More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1772 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1772  Cl- channel, voltage-gated family protein  100 
 
 
585 aa  1135    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.74 
 
 
582 aa  230  6e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  38.75 
 
 
543 aa  208  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1534  Cl- channel, voltage gated  40.42 
 
 
527 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.123029  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  29.9 
 
 
615 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.05 
 
 
598 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  37.71 
 
 
564 aa  196  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  37.67 
 
 
562 aa  193  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.99 
 
 
589 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.55 
 
 
579 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.55 
 
 
579 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.55 
 
 
579 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.55 
 
 
636 aa  190  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.68 
 
 
580 aa  189  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  41.58 
 
 
565 aa  188  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.69 
 
 
593 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.69 
 
 
593 aa  188  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.74 
 
 
587 aa  187  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  27.81 
 
 
631 aa  186  7e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  29.62 
 
 
627 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.69 
 
 
589 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.69 
 
 
589 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.69 
 
 
589 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.07 
 
 
628 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  33.02 
 
 
626 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  28.29 
 
 
627 aa  179  9e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  30.89 
 
 
600 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.29 
 
 
620 aa  179  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  28.78 
 
 
608 aa  177  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  28.62 
 
 
669 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  30.99 
 
 
597 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0490  voltage gated chloride channel family protein  28.69 
 
 
596 aa  173  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.889673  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  26.93 
 
 
614 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  30.94 
 
 
470 aa  172  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.74 
 
 
577 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  28.28 
 
 
613 aa  171  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  27.99 
 
 
584 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  30.68 
 
 
640 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0604  chloride channel core  28.62 
 
 
597 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1483  Chloride channel core  31.4 
 
 
628 aa  164  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  26.84 
 
 
624 aa  164  6e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.01 
 
 
591 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3883  chloride channel core  29.75 
 
 
603 aa  161  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  27 
 
 
577 aa  157  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.12 
 
 
591 aa  157  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  34.72 
 
 
575 aa  156  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  33.81 
 
 
585 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  27.31 
 
 
598 aa  155  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  28.13 
 
 
606 aa  153  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5810  Chloride channel core  31.11 
 
 
606 aa  153  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.688487  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.3 
 
 
594 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2374  Chloride channel core  28.91 
 
 
596 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124913  decreased coverage  0.00191401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2134  Chloride channel core  29.7 
 
 
596 aa  151  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262546  normal  0.105647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  27.3 
 
 
605 aa  151  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3006  Chloride channel core  29.78 
 
 
614 aa  150  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0264261  normal  0.0792273 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  28.4 
 
 
628 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  28.71 
 
 
602 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1650  Chloride channel core  28.6 
 
 
604 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  32.88 
 
 
456 aa  147  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.48 
 
 
591 aa  147  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2902  Chloride channel core  30.46 
 
 
614 aa  145  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452389  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.3 
 
 
575 aa  145  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2779  chloride channel core  30.1 
 
 
649 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.674097  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5245  chloride channel core  30.39 
 
 
606 aa  144  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  decreased coverage  0.00444672 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2161  chloride channel protein  28.31 
 
 
594 aa  144  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  27.82 
 
 
604 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  28.88 
 
 
402 aa  144  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  28.94 
 
 
603 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0191  chloride channel core  28.35 
 
 
635 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66054  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  24.87 
 
 
613 aa  141  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  29.95 
 
 
625 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.8 
 
 
591 aa  140  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  28.44 
 
 
603 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1257  chloride channel-like  32.26 
 
 
615 aa  139  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.95023  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  32.86 
 
 
586 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  27.61 
 
 
569 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2094  Chloride channel core  28.15 
 
 
603 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  28.88 
 
 
590 aa  136  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2144  Cl- channel voltage-gated family protein  31.99 
 
 
604 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  26.17 
 
 
586 aa  135  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.64 
 
 
754 aa  134  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3994  chloride channel core  29.55 
 
 
643 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0550665 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1634  Chloride channel core  28.99 
 
 
601 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0200608 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  34 
 
 
464 aa  132  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  34 
 
 
464 aa  132  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  24.83 
 
 
598 aa  131  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5812  chloride channel core  30.7 
 
 
634 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00468888 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3157  CBS domain-containing protein  29.85 
 
 
593 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.687522  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2526  Chloride channel core  32.25 
 
 
589 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2439  chloride channel core protein  31.7 
 
 
589 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590865  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  28.24 
 
 
593 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  25.89 
 
 
596 aa  128  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2181  Cl- channel voltage-gated family protein  32.31 
 
 
634 aa  127  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.63 
 
 
461 aa  127  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2859  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.1 
 
 
606 aa  127  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.81 
 
 
598 aa  127  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  27.55 
 
 
600 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  23.17 
 
 
595 aa  124  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.69 
 
 
426 aa  123  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4484  chloride channel core  27.26 
 
 
605 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.529319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>