More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2779 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3994  chloride channel core  66.28 
 
 		 643 aa  707    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0550665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2779  chloride channel core  100 
 
 		 649 aa  1266    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.674097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5810  Chloride channel core  61.82 
 
 		 606 aa  640    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.688487  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3006  Chloride channel core  98.04 
 
 		 614 aa  1175    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0264261  normal  0.0792273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2902  Chloride channel core  90.37 
 
 		 614 aa  1013    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5245  chloride channel core  61.32 
 
 		 606 aa  617  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  decreased coverage  0.00444672 
 
 
-
 
NC_004310  BR0490  voltage gated chloride channel family protein  55.54 
 
 		 596 aa  599  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.889673  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0604  chloride channel core  55.37 
 
 		 597 aa  597  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2374  Chloride channel core  55.37 
 
 		 596 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124913  decreased coverage  0.00191401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2134  Chloride channel core  55.54 
 
 		 596 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262546  normal  0.105647 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2161  chloride channel protein  52.68 
 
 		 594 aa  556  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3883  chloride channel core  50.32 
 
 		 603 aa  504  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1634  Chloride channel core  51.85 
 
 		 601 aa  478  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0200608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2747  CLC-type chloride channel protein  47.55 
 
 		 595 aa  463  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171436  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1483  Chloride channel core  49.67 
 
 		 628 aa  451  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0191  chloride channel core  51.15 
 
 		 635 aa  445  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2859  Cl- channel, voltage-gated family protein  45.72 
 
 		 606 aa  431  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4075  chloride channel core  46.61 
 
 		 587 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.480414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  40.8 
 
 		 602 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3739  chloride channel, core  46.27 
 
 		 582 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1650  Chloride channel core  39.6 
 
 		 604 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2309  Chloride channel core  43.45 
 
 		 590 aa  338  2.9999999999999997e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0529111 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4838  chloride channel, core  45.97 
 
 		 584 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0107  CBS  45.68 
 
 		 579 aa  327  5e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.95 
 
 		 582 aa  180  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.84 
 
 		 598 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.51 
 
 		 628 aa  162  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.84 
 
 		 589 aa  160  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.84 
 
 		 589 aa  160  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.84 
 
 		 589 aa  160  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.32 
 
 		 636 aa  158  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.32 
 
 		 579 aa  157  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.32 
 
 		 579 aa  157  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  28.52 
 
 		 613 aa  157  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.32 
 
 		 579 aa  157  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.66 
 
 		 593 aa  157  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.16 
 
 		 593 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  29.4 
 
 		 615 aa  154  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.68 
 
 		 591 aa  153  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  28.88 
 
 		 614 aa  151  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.79 
 
 		 577 aa  151  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  27.3 
 
 		 577 aa  146  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.54 
 
 		 589 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.83 
 
 		 591 aa  141  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  27.1 
 
 		 597 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  25.81 
 
 		 669 aa  137  9e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  26.04 
 
 		 627 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.95 
 
 		 591 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.82 
 
 		 587 aa  134  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  30.09 
 
 		 626 aa  130  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  26.21 
 
 		 608 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  27.62 
 
 		 470 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.89 
 
 		 461 aa  126  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1772  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.22 
 
 		 585 aa  124  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  24.53 
 
 		 606 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.84 
 
 		 565 aa  119  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  27.97 
 
 		 579 aa  119  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  28.6 
 
 		 543 aa  118  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  26.91 
 
 		 651 aa  117  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.49 
 
 		 594 aa  116  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  23.46 
 
 		 631 aa  115  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.47 
 
 		 620 aa  113  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  25.04 
 
 		 628 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  31.19 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  31.19 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1534  Cl- channel, voltage gated  35.07 
 
 		 527 aa  111  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.123029  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  30.05 
 
 		 564 aa  110  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.56 
 
 		 591 aa  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  25.13 
 
 		 624 aa  109  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  24.95 
 
 		 627 aa  108  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  23.88 
 
 		 585 aa  107  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.38 
 
 		 426 aa  106  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  25.52 
 
 		 598 aa  105  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.22 
 
 		 580 aa  104  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0525  Cl- channel voltage-gated family protein  27.26 
 
 		 579 aa  103  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  24.59 
 
 		 640 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  29.34 
 
 		 562 aa  102  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.98 
 
 		 575 aa  101  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.57 
 
 		 426 aa  100  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  31.14 
 
 		 569 aa  100  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.57 
 
 		 414 aa  100  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  28.71 
 
 		 586 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  26.87 
 
 		 605 aa  99  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.1 
 
 		 598 aa  97.8  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6375  Chloride channel core  25.52 
 
 		 595 aa  97.8  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  26.8 
 
 		 625 aa  97.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  27.48 
 
 		 595 aa  96.3  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  29.46 
 
 		 456 aa  96.7  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  28.61 
 
 		 402 aa  95.9  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0552  Chloride channel core  23.75 
 
 		 614 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  27.12 
 
 		 590 aa  95.1  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  26.34 
 
 		 600 aa  95.5  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.19 
 
 		 560 aa  95.1  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2526  Chloride channel core  28.27 
 
 		 589 aa  94.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  26.29 
 
 		 596 aa  94  8e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2439  chloride channel core protein  28.6 
 
 		 589 aa  93.6  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590865  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  23.71 
 
 		 603 aa  93.6  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  22.42 
 
 		 617 aa  91.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  26.91 
 
 		 604 aa  91.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3124  Cl- channel, voltage gated  25.75 
 
 		 596 aa  91.3  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>