More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4619 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4619  voltage-gated chloride channel family protein  100 
 
 		 452 aa  902    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1486  Cl- channel, voltage gated  100 
 
 		 448 aa  894    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1732  chloride channel core  74.94 
 
 		 431 aa  627  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01048  Cl- channel, voltage gated  69.49 
 
 		 443 aa  617  1e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371868  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06118  Cl- channel, voltage gated  69.49 
 
 		 443 aa  617  1e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  61.97 
 
 		 436 aa  522  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2064  chloride channel core  65.97 
 
 		 440 aa  504  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0178242 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4094  Chloride channel core  61.31 
 
 		 426 aa  494  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.089965  normal  0.148511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3981  Chloride channel core  61.31 
 
 		 426 aa  494  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1803  hypothetical protein  61.5 
 
 		 431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2302  Cl- channel, voltage gated  60.44 
 
 		 413 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0508  voltage-gated chloride channel  59.71 
 
 		 435 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0225  voltage-gated chloride channel  59.71 
 
 		 427 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4570  Cl- channel, voltage gated  62.31 
 
 		 413 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3793  Cl- channel, voltage-gated family protein  62.31 
 
 		 413 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258404  normal  0.231279 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0261  voltage-gated chloride channel  59.71 
 
 		 427 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1406  voltage-gated chloride channel  59.71 
 
 		 427 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1603  voltage-gated chloride channel  59.71 
 
 		 436 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845541  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2677  chloride channel (ClC) family protein  59.47 
 
 		 435 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0961  voltage-gated chloride channel  59.47 
 
 		 435 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3731  chloride channel core  62.31 
 
 		 413 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.597122 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4940  chloride channel core  61.48 
 
 		 413 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530885 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5519  Cl- channel, voltage-gated family protein  61.56 
 
 		 413 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720023  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2534  chloride channel (ClC) family protein  59.22 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3685  chloride channel core  61.06 
 
 		 468 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.36379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0545  Chloride channel core  45.97 
 
 		 417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0459516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2371  Cl- channel, voltage-gated family protein  47.61 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.596743  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3539  Chloride channel core  48.9 
 
 		 415 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0837  Cl- channel, voltage-gated family protein  47.17 
 
 		 462 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115914  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2639  Chloride channel core  52.18 
 
 		 457 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.311853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  44.52 
 
 		 452 aa  364  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4018  Chloride channel core  47.41 
 
 		 453 aa  362  6e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1136  hypothetical protein  47.16 
 
 		 482 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0839262  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0570  voltage-gated chloride channel family protein  44.58 
 
 		 437 aa  343  4e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0556  voltage gated chloride channel family protein  44.58 
 
 		 437 aa  342  7e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1026  chloride channel core  46.21 
 
 		 421 aa  291  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.724519  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2367  Chloride channel core  40.15 
 
 		 438 aa  245  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3273  Cl- channel, voltage-gated family protein  39.71 
 
 		 481 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2180  Cl- channel, voltage gated  32.85 
 
 		 435 aa  223  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000426596  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2620  Cl- channel voltage-gated family protein  30.43 
 
 		 452 aa  213  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0274  Chloride channel core  39.61 
 
 		 455 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1199  chloride channel protein EriC  34.6 
 
 		 403 aa  210  5e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0292  chloride channel core protein  39.61 
 
 		 455 aa  209  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158347  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1160  chloride channel core  35.84 
 
 		 494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0541  voltage-gated chloride channel family protein  35.11 
 
 		 398 aa  199  9e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1145  chloride channel protein EriC  34.2 
 
 		 408 aa  192  8e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000190492  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  28.2 
 
 		 606 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13300  chloride channel protein EriC  30.62 
 
 		 414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  24.54 
 
 		 429 aa  117  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  26.36 
 
 		 598 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  24.54 
 
 		 582 aa  110  6e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  26.42 
 
 		 462 aa  101  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  25.56 
 
 		 586 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0357  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.88 
 
 		 588 aa  100  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  26.77 
 
 		 434 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  27.27 
 
 		 585 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.16 
 
 		 591 aa  92.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.8 
 
 		 582 aa  90.1  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.12 
 
 		 587 aa  90.1  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  27.64 
 
 		 651 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.88 
 
 		 598 aa  86.7  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.88 
 
 		 589 aa  86.7  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.7 
 
 		 628 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.34 
 
 		 560 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1362  Chloride channel core  30.45 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00220045  normal  0.308625 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.73 
 
 		 579 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.73 
 
 		 579 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.73 
 
 		 636 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.62 
 
 		 593 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.73 
 
 		 579 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  26.63 
 
 		 613 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.62 
 
 		 593 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.5 
 
 		 580 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  28.18 
 
 		 603 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  25.93 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  30 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.74 
 
 		 589 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.74 
 
 		 589 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.49 
 
 		 612 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  27.64 
 
 		 533 aa  81.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.5 
 
 		 589 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.98 
 
 		 582 aa  80.9  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  25 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  21.69 
 
 		 608 aa  80.9  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  27.69 
 
 		 602 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  25.5 
 
 		 614 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  34.93 
 
 		 638 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  27.46 
 
 		 449 aa  79.7  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  26.17 
 
 		 512 aa  79.7  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  34.93 
 
 		 612 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  34.25 
 
 		 634 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  27.67 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  24.07 
 
 		 519 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  23.81 
 
 		 519 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.68 
 
 		 612 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  26.94 
 
 		 625 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  27.46 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  27.46 
 
 		 490 aa  77  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2161  chloride channel protein  28.39 
 
 		 594 aa  76.6  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  28.01 
 
 		 579 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>