More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0490 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0490  voltage gated chloride channel family protein  100 
 
 
596 aa  1178    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.889673  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2161  chloride channel protein  58.33 
 
 
594 aa  637    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2374  Chloride channel core  60.74 
 
 
596 aa  685    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124913  decreased coverage  0.00191401 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0604  chloride channel core  89.93 
 
 
597 aa  1041    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2134  Chloride channel core  60.58 
 
 
596 aa  681    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262546  normal  0.105647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5810  Chloride channel core  59.29 
 
 
606 aa  617  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.688487  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3994  chloride channel core  58.05 
 
 
643 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0550665 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5245  chloride channel core  58.25 
 
 
606 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  decreased coverage  0.00444672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3006  Chloride channel core  55.2 
 
 
614 aa  598  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0264261  normal  0.0792273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2902  Chloride channel core  55.91 
 
 
614 aa  597  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452389  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2779  chloride channel core  55.87 
 
 
649 aa  596  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.674097  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3883  chloride channel core  52.08 
 
 
603 aa  535  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1483  Chloride channel core  50.51 
 
 
628 aa  514  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1634  Chloride channel core  53.01 
 
 
601 aa  505  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0200608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2747  CLC-type chloride channel protein  46.35 
 
 
595 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171436  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0191  chloride channel core  47.52 
 
 
635 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66054  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2859  Cl- channel, voltage-gated family protein  46.47 
 
 
606 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  42.27 
 
 
602 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4075  chloride channel core  46.17 
 
 
587 aa  433  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.480414  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1650  Chloride channel core  42.93 
 
 
604 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3739  chloride channel, core  46.52 
 
 
582 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2309  Chloride channel core  44.5 
 
 
590 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0529111 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4838  chloride channel, core  45.12 
 
 
584 aa  360  3e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0107  CBS  42.93 
 
 
579 aa  345  1e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.06 
 
 
582 aa  209  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  29.89 
 
 
615 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.38 
 
 
579 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.55 
 
 
636 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.38 
 
 
579 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.38 
 
 
579 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.06 
 
 
628 aa  171  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  27.24 
 
 
613 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.5 
 
 
598 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  28.22 
 
 
577 aa  162  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26 
 
 
589 aa  160  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.83 
 
 
589 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.83 
 
 
589 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.75 
 
 
591 aa  157  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  29.41 
 
 
470 aa  157  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  25.74 
 
 
614 aa  156  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.58 
 
 
591 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.38 
 
 
587 aa  154  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.55 
 
 
589 aa  153  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  28.32 
 
 
590 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.37 
 
 
593 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.17 
 
 
593 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  25.59 
 
 
669 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.31 
 
 
577 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.45 
 
 
591 aa  144  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  26.18 
 
 
608 aa  143  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  25.33 
 
 
627 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  27.21 
 
 
593 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  28.7 
 
 
543 aa  138  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1772  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.6 
 
 
585 aa  137  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  28.17 
 
 
597 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.73 
 
 
461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.81 
 
 
580 aa  134  5e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  30.89 
 
 
464 aa  134  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  30.89 
 
 
464 aa  134  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  26.73 
 
 
606 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  25.75 
 
 
624 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.09 
 
 
565 aa  128  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  30.28 
 
 
598 aa  127  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  24.72 
 
 
631 aa  126  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  27.23 
 
 
579 aa  123  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.35 
 
 
620 aa  123  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  28.08 
 
 
564 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  25.79 
 
 
613 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  25.09 
 
 
628 aa  122  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1534  Cl- channel, voltage gated  33.42 
 
 
527 aa  120  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.123029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  24.16 
 
 
617 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  28.01 
 
 
626 aa  118  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.47 
 
 
594 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.53 
 
 
426 aa  117  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  26.91 
 
 
569 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  24.94 
 
 
627 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  24.61 
 
 
640 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.24 
 
 
426 aa  113  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  29.23 
 
 
402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  27.69 
 
 
595 aa  111  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  27.74 
 
 
562 aa  111  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.7 
 
 
414 aa  111  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.24 
 
 
575 aa  111  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.65 
 
 
560 aa  110  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  24.37 
 
 
603 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  25.7 
 
 
625 aa  110  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.04 
 
 
598 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  25.82 
 
 
585 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  26.23 
 
 
586 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.54 
 
 
591 aa  107  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  22.7 
 
 
754 aa  107  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0525  Cl- channel voltage-gated family protein  26.08 
 
 
579 aa  105  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  28.82 
 
 
457 aa  104  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  25.8 
 
 
584 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  30.95 
 
 
897 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2439  chloride channel core protein  25.98 
 
 
589 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590865  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0552  Chloride channel core  22.64 
 
 
614 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2526  Chloride channel core  25.98 
 
 
589 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  24.19 
 
 
598 aa  100  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43785  predicted protein  27.16 
 
 
588 aa  99.4  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000378872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>