More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2859 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2859  Cl- channel, voltage-gated family protein  100 
 
 
606 aa  1226    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2134  Chloride channel core  46.81 
 
 
596 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262546  normal  0.105647 
 
 
-
 
NC_004310  BR0490  voltage gated chloride channel family protein  46.47 
 
 
596 aa  478  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.889673  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0604  chloride channel core  47.36 
 
 
597 aa  472  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1483  Chloride channel core  48.7 
 
 
628 aa  472  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2374  Chloride channel core  46.4 
 
 
596 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124913  decreased coverage  0.00191401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5810  Chloride channel core  47.23 
 
 
606 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.688487  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3883  chloride channel core  46.88 
 
 
603 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5245  chloride channel core  47.11 
 
 
606 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  decreased coverage  0.00444672 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2161  chloride channel protein  45.16 
 
 
594 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3006  Chloride channel core  45.48 
 
 
614 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0264261  normal  0.0792273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2747  CLC-type chloride channel protein  43.37 
 
 
595 aa  428  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171436  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3994  chloride channel core  44.59 
 
 
643 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0550665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2779  chloride channel core  45.03 
 
 
649 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.674097  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2902  Chloride channel core  43.39 
 
 
614 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452389  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0191  chloride channel core  41.37 
 
 
635 aa  403  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66054  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1634  Chloride channel core  44.23 
 
 
601 aa  405  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0200608 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4075  chloride channel core  41.43 
 
 
587 aa  401  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.480414  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  37.65 
 
 
602 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1650  Chloride channel core  39.32 
 
 
604 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3739  chloride channel, core  42.81 
 
 
582 aa  343  5e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2309  Chloride channel core  40.03 
 
 
590 aa  329  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0529111 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4838  chloride channel, core  41.94 
 
 
584 aa  314  3.9999999999999997e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0107  CBS  41.28 
 
 
579 aa  300  6e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.29 
 
 
582 aa  213  9e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  27.6 
 
 
614 aa  183  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  26.52 
 
 
613 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  29.34 
 
 
597 aa  161  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  24.83 
 
 
608 aa  160  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  25.83 
 
 
577 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.44 
 
 
598 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.47 
 
 
587 aa  145  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  26.96 
 
 
615 aa  144  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  25.21 
 
 
669 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.03 
 
 
591 aa  140  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.09 
 
 
591 aa  140  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.05 
 
 
589 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.24 
 
 
589 aa  140  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.24 
 
 
589 aa  140  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  24.61 
 
 
627 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.1 
 
 
589 aa  138  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.24 
 
 
636 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  24.67 
 
 
606 aa  137  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.24 
 
 
579 aa  136  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.24 
 
 
579 aa  136  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.24 
 
 
579 aa  136  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.1 
 
 
577 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  26.89 
 
 
624 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.57 
 
 
628 aa  135  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.44 
 
 
593 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.26 
 
 
620 aa  134  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.44 
 
 
593 aa  134  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  30.67 
 
 
470 aa  133  7.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.64 
 
 
591 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  27.62 
 
 
600 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  27.79 
 
 
626 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  24.83 
 
 
627 aa  128  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  22.54 
 
 
628 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.84 
 
 
565 aa  126  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  26.23 
 
 
584 aa  124  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  26.22 
 
 
564 aa  124  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  24.65 
 
 
590 aa  123  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  30.87 
 
 
569 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.79 
 
 
426 aa  122  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  27.97 
 
 
464 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  27.97 
 
 
464 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  24.73 
 
 
593 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  22.43 
 
 
631 aa  117  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  22.45 
 
 
594 aa  117  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  23.4 
 
 
613 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.24 
 
 
575 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  24.95 
 
 
579 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0525  Cl- channel voltage-gated family protein  24.04 
 
 
579 aa  114  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  28.69 
 
 
575 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  25.41 
 
 
562 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.32 
 
 
580 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.13 
 
 
461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  26.96 
 
 
640 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2144  Cl- channel voltage-gated family protein  25.14 
 
 
604 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1772  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.05 
 
 
585 aa  112  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.76 
 
 
598 aa  111  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  24.5 
 
 
598 aa  111  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.41 
 
 
414 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.65 
 
 
426 aa  109  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.53 
 
 
591 aa  107  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  28.57 
 
 
402 aa  106  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.37 
 
 
560 aa  104  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  27.32 
 
 
543 aa  103  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1534  Cl- channel, voltage gated  30.19 
 
 
527 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.123029  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3300  Cl- channel, voltage gated  25.56 
 
 
585 aa  103  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0616826  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  23.11 
 
 
585 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  25.28 
 
 
651 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  23.25 
 
 
595 aa  102  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  28.1 
 
 
629 aa  102  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  24.76 
 
 
605 aa  101  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  25.17 
 
 
606 aa  101  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  22.29 
 
 
617 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2520  Chloride channel core  24.08 
 
 
594 aa  98.2  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2526  Chloride channel core  25.33 
 
 
589 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  23.36 
 
 
598 aa  95.9  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>