More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0358 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  100 
 
 		 575 aa  1145    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  46.19 
 
 		 591 aa  474  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  45.72 
 
 		 575 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  41.04 
 
 		 585 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3300  Cl- channel, voltage gated  40.83 
 
 		 585 aa  399  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0616826  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2144  Cl- channel voltage-gated family protein  35.23 
 
 		 604 aa  313  5.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  33.45 
 
 		 559 aa  280  5e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  36.23 
 
 		 579 aa  229  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.15 
 
 		 582 aa  226  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4624  voltage-gated chloride channel  35.81 
 
 		 574 aa  219  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0983  chloride channel core  33.73 
 
 		 573 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20295  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  29.84 
 
 		 614 aa  216  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01599  putative Voltage-gated ClC-type chloride channel clcA  35.53 
 
 		 538 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2978  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.63 
 
 		 574 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2817  Cl- channel, voltage gated  32.15 
 
 		 574 aa  210  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.174433  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1201  chloride channel core  32.42 
 
 		 575 aa  204  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459194 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  28.5 
 
 		 613 aa  201  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  36.36 
 
 		 626 aa  196  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1302  chloride channel  33.33 
 
 		 574 aa  192  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.13 
 
 		 636 aa  190  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.2 
 
 		 579 aa  189  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.2 
 
 		 579 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.2 
 
 		 579 aa  189  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3151  Chloride channel core  33.39 
 
 		 574 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1206  chloride channel core  33.39 
 
 		 574 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1093  Cl-channel, voltage-gated family protein  34.95 
 
 		 569 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00228292  decreased coverage  0.00554461 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1161  chloride channel core  33.39 
 
 		 574 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.541504  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  31.76 
 
 		 615 aa  188  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1239  chloride channel core  33.22 
 
 		 574 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.675776 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.09 
 
 		 598 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  28.57 
 
 		 627 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.6 
 
 		 587 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1015  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.34 
 
 		 569 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.411818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  28.07 
 
 		 608 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.65 
 
 		 628 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1121  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.98 
 
 		 574 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  30.59 
 
 		 597 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  29.96 
 
 		 569 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2973  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.33 
 
 		 574 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000658505 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3069  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.33 
 
 		 574 aa  182  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.724246  hitchhiker  0.00000035598 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2891  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.33 
 
 		 574 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0598145  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.81 
 
 		 591 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.69 
 
 		 591 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  32.64 
 
 		 470 aa  180  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.37 
 
 		 593 aa  176  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.37 
 
 		 593 aa  176  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  32.03 
 
 		 600 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  32.68 
 
 		 669 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.95 
 
 		 589 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.65 
 
 		 589 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.95 
 
 		 589 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.95 
 
 		 589 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  27.57 
 
 		 624 aa  171  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  30.81 
 
 		 584 aa  171  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0841  chloride channel  34.63 
 
 		 571 aa  170  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.690246 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  30.79 
 
 		 577 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.26 
 
 		 565 aa  166  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32 
 
 		 591 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1534  Cl- channel, voltage gated  37.77 
 
 		 527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.123029  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  29.89 
 
 		 606 aa  162  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  25.67 
 
 		 631 aa  162  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  31.76 
 
 		 564 aa  162  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  30.94 
 
 		 543 aa  161  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.21 
 
 		 620 aa  161  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.03 
 
 		 577 aa  161  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  27.26 
 
 		 627 aa  158  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  31.38 
 
 		 456 aa  153  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  26.23 
 
 		 613 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  32.69 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  32.69 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  28.11 
 
 		 629 aa  147  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  30.03 
 
 		 602 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.76 
 
 		 461 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  30.86 
 
 		 562 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.73 
 
 		 598 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  30.27 
 
 		 640 aa  143  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  28.67 
 
 		 590 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  27.59 
 
 		 628 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  33.69 
 
 		 579 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  28.25 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  27.46 
 
 		 598 aa  139  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  27.41 
 
 		 605 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.73 
 
 		 426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  30.12 
 
 		 596 aa  135  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.99 
 
 		 594 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.28 
 
 		 580 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  27.25 
 
 		 595 aa  133  7.999999999999999e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.56 
 
 		 526 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  29.96 
 
 		 897 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  30.21 
 
 		 625 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.96 
 
 		 439 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  31.96 
 
 		 439 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1772  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.91 
 
 		 585 aa  130  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0525  Cl- channel voltage-gated family protein  26.02 
 
 		 579 aa  130  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.96 
 
 		 439 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  34.19 
 
 		 471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.10029 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  24.87 
 
 		 582 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  28.43 
 
 		 863 aa  128  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  29.09 
 
 		 533 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  27.97 
 
 		 593 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>