More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1979 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  100 
 
 		 426 aa  832    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  99.76 
 
 		 414 aa  801    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  80.24 
 
 		 426 aa  642    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01561  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  63.77 
 
 		 418 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01551  hypothetical protein  63.77 
 
 		 418 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1666  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  63.77 
 
 		 418 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1607  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  63.77 
 
 		 418 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1592  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  63.7 
 
 		 429 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0733959 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2038  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  63.77 
 
 		 418 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1800  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  63.77 
 
 		 418 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2303  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  63.77 
 
 		 418 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0264865 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2051  Chloride channel core  63.53 
 
 		 418 aa  437  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1779  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  63.53 
 
 		 418 aa  437  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1601  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  63.94 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.262233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1660  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  64.18 
 
 		 429 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1682  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  63.94 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.669275  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1849  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  64.01 
 
 		 417 aa  428  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  43.17 
 
 		 591 aa  270  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  43.26 
 
 		 577 aa  262  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  44.58 
 
 		 464 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  44.58 
 
 		 464 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  41.73 
 
 		 591 aa  253  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  44.58 
 
 		 461 aa  249  7e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  40.63 
 
 		 598 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  41.75 
 
 		 593 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  41.75 
 
 		 593 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  44.55 
 
 		 591 aa  244  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  42.07 
 
 		 628 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  42.07 
 
 		 636 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  42.07 
 
 		 579 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  42.07 
 
 		 579 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  42.07 
 
 		 579 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  41.5 
 
 		 589 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  41.26 
 
 		 589 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  41.26 
 
 		 589 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  44.61 
 
 		 471 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.10029 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  43.82 
 
 		 589 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  38.52 
 
 		 560 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0516  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  39.66 
 
 		 601 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132092  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3746  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.98 
 
 		 414 aa  171  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  30.12 
 
 		 595 aa  167  2.9999999999999998e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  27.8 
 
 		 613 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  33.49 
 
 		 615 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  32.4 
 
 		 669 aa  153  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  27.02 
 
 		 614 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  31.4 
 
 		 596 aa  149  7e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  31.67 
 
 		 608 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  28.67 
 
 		 606 aa  137  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  27.59 
 
 		 470 aa  137  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  29.57 
 
 		 456 aa  136  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.47 
 
 		 582 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  34.36 
 
 		 579 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  28.06 
 
 		 577 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.66 
 
 		 594 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2526  Chloride channel core  35.6 
 
 		 589 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2439  chloride channel core protein  35.22 
 
 		 589 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590865  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  29.85 
 
 		 569 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  31.52 
 
 		 598 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.38 
 
 		 587 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  29.7 
 
 		 602 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  30.9 
 
 		 597 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  32.27 
 
 		 859 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  29.4 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  27.38 
 
 		 462 aa  125  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  28.21 
 
 		 519 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  27.9 
 
 		 519 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2374  Chloride channel core  31.83 
 
 		 596 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124913  decreased coverage  0.00191401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  34.6 
 
 		 626 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  32.34 
 
 		 584 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  28.57 
 
 		 627 aa  119  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  27.49 
 
 		 631 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  35.05 
 
 		 586 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1650  Chloride channel core  31.22 
 
 		 604 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2134  Chloride channel core  31.53 
 
 		 596 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262546  normal  0.105647 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.84 
 
 		 580 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  29.97 
 
 		 563 aa  116  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  30.98 
 
 		 590 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  28.46 
 
 		 617 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.61 
 
 		 598 aa  116  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2747  CLC-type chloride channel protein  31.23 
 
 		 595 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171436  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  30.41 
 
 		 625 aa  113  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  30.67 
 
 		 510 aa  113  7.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  29.82 
 
 		 457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3883  chloride channel core  28.78 
 
 		 603 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2161  chloride channel protein  28.09 
 
 		 594 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  26.71 
 
 		 538 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  30.46 
 
 		 471 aa  109  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.25 
 
 		 612 aa  109  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  26.13 
 
 		 598 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  31.61 
 
 		 863 aa  106  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  30.39 
 
 		 593 aa  106  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4920  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.77 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  32.5 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  29.19 
 
 		 862 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.97 
 
 		 526 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  25.89 
 
 		 559 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  31.81 
 
 		 600 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_004310  BR0490  voltage gated chloride channel family protein  30.22 
 
 		 596 aa  103  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.889673  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  26.23 
 
 		 629 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  26.91 
 
 		 586 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>