More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4838 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4838  chloride channel, core  100 
 
 		 584 aa  1135    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3739  chloride channel, core  55.18 
 
 		 582 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4075  chloride channel core  53.9 
 
 		 587 aa  477  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.480414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2309  Chloride channel core  53.08 
 
 		 590 aa  426  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0529111 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0107  CBS  52.77 
 
 		 579 aa  428  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0490  voltage gated chloride channel family protein  42.5 
 
 		 596 aa  414  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.889673  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2747  CLC-type chloride channel protein  44.95 
 
 		 595 aa  411  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171436  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0604  chloride channel core  43 
 
 		 597 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2161  chloride channel protein  43.36 
 
 		 594 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2374  Chloride channel core  41.91 
 
 		 596 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124913  decreased coverage  0.00191401 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3883  chloride channel core  44.99 
 
 		 603 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2134  Chloride channel core  41.74 
 
 		 596 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262546  normal  0.105647 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1634  Chloride channel core  44.92 
 
 		 601 aa  382  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0200608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5810  Chloride channel core  46.31 
 
 		 606 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.688487  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2779  chloride channel core  41.69 
 
 		 649 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.674097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3006  Chloride channel core  41.56 
 
 		 614 aa  372  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0264261  normal  0.0792273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  40.17 
 
 		 602 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2902  Chloride channel core  42.37 
 
 		 614 aa  364  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3994  chloride channel core  43.82 
 
 		 643 aa  362  9e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0550665 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0191  chloride channel core  43.05 
 
 		 635 aa  357  2.9999999999999997e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5245  chloride channel core  44.79 
 
 		 606 aa  353  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  decreased coverage  0.00444672 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2859  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.78 
 
 		 606 aa  349  8e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1650  Chloride channel core  40.73 
 
 		 604 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1483  Chloride channel core  42.93 
 
 		 628 aa  333  4e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.09 
 
 		 582 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  26.98 
 
 		 613 aa  156  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  28.72 
 
 		 615 aa  156  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  26.33 
 
 		 614 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  25.53 
 
 		 608 aa  137  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  30.34 
 
 		 626 aa  134  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  27.57 
 
 		 669 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.87 
 
 		 587 aa  125  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.95 
 
 		 594 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  25.98 
 
 		 606 aa  124  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.7 
 
 		 598 aa  121  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.21 
 
 		 579 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.21 
 
 		 579 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.44 
 
 		 636 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.21 
 
 		 579 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  25.13 
 
 		 577 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.8 
 
 		 628 aa  118  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.82 
 
 		 593 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.82 
 
 		 593 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.85 
 
 		 565 aa  115  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  29.75 
 
 		 543 aa  115  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.06 
 
 		 598 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.41 
 
 		 591 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1534  Cl- channel, voltage gated  33.74 
 
 		 527 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.123029  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  32.12 
 
 		 598 aa  110  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.55 
 
 		 591 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.13 
 
 		 620 aa  110  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  25.99 
 
 		 470 aa  110  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.93 
 
 		 589 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  27.68 
 
 		 605 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.93 
 
 		 589 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.52 
 
 		 589 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.93 
 
 		 589 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.81 
 
 		 577 aa  109  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.96 
 
 		 426 aa  108  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.73 
 
 		 591 aa  108  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.09 
 
 		 591 aa  106  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  22.96 
 
 		 617 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  28.93 
 
 		 569 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  25.19 
 
 		 603 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  26.11 
 
 		 627 aa  104  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  27.46 
 
 		 600 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  25.84 
 
 		 590 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  27.64 
 
 		 602 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  23.4 
 
 		 627 aa  100  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  22.5 
 
 		 631 aa  101  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  25.78 
 
 		 603 aa  100  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0525  Cl- channel voltage-gated family protein  26.25 
 
 		 579 aa  100  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  29.37 
 
 		 456 aa  99  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2520  Chloride channel core  26.17 
 
 		 594 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  25.24 
 
 		 604 aa  99.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1772  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.68 
 
 		 585 aa  99  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.82 
 
 		 414 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  27.2 
 
 		 434 aa  98.6  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  26.64 
 
 		 593 aa  98.2  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.82 
 
 		 426 aa  97.8  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  26.37 
 
 		 624 aa  97.4  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0584  Cl- channel, voltage gated  27.73 
 
 		 637 aa  94.7  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  28.28 
 
 		 564 aa  94.7  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  27.32 
 
 		 575 aa  94.4  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3967  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.46 
 
 		 595 aa  94.4  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995893  normal  0.198047 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4429  chloride channel core  26.46 
 
 		 595 aa  94  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  29 
 
 		 562 aa  94  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  25.31 
 
 		 606 aa  93.6  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  26.61 
 
 		 584 aa  93.6  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4117  chloride channel core  26.99 
 
 		 595 aa  93.6  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  24.32 
 
 		 582 aa  92.4  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  25.22 
 
 		 640 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  28.57 
 
 		 596 aa  92.4  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  26.54 
 
 		 597 aa  92.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.21 
 
 		 560 aa  92  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.59 
 
 		 754 aa  91.3  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  24.8 
 
 		 651 aa  90.9  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  25.71 
 
 		 628 aa  89.7  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2674  CBS:Cl- channel, voltage gated  25.72 
 
 		 584 aa  89.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4018  Chloride channel core  30.4 
 
 		 453 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  0.248767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>