More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2161 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2134  Chloride channel core  67.3 
 
 		 596 aa  739    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262546  normal  0.105647 
 
 
-
 
NC_004310  BR0490  voltage gated chloride channel family protein  58.33 
 
 		 596 aa  652    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.889673  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2374  Chloride channel core  66.61 
 
 		 596 aa  739    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124913  decreased coverage  0.00191401 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2161  chloride channel protein  100 
 
 		 594 aa  1175    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0604  chloride channel core  58.85 
 
 		 597 aa  659    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5810  Chloride channel core  56.68 
 
 		 606 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.688487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5245  chloride channel core  57.02 
 
 		 606 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  decreased coverage  0.00444672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3006  Chloride channel core  53.37 
 
 		 614 aa  567  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0264261  normal  0.0792273 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2779  chloride channel core  53.78 
 
 		 649 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.674097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2902  Chloride channel core  54.12 
 
 		 614 aa  548  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3994  chloride channel core  52.45 
 
 		 643 aa  535  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0550665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3883  chloride channel core  48.81 
 
 		 603 aa  501  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2747  CLC-type chloride channel protein  46.46 
 
 		 595 aa  472  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171436  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1634  Chloride channel core  48.53 
 
 		 601 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0200608 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2859  Cl- channel, voltage-gated family protein  45.16 
 
 		 606 aa  464  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1483  Chloride channel core  48.01 
 
 		 628 aa  462  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  43.92 
 
 		 602 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0191  chloride channel core  47.24 
 
 		 635 aa  444  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4075  chloride channel core  46.62 
 
 		 587 aa  439  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.480414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1650  Chloride channel core  42.36 
 
 		 604 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3739  chloride channel, core  45.8 
 
 		 582 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4838  chloride channel, core  43.77 
 
 		 584 aa  363  6e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2309  Chloride channel core  44.43 
 
 		 590 aa  362  1e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0529111 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0107  CBS  45.31 
 
 		 579 aa  326  6e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.46 
 
 		 582 aa  205  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.49 
 
 		 598 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.67 
 
 		 591 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.35 
 
 		 577 aa  183  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.56 
 
 		 591 aa  178  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.15 
 
 		 589 aa  177  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.15 
 
 		 589 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.15 
 
 		 589 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  29.04 
 
 		 615 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  28.07 
 
 		 613 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.13 
 
 		 579 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.13 
 
 		 579 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.13 
 
 		 579 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.13 
 
 		 636 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.34 
 
 		 593 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.29 
 
 		 628 aa  170  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.23 
 
 		 587 aa  170  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  25.3 
 
 		 614 aa  170  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.34 
 
 		 593 aa  170  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.29 
 
 		 589 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  27.88 
 
 		 669 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  29.21 
 
 		 470 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  29.44 
 
 		 577 aa  151  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  27.63 
 
 		 606 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  24.68 
 
 		 627 aa  146  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  28.27 
 
 		 579 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  23.98 
 
 		 608 aa  137  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.13 
 
 		 591 aa  137  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  23.23 
 
 		 631 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.74 
 
 		 426 aa  134  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  30.14 
 
 		 564 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.09 
 
 		 426 aa  131  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  31.2 
 
 		 464 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  31.2 
 
 		 464 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.79 
 
 		 591 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.49 
 
 		 461 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.7 
 
 		 414 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  26.81 
 
 		 597 aa  128  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1772  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.88 
 
 		 585 aa  127  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.43 
 
 		 620 aa  127  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  24.31 
 
 		 627 aa  125  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  28.76 
 
 		 590 aa  125  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  23.87 
 
 		 624 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  24.04 
 
 		 628 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  29.05 
 
 		 543 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.96 
 
 		 580 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  27.11 
 
 		 626 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  24.83 
 
 		 603 aa  120  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  25.96 
 
 		 625 aa  120  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.59 
 
 		 565 aa  120  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  29.88 
 
 		 598 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  30.69 
 
 		 562 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  31.62 
 
 		 640 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  26.02 
 
 		 613 aa  117  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  26.17 
 
 		 585 aa  117  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  26.82 
 
 		 569 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.56 
 
 		 575 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  30.56 
 
 		 602 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  28.26 
 
 		 593 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1534  Cl- channel, voltage gated  30.89 
 
 		 527 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.123029  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.94 
 
 		 560 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3124  Cl- channel, voltage gated  28.24 
 
 		 596 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  29.97 
 
 		 402 aa  111  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  27.29 
 
 		 600 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  25.05 
 
 		 651 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.04 
 
 		 594 aa  111  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  28.83 
 
 		 595 aa  106  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  27.87 
 
 		 584 aa  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.1 
 
 		 598 aa  103  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  26.1 
 
 		 575 aa  103  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  27.9 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.10029 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2439  chloride channel core protein  26.36 
 
 		 589 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590865  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  26.51 
 
 		 863 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  27.12 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  27.98 
 
 		 528 aa  102  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  26.25 
 
 		 586 aa  102  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>