More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1483 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1483  Chloride channel core  100 
 
 		 628 aa  1230    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_004310  BR0490  voltage gated chloride channel family protein  50.51 
 
 		 596 aa  530  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.889673  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0604  chloride channel core  50.51 
 
 		 597 aa  524  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5810  Chloride channel core  52.36 
 
 		 606 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.688487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5245  chloride channel core  52.87 
 
 		 606 aa  501  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  decreased coverage  0.00444672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3883  chloride channel core  50.43 
 
 		 603 aa  491  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2859  Cl- channel, voltage-gated family protein  48.7 
 
 		 606 aa  489  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3994  chloride channel core  53.34 
 
 		 643 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0550665 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2134  Chloride channel core  48.73 
 
 		 596 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262546  normal  0.105647 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2374  Chloride channel core  48.56 
 
 		 596 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124913  decreased coverage  0.00191401 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3006  Chloride channel core  50.41 
 
 		 614 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0264261  normal  0.0792273 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1634  Chloride channel core  49.25 
 
 		 601 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0200608 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2161  chloride channel protein  47.57 
 
 		 594 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2779  chloride channel core  50.25 
 
 		 649 aa  457  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.674097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2902  Chloride channel core  51.34 
 
 		 614 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2747  CLC-type chloride channel protein  44.19 
 
 		 595 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171436  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0191  chloride channel core  44.93 
 
 		 635 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  42.44 
 
 		 602 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4075  chloride channel core  48.97 
 
 		 587 aa  415  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.480414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1650  Chloride channel core  41.75 
 
 		 604 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3739  chloride channel, core  46.41 
 
 		 582 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0107  CBS  45.18 
 
 		 579 aa  346  6e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2309  Chloride channel core  46.13 
 
 		 590 aa  345  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0529111 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4838  chloride channel, core  45.01 
 
 		 584 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.4 
 
 		 582 aa  197  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.17 
 
 		 587 aa  172  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  30.75 
 
 		 615 aa  166  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  30 
 
 		 614 aa  163  9e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  26.73 
 
 		 608 aa  158  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  30.04 
 
 		 597 aa  158  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  28.25 
 
 		 606 aa  155  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  27.61 
 
 		 613 aa  154  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.24 
 
 		 598 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.8 
 
 		 589 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.82 
 
 		 589 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.82 
 
 		 589 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1772  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.4 
 
 		 585 aa  144  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.94 
 
 		 591 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  29.51 
 
 		 600 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  26.89 
 
 		 624 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  26.48 
 
 		 470 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.36 
 
 		 589 aa  139  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.69 
 
 		 620 aa  139  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  24.61 
 
 		 631 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  31.27 
 
 		 626 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  26.34 
 
 		 577 aa  137  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.34 
 
 		 593 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.65 
 
 		 577 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.83 
 
 		 628 aa  136  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.34 
 
 		 593 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.7 
 
 		 636 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.7 
 
 		 579 aa  135  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.7 
 
 		 579 aa  135  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.7 
 
 		 579 aa  135  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  24.47 
 
 		 627 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.38 
 
 		 591 aa  132  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.1 
 
 		 591 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  25.4 
 
 		 669 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.25 
 
 		 591 aa  127  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0525  Cl- channel voltage-gated family protein  25.73 
 
 		 579 aa  127  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.46 
 
 		 565 aa  126  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  25.63 
 
 		 628 aa  125  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  22.44 
 
 		 594 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  27.33 
 
 		 598 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  28.71 
 
 		 651 aa  125  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  25.44 
 
 		 627 aa  125  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1534  Cl- channel, voltage gated  33.87 
 
 		 527 aa  124  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.123029  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  34.22 
 
 		 426 aa  124  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.27 
 
 		 580 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  33.15 
 
 		 464 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  33.15 
 
 		 464 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  29.9 
 
 		 564 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.26 
 
 		 612 aa  118  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  27.76 
 
 		 584 aa  117  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  26.83 
 
 		 579 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.32 
 
 		 461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  28.35 
 
 		 595 aa  113  8.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  26.93 
 
 		 596 aa  113  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2526  Chloride channel core  28.52 
 
 		 589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2439  chloride channel core protein  28.52 
 
 		 589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590865  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.67 
 
 		 560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.87 
 
 		 598 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.56 
 
 		 426 aa  110  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  28.63 
 
 		 543 aa  110  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  28.71 
 
 		 586 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  27.85 
 
 		 590 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.56 
 
 		 414 aa  110  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.68 
 
 		 575 aa  108  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  27.24 
 
 		 593 aa  108  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  26.92 
 
 		 604 aa  107  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  25.98 
 
 		 575 aa  107  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  26.74 
 
 		 603 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1849  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.92 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2094  Chloride channel core  28.12 
 
 		 603 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1660  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.75 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  27.34 
 
 		 640 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1592  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.27 
 
 		 429 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0733959 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.99 
 
 		 754 aa  105  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  26.4 
 
 		 629 aa  105  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  24.49 
 
 		 598 aa  104  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>