More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0107 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0107  CBS  100 
 
 		 579 aa  1123    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3739  chloride channel, core  56.23 
 
 		 582 aa  504  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4075  chloride channel core  55.05 
 
 		 587 aa  483  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.480414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2309  Chloride channel core  57.69 
 
 		 590 aa  483  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0529111 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4838  chloride channel, core  53.01 
 
 		 584 aa  465  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0490  voltage gated chloride channel family protein  43.01 
 
 		 596 aa  419  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.889673  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0604  chloride channel core  43.77 
 
 		 597 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2747  CLC-type chloride channel protein  45.17 
 
 		 595 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171436  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3006  Chloride channel core  46.24 
 
 		 614 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0264261  normal  0.0792273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3883  chloride channel core  45.7 
 
 		 603 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2779  chloride channel core  45.64 
 
 		 649 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.674097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2902  Chloride channel core  45.09 
 
 		 614 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5810  Chloride channel core  48.21 
 
 		 606 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.688487  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1483  Chloride channel core  45.18 
 
 		 628 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5245  chloride channel core  46.34 
 
 		 606 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  decreased coverage  0.00444672 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2134  Chloride channel core  46.68 
 
 		 596 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262546  normal  0.105647 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2374  Chloride channel core  46.28 
 
 		 596 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124913  decreased coverage  0.00191401 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2161  chloride channel protein  46.17 
 
 		 594 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  40.45 
 
 		 602 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1634  Chloride channel core  45.88 
 
 		 601 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0200608 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3994  chloride channel core  45.03 
 
 		 643 aa  379  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0550665 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0191  chloride channel core  43.58 
 
 		 635 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2859  Cl- channel, voltage-gated family protein  41.75 
 
 		 606 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1650  Chloride channel core  41.1 
 
 		 604 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.26 
 
 		 582 aa  184  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1772  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.17 
 
 		 585 aa  138  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  25.26 
 
 		 613 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  26.69 
 
 		 615 aa  134  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  27.57 
 
 		 577 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  24.54 
 
 		 617 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  25.47 
 
 		 614 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.86 
 
 		 598 aa  127  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.51 
 
 		 579 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.51 
 
 		 579 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.51 
 
 		 579 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.51 
 
 		 636 aa  124  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1534  Cl- channel, voltage gated  34.08 
 
 		 527 aa  124  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.123029  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.2 
 
 		 594 aa  123  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.05 
 
 		 589 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.44 
 
 		 589 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.09 
 
 		 593 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.22 
 
 		 628 aa  122  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.09 
 
 		 593 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  30.82 
 
 		 626 aa  120  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.25 
 
 		 589 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.25 
 
 		 589 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.09 
 
 		 577 aa  120  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  29.32 
 
 		 597 aa  120  7e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.59 
 
 		 587 aa  117  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0552  Chloride channel core  23.42 
 
 		 614 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  25 
 
 		 608 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  26.86 
 
 		 604 aa  112  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  26.94 
 
 		 470 aa  110  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  28.22 
 
 		 543 aa  110  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.42 
 
 		 565 aa  110  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  26.69 
 
 		 603 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  26.26 
 
 		 606 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.05 
 
 		 591 aa  107  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  25 
 
 		 600 aa  107  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.85 
 
 		 591 aa  106  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.75 
 
 		 426 aa  106  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  26.73 
 
 		 605 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  29.74 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  30.84 
 
 		 598 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  29.74 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2520  Chloride channel core  25.95 
 
 		 594 aa  105  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  28.29 
 
 		 564 aa  105  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.1 
 
 		 461 aa  104  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  22.8 
 
 		 620 aa  104  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.16 
 
 		 598 aa  103  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  25.75 
 
 		 602 aa  103  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  27.51 
 
 		 600 aa  103  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.46 
 
 		 591 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  29.17 
 
 		 456 aa  101  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  27.65 
 
 		 669 aa  100  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2094  Chloride channel core  26.89 
 
 		 603 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.32 
 
 		 414 aa  96.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  29.17 
 
 		 562 aa  95.5  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  22.96 
 
 		 627 aa  95.1  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  22.98 
 
 		 628 aa  94.7  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  21.89 
 
 		 631 aa  94.7  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.32 
 
 		 426 aa  94.4  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3157  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 		 593 aa  94  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.687522  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  26.67 
 
 		 519 aa  94  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  28.7 
 
 		 596 aa  93.6  9e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  23.62 
 
 		 627 aa  93.6  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  25.11 
 
 		 579 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.09 
 
 		 580 aa  92.8  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  27.27 
 
 		 471 aa  92  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.10029 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  26.33 
 
 		 519 aa  92  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.38 
 
 		 526 aa  92  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  23.87 
 
 		 624 aa  91.7  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  25.05 
 
 		 603 aa  90.1  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  26.75 
 
 		 606 aa  89.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2439  chloride channel core protein  28.14 
 
 		 589 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590865  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  27.1 
 
 		 586 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2526  Chloride channel core  28.17 
 
 		 589 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  25.37 
 
 		 584 aa  87  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.97 
 
 		 591 aa  85.9  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4619  voltage-gated chloride channel family protein  31.75 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>