		 494 aa  211  1e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3273  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.14 
 
 		 481 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1199  chloride channel protein EriC  35.11 
 
 		 403 aa  203  5e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0274  Chloride channel core  38.06 
 
 		 455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0541  voltage-gated chloride channel family protein  32.83 
 
 		 398 aa  197  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0292  chloride channel core protein  37.22 
 
 		 455 aa  197  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158347  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1145  chloride channel protein EriC  34.18 
 
 		 408 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000190492  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  27.79 
 
 		 606 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  25.64 
 
 		 598 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  25.9 
 
 		 462 aa  109  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13300  chloride channel protein EriC  27.57 
 
 		 414 aa  106  7e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.98 
 
 		 591 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  24.51 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.79 
 
 		 580 aa  101  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  27.18 
 
 		 434 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.09 
 
 		 582 aa  95.5  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.64 
 
 		 754 aa  93.6  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.36 
 
 		 598 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.96 
 
 		 589 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.65 
 
 		 593 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  25.05 
 
 		 586 aa  90.5  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  25.21 
 
 		 582 aa  90.5  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  28.05 
 
 		 585 aa  90.5  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.65 
 
 		 593 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.82 
 
 		 628 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.87 
 
 		 577 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.03 
 
 		 587 aa  88.6  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.27 
 
 		 560 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.87 
 
 		 589 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.87 
 
 		 589 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  28.29 
 
 		 451 aa  84.7  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  28.29 
 
 		 490 aa  84.3  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.87 
 
 		 589 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1241  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.27 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.730218 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.32 
 
 		 591 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.76 
 
 		 636 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.76 
 
 		 579 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  30.07 
 
 		 602 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.76 
 
 		 579 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.76 
 
 		 579 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  30.06 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  26.68 
 
 		 625 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.99 
 
 		 582 aa  79  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  27.93 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  27.93 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  28.03 
 
 		 569 aa  76.6  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  34.17 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  24.58 
 
 		 602 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  25.98 
 
 		 466 aa  76.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.85 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2728  Chloride channel core  24.83 
 
 		 474 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.969759  hitchhiker  0.00000000119016 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2161  chloride channel protein  27.62 
 
 		 594 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  26.75 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3129  voltage-gated chloride channel  24.83 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.831797  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1362  Chloride channel core  30.97 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00220045  normal  0.308625 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  29.14 
 
 		 597 aa  74.3  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  23.66 
 
 		 617 aa  73.6  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.33 
 
 		 591 aa  73.6  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  30.1 
 
 		 468 aa  72.4  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  34.46 
 
 		 638 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  35.14 
 
 		 634 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>